MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_003361	GAA	2	6	518363	518368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840221
11003	NC_003361	GCT	2	6	518401	518406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840221
11004	NC_003361	GCA	2	6	518458	518463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840221
11005	NC_003361	TCT	2	6	518506	518511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840221
11006	NC_003361	TACCT	2	10	518541	518550	20 %	40 %	0 %	40 %	29840221
11007	NC_003361	AAG	2	6	518571	518576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840221
11008	NC_003361	GTAC	2	8	518614	518621	25 %	25 %	25 %	25 %	29840221
11009	NC_003361	ATCAT	2	10	518680	518689	40 %	40 %	0 %	20 %	29840221
11010	NC_003361	TAGA	2	8	518732	518739	50 %	25 %	25 %	0 %	29840221
11011	NC_003361	AGGG	2	8	518763	518770	25 %	0 %	75 %	0 %	29840221
11012	NC_003361	TGC	2	6	518805	518810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840221
11013	NC_003361	GCA	2	6	518818	518823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840221
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11015	NC_003361	T	6	6	518856	518861	0 %	100 %	0 %	0 %	29840221
11016	NC_003361	AAG	2	6	518883	518888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840221
11017	NC_003361	AAG	2	6	518953	518958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840221
11018	NC_003361	TGC	2	6	518973	518978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840221
11019	NC_003361	GAG	2	6	518985	518990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840221
11020	NC_003361	GAA	2	6	519019	519024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840221
11021	NC_003361	AGT	2	6	519066	519071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840221
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11023	NC_003361	AGT	2	6	519097	519102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840221
11024	NC_003361	GA	3	6	519113	519118	50 %	0 %	50 %	0 %	29840221
11025	NC_003361	GATA	2	8	519132	519139	50 %	25 %	25 %	0 %	29840221
11026	NC_003361	ACC	2	6	519204	519209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840221
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11028	NC_003361	TTG	2	6	519333	519338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840221
11029	NC_003361	ATCA	2	8	519342	519349	50 %	25 %	0 %	25 %	29840221
11030	NC_003361	GC	3	6	519355	519360	0 %	0 %	50 %	50 %	29840221
11031	NC_003361	GCA	2	6	519415	519420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840221
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11038	NC_003361	TTG	2	6	519611	519616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840221
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11053	NC_003361	GAC	2	6	520237	520242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840222
11054	NC_003361	TTCT	2	8	520329	520336	0 %	75 %	0 %	25 %	29840222
11055	NC_003361	A	7	7	520371	520377	100 %	0 %	0 %	0 %	29840222
11056	NC_003361	GA	3	6	520438	520443	50 %	0 %	50 %	0 %	29840222
11057	NC_003361	T	6	6	520476	520481	0 %	100 %	0 %	0 %	29840222
11058	NC_003361	AACGT	2	10	520482	520491	40 %	20 %	20 %	20 %	29840222
11059	NC_003361	T	6	6	520593	520598	0 %	100 %	0 %	0 %	29840222
11060	NC_003361	ACA	2	6	520638	520643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840222
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11063	NC_003361	GCTT	2	8	520767	520774	0 %	50 %	25 %	25 %	29840222
11064	NC_003361	GGAA	2	8	520865	520872	50 %	0 %	50 %	0 %	29840222
11065	NC_003361	T	6	6	520898	520903	0 %	100 %	0 %	0 %	29840222
11066	NC_003361	T	6	6	520942	520947	0 %	100 %	0 %	0 %	29840222
11067	NC_003361	AAT	2	6	520991	520996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_003361	AG	3	6	521029	521034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_003361	T	7	7	521088	521094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_003361	GCAT	2	8	522653	522660	25 %	25 %	25 %	25 %	29840224
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11100	NC_003361	ATCT	2	8	523064	523071	25 %	50 %	0 %	25 %	29840224
11101	NC_003361	GGGA	2	8	523122	523129	25 %	0 %	75 %	0 %	29840224
11102	NC_003361	ATCG	2	8	523140	523147	25 %	25 %	25 %	25 %	29840224
11103	NC_003361	AAG	2	6	523189	523194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840224
11104	NC_003361	A	7	7	523238	523244	100 %	0 %	0 %	0 %	29840224
11105	NC_003361	AGA	2	6	523265	523270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840224
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11107	NC_003361	TAC	2	6	523457	523462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11108	NC_003361	GTA	2	6	523499	523504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_003361	T	6	6	523612	523617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_003361	GGA	2	6	523630	523635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_003361	TTG	2	6	523638	523643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_003361	TAGG	2	8	523687	523694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_003361	T	6	6	523699	523704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_003361	CAA	2	6	523712	523717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_003361	T	8	8	523883	523890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_003361	TTC	2	6	523934	523939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_003361	CTA	2	6	523952	523957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11119	NC_003361	CTT	2	6	523967	523972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_003361	ATG	2	6	523996	524001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_003361	GAT	2	6	524028	524033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11123	NC_003361	A	6	6	524094	524099	100 %	0 %	0 %	0 %	29840225
