MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	215918857
2	NC_002971	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653365
3	NC_002971	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653365
4	NC_002971	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	29653365
5	NC_002971	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653365
6	NC_002971	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	29653365
7	NC_002971	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653365
8	NC_002971	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	29653365
9	NC_002971	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653365
10	NC_002971	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653365
11	NC_002971	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653365
12	NC_002971	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	29653365
13	NC_002971	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653365
14	NC_002971	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	29653365
15	NC_002971	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653365
16	NC_002971	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653365
17	NC_002971	T	6	6	806	811	0 %	100 %	0 %	0 %	29653365
18	NC_002971	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	29653365
19	NC_002971	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653365
20	NC_002971	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653365
21	NC_002971	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653365
22	NC_002971	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	29653365
23	NC_002971	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	29653365
24	NC_002971	ATGGCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29653365
25	NC_002971	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	29653365
26	NC_002971	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653365
27	NC_002971	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653365
28	NC_002971	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002971	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	29653366
30	NC_002971	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
31	NC_002971	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	29653366
32	NC_002971	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653366
33	NC_002971	A	6	6	1925	1930	100 %	0 %	0 %	0 %	29653366
34	NC_002971	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653366
35	NC_002971	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
36	NC_002971	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	29653366
37	NC_002971	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653366
38	NC_002971	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
39	NC_002971	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653366
40	NC_002971	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653366
41	NC_002971	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653366
42	NC_002971	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	29653366
43	NC_002971	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653366
44	NC_002971	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	29653366
45	NC_002971	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
46	NC_002971	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653366
47	NC_002971	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653366
48	NC_002971	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653366
49	NC_002971	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653366
50	NC_002971	T	9	9	2834	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	215918858
51	NC_002971	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	215918858
52	NC_002971	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918858
53	NC_002971	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918858
54	NC_002971	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
55	NC_002971	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	215918858
56	NC_002971	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	215918858
57	NC_002971	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	215918858
58	NC_002971	T	7	7	3194	3200	0 %	100 %	0 %	0 %	215918858
59	NC_002971	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918858
60	NC_002971	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	215918858
61	NC_002971	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
62	NC_002971	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918858
63	NC_002971	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	215918858
64	NC_002971	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	215918858
65	NC_002971	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	215918858
66	NC_002971	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918858
67	NC_002971	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918858
68	NC_002971	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	215918858
69	NC_002971	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918858
70	NC_002971	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002971	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002971	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002971	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002971	TGAGCG	2	12	4129	4140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	215918859
75	NC_002971	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
76	NC_002971	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
77	NC_002971	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
78	NC_002971	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
79	NC_002971	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
80	NC_002971	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
81	NC_002971	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918859
82	NC_002971	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
83	NC_002971	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
84	NC_002971	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
85	NC_002971	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918859
86	NC_002971	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
87	NC_002971	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	215918859
88	NC_002971	A	7	7	4830	4836	100 %	0 %	0 %	0 %	215918859
89	NC_002971	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	215918859
90	NC_002971	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	215918859
91	NC_002971	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918859
92	NC_002971	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
93	NC_002971	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	215918859
94	NC_002971	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918859
95	NC_002971	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	215918859
96	NC_002971	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918859
97	NC_002971	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
98	NC_002971	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918859
99	NC_002971	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
100	NC_002971	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
101	NC_002971	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918859
102	NC_002971	CCGACG	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	215918859
103	NC_002971	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	215918859
104	NC_002971	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
105	NC_002971	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
106	NC_002971	A	7	7	5748	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	215918859
107	NC_002971	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918859
108	NC_002971	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
109	NC_002971	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
110	NC_002971	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918859
111	NC_002971	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	215918859
112	NC_002971	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918859
113	NC_002971	A	6	6	6093	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	215918859
114	NC_002971	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
115	NC_002971	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918859
116	NC_002971	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
117	NC_002971	A	6	6	6330	6335	100 %	0 %	0 %	0 %	215918859
118	NC_002971	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
119	NC_002971	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
120	NC_002971	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918859
121	NC_002971	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002971	CAA	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002971	ACCC	2	8	6688	6695	25 %	0 %	0 %	75 %	215918860
124	NC_002971	A	7	7	6741	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	215918860
125	NC_002971	TG	3	6	6811	6816	0 %	50 %	50 %	0 %	215918860
126	NC_002971	TGA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918860
127	NC_002971	GTAT	2	8	6869	6876	25 %	50 %	25 %	0 %	215918860
128	NC_002971	GTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918860
129	NC_002971	GGA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918860
130	NC_002971	GCA	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918860
131	NC_002971	AAC	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918860
132	NC_002971	GTT	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918860
133	NC_002971	GTG	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918860
134	NC_002971	AGCG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	50 %	25 %	215918860
135	NC_002971	TTGT	2	8	7304	7311	0 %	75 %	25 %	0 %	215918860
136	NC_002971	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918860
137	NC_002971	GAG	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918860
138	NC_002971	GGGT	2	8	7417	7424	0 %	25 %	75 %	0 %	215918860
139	NC_002971	TCA	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918860
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262	NC_002971	AGT	2	6	12291	12296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_002971	T	6	6	12597	12602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_002971	GAA	2	6	12715	12720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_002971	T	7	7	12815	12821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_002971	CTG	2	6	12840	12845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_002971	TTTTCT	2	12	12922	12933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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400	NC_002971	AAAT	2	8	18504	18511	75 %	25 %	0 %	0 %	29653385
401	NC_002971	A	7	7	18552	18558	100 %	0 %	0 %	0 %	29653385
402	NC_002971	T	6	6	18600	18605	0 %	100 %	0 %	0 %	29653385
403	NC_002971	AATC	2	8	18621	18628	50 %	25 %	0 %	25 %	29653385
404	NC_002971	A	6	6	18655	18660	100 %	0 %	0 %	0 %	29653385
405	NC_002971	ATT	2	6	18670	18675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653385
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