MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_003361	AAAG	2	8	329380	329387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_003361	AGG	2	6	329434	329439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_003361	GTT	2	6	329444	329449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_003361	AG	4	8	329452	329459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_003361	TCC	2	6	329482	329487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_003361	AGA	2	6	329509	329514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_003361	TGA	2	6	329570	329575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_003361	GAT	2	6	329587	329592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_003361	TTG	2	6	329613	329618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_003361	GATA	2	8	329694	329701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_003361	AGGG	2	8	329755	329762	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_003361	TGT	3	9	329831	329839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_003361	TCA	2	6	329876	329881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_003361	ATT	2	6	329882	329887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_003361	GT	3	6	329975	329980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_003361	TGT	2	6	329983	329988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_003361	CTTT	2	8	330072	330079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_003361	GATA	2	8	330124	330131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_003361	GAA	2	6	330304	330309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_003361	AG	3	6	330313	330318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_003361	CAA	2	6	330369	330374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_003361	GTT	2	6	330375	330380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_003361	AGC	2	6	330400	330405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_003361	CTT	2	6	330513	330518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_003361	AGAGA	2	10	330622	330631	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_003361	TCC	2	6	330754	330759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_003361	AG	3	6	330764	330769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_003361	GGTT	2	8	330813	330820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_003361	GCT	2	6	330845	330850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_003361	TCT	2	6	330859	330864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_003361	TGC	2	6	330964	330969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_003361	TGC	2	6	330979	330984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_003361	AGT	2	6	331003	331008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_003361	CCA	2	6	331034	331039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_003361	ATA	2	6	331043	331048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_003361	AG	3	6	331127	331132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_003361	TC	3	6	331194	331199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_003361	CAT	2	6	331218	331223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_003361	AGT	2	6	331228	331233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_003361	GCA	2	6	331247	331252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_003361	TGC	2	6	331279	331284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_003361	GCA	2	6	331295	331300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_003361	TTA	2	6	331314	331319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_003361	AAG	2	6	331320	331325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_003361	GAG	2	6	331332	331337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_003361	TTG	2	6	331492	331497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_003361	AGC	2	6	331528	331533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_003361	GC	3	6	331542	331547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7049	NC_003361	TGA	2	6	331699	331704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_003361	CCA	2	6	331727	331732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_003361	T	6	6	331747	331752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_003361	CCA	2	6	331766	331771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_003361	GAG	2	6	331781	331786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_003361	T	6	6	331866	331871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_003361	TAA	2	6	331897	331902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_003361	TA	3	6	331906	331911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_003361	ACT	2	6	331981	331986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7060	NC_003361	AGC	2	6	332071	332076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_003361	CCA	2	6	332093	332098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_003361	ACT	2	6	332156	332161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_003361	ACA	2	6	332183	332188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_003361	GTT	3	9	332251	332259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_003361	GTT	2	6	332281	332286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_003361	GCC	2	6	332302	332307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_003361	GTT	2	6	332344	332349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_003361	CAG	2	6	332406	332411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7071	NC_003361	GAA	2	6	332642	332647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7073	NC_003361	GTTTG	2	10	332726	332735	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_003361	TGA	2	6	333402	333407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_003361	GGT	2	6	333513	333518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_003361	AG	3	6	333951	333956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7109	NC_003361	AG	3	6	334199	334204	50 %	0 %	50 %	0 %	29840052
7110	NC_003361	T	6	6	334278	334283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_003361	TAA	2	6	334290	334295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_003361	T	9	9	334298	334306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_003361	AAG	2	6	334363	334368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_003361	T	6	6	334369	334374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7120	NC_003361	GAG	2	6	334666	334671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840053
7121	NC_003361	AATAG	2	10	334838	334847	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_003361	AGA	2	6	334852	334857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_003361	TTTC	2	8	334874	334881	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_003361	GCT	2	6	334910	334915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7126	NC_003361	ATT	2	6	335096	335101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_003361	ACC	2	6	335141	335146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_003361	TCCA	2	8	335160	335167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_003361	A	6	6	335170	335175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_003361	GGA	2	6	335213	335218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_003361	GCT	2	6	335225	335230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7133	NC_003361	GTT	2	6	335309	335314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_003361	TC	3	6	335340	335345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7135	NC_003361	TGT	2	6	335401	335406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7143	NC_003361	CTG	2	6	335682	335687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7253	NC_003361	AGGTTG	2	12	342162	342173	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840059
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7257	NC_003361	CGC	2	6	342426	342431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29840060
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