11124	NC_003361	CTG	2	6	524205	524210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840225
11125	NC_003361	ATA	2	6	524228	524233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840225
11126	NC_003361	T	6	6	524372	524377	0 %	100 %	0 %	0 %	29840225
11127	NC_003361	ATA	2	6	524396	524401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840225
11128	NC_003361	GAT	2	6	524418	524423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840226
11129	NC_003361	ACCT	2	8	524452	524459	25 %	25 %	0 %	50 %	29840226
11130	NC_003361	TAA	2	6	524479	524484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840226
11131	NC_003361	CTT	2	6	524511	524516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11132	NC_003361	TCT	2	6	524522	524527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11133	NC_003361	ACA	2	6	524582	524587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11134	NC_003361	TCA	2	6	524727	524732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840226
11135	NC_003361	ATG	2	6	524762	524767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840226
11136	NC_003361	TAA	2	6	524799	524804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840226
11137	NC_003361	AAT	2	6	524842	524847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840226
11138	NC_003361	TGC	2	6	524860	524865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840226
11139	NC_003361	ACTT	2	8	524923	524930	25 %	50 %	0 %	25 %	29840226
11140	NC_003361	ATA	2	6	524996	525001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840226
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11142	NC_003361	TCT	2	6	525051	525056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11143	NC_003361	GCAAA	2	10	525057	525066	60 %	0 %	20 %	20 %	29840226
11144	NC_003361	T	6	6	525111	525116	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11145	NC_003361	AAC	2	6	525124	525129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11146	NC_003361	GCGG	2	8	525364	525371	0 %	0 %	75 %	25 %	29840226
11147	NC_003361	TAG	2	6	525421	525426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840226
11148	NC_003361	CAA	2	6	525573	525578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11149	NC_003361	TCA	2	6	525638	525643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840226
11150	NC_003361	AAC	2	6	525658	525663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11151	NC_003361	AAC	2	6	525756	525761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11152	NC_003361	GCT	2	6	525803	525808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840226
11153	NC_003361	TCAA	2	8	525830	525837	50 %	25 %	0 %	25 %	29840226
11154	NC_003361	GTT	2	6	526019	526024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840226
11155	NC_003361	TGAA	2	8	526064	526071	50 %	25 %	25 %	0 %	29840226
11156	NC_003361	TCT	2	6	526074	526079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11157	NC_003361	CTG	2	6	526110	526115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840226
11158	NC_003361	TTC	2	6	526177	526182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11159	NC_003361	T	6	6	526189	526194	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11160	NC_003361	T	6	6	526197	526202	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11161	NC_003361	T	7	7	526210	526216	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11162	NC_003361	ATC	3	9	526225	526233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840226
11163	NC_003361	ACT	2	6	526234	526239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840226
11164	NC_003361	T	6	6	526324	526329	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11165	NC_003361	TTGG	2	8	526367	526374	0 %	50 %	50 %	0 %	29840226
11166	NC_003361	ATG	2	6	526378	526383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840226
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11168	NC_003361	GTT	2	6	526427	526432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840226
11169	NC_003361	T	6	6	526437	526442	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11170	NC_003361	TCT	2	6	526460	526465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11171	NC_003361	T	6	6	526465	526470	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11172	NC_003361	GAT	2	6	526497	526502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840226
11173	NC_003361	T	6	6	526564	526569	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11174	NC_003361	T	6	6	526588	526593	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11175	NC_003361	ACT	2	6	526616	526621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840226
11176	NC_003361	TTC	2	6	526627	526632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
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11178	NC_003361	CTT	2	6	526695	526700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11179	NC_003361	AGG	2	6	526750	526755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840226
11180	NC_003361	ATGA	2	8	526788	526795	50 %	25 %	25 %	0 %	29840226
11181	NC_003361	CAG	2	6	526827	526832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840226
11182	NC_003361	ACA	2	6	526868	526873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840226
11183	NC_003361	TTC	2	6	526880	526885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840226
11184	NC_003361	T	6	6	526905	526910	0 %	100 %	0 %	0 %	29840226
11185	NC_003361	CCTG	2	8	526961	526968	0 %	25 %	25 %	50 %	29840226
11186	NC_003361	CAG	2	6	526998	527003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840226
11187	NC_003361	TAA	2	6	527147	527152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840227
11188	NC_003361	CAAC	2	8	527197	527204	50 %	0 %	0 %	50 %	29840227
11189	NC_003361	TAAT	2	8	527341	527348	50 %	50 %	0 %	0 %	29840227
11190	NC_003361	CAT	2	6	527392	527397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840227
11191	NC_003361	TCT	2	6	527424	527429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11192	NC_003361	GCAAA	2	10	527459	527468	60 %	0 %	20 %	20 %	29840227
11193	NC_003361	TAA	2	6	527474	527479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840227
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11196	NC_003361	CTT	2	6	527671	527676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11197	NC_003361	CTT	2	6	527689	527694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11198	NC_003361	GTT	2	6	527704	527709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840227
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11200	NC_003361	CTT	2	6	527773	527778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11201	NC_003361	TAA	2	6	527780	527785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840227
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11204	NC_003361	GAC	2	6	527903	527908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840227
11205	NC_003361	AGAA	2	8	527912	527919	75 %	0 %	25 %	0 %	29840227
11206	NC_003361	TTC	2	6	527942	527947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11207	NC_003361	GCA	2	6	528009	528014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840227
11208	NC_003361	TTC	2	6	528016	528021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11209	NC_003361	TTTC	2	8	528139	528146	0 %	75 %	0 %	25 %	29840227
11210	NC_003361	AGA	2	6	528151	528156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840227
11211	NC_003361	CAT	2	6	528202	528207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840227
11212	NC_003361	T	8	8	528217	528224	0 %	100 %	0 %	0 %	29840227
11213	NC_003361	TTTTCC	2	12	528282	528293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
11214	NC_003361	CTC	2	6	528333	528338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11215	NC_003361	ATT	2	6	528420	528425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840228
11216	NC_003361	T	6	6	528430	528435	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11217	NC_003361	ATC	2	6	528457	528462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840228
11218	NC_003361	ATT	2	6	528472	528477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840228
11219	NC_003361	GTT	2	6	528501	528506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840228
11220	NC_003361	TGA	2	6	528564	528569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840228
11221	NC_003361	ATA	2	6	528599	528604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840228
11222	NC_003361	TAC	2	6	528709	528714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840228
11223	NC_003361	TTC	2	6	528745	528750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840228
11224	NC_003361	T	7	7	528798	528804	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11225	NC_003361	AG	3	6	528820	528825	50 %	0 %	50 %	0 %	29840228
11226	NC_003361	T	6	6	528850	528855	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11227	NC_003361	T	7	7	528880	528886	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11228	NC_003361	CAA	2	6	528939	528944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
11229	NC_003361	TCTG	2	8	529034	529041	0 %	50 %	25 %	25 %	29840228
11230	NC_003361	ATAG	2	8	529079	529086	50 %	25 %	25 %	0 %	29840228
11231	NC_003361	CAA	2	6	529134	529139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
11232	NC_003361	CTT	2	6	529188	529193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840228
11233	NC_003361	CAA	2	6	529239	529244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
11234	NC_003361	GGA	2	6	529256	529261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840228
11235	NC_003361	T	6	6	529264	529269	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11236	NC_003361	AAT	2	6	529348	529353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840228
11237	NC_003361	TTGA	2	8	529366	529373	25 %	50 %	25 %	0 %	29840228
11238	NC_003361	GATG	2	8	529388	529395	25 %	25 %	50 %	0 %	29840228
11239	NC_003361	CATGT	2	10	529409	529418	20 %	40 %	20 %	20 %	29840228
11240	NC_003361	CGA	2	6	529496	529501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840228
11241	NC_003361	T	6	6	529537	529542	0 %	100 %	0 %	0 %	29840228
11242	NC_003361	CTT	2	6	529571	529576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840228
11243	NC_003361	ACA	3	9	529580	529588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
11244	NC_003361	TCT	2	6	529591	529596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840228
11245	NC_003361	CAA	2	6	529713	529718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
11246	NC_003361	ACC	2	6	529723	529728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840228
11247	NC_003361	CTT	2	6	529767	529772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840228
11248	NC_003361	AAC	2	6	529831	529836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840228
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11496	NC_003361	TAA	2	6	541157	541162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840237
11497	NC_003361	CTT	2	6	541181	541186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840237
11498	NC_003361	T	6	6	541356	541361	0 %	100 %	0 %	0 %	29840238
11499	NC_003361	AGG	2	6	541456	541461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840238
11500	NC_003361	AGT	2	6	541527	541532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840238

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