MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_002971	T	6	6	1598694	1598699	0 %	100 %	0 %	0 %	29654951
35002	NC_002971	GGC	2	6	1598707	1598712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29654951
35003	NC_002971	CGT	2	6	1598724	1598729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654951
35004	NC_002971	AGC	2	6	1598763	1598768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654951
35005	NC_002971	GTC	2	6	1598845	1598850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654951
35006	NC_002971	CGCC	2	8	1598852	1598859	0 %	0 %	25 %	75 %	29654951
35007	NC_002971	GAA	2	6	1598920	1598925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654951
35008	NC_002971	CCAT	2	8	1598943	1598950	25 %	25 %	0 %	50 %	29654951
35009	NC_002971	TCT	2	6	1598960	1598965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654951
35010	NC_002971	ATA	2	6	1598979	1598984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654951
35011	NC_002971	GGCCG	2	10	1599003	1599012	0 %	0 %	60 %	40 %	29654951
35012	NC_002971	CCCAA	2	10	1599151	1599160	40 %	0 %	0 %	60 %	29654951
35013	NC_002971	ATC	2	6	1599178	1599183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654951
35014	NC_002971	CACC	3	12	1599242	1599253	25 %	0 %	0 %	75 %	29654951
35015	NC_002971	AATC	2	8	1599404	1599411	50 %	25 %	0 %	25 %	29654951
35016	NC_002971	ATAA	2	8	1599508	1599515	75 %	25 %	0 %	0 %	29654951
35017	NC_002971	CACC	2	8	1599536	1599543	25 %	0 %	0 %	75 %	29654951
35018	NC_002971	T	7	7	1599566	1599572	0 %	100 %	0 %	0 %	29654951
35019	NC_002971	GCT	2	6	1599573	1599578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654951
35020	NC_002971	AT	3	6	1599619	1599624	50 %	50 %	0 %	0 %	215919225
35021	NC_002971	ACA	2	6	1599768	1599773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919225
35022	NC_002971	TCA	2	6	1599788	1599793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919225
35023	NC_002971	AAT	2	6	1599904	1599909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654953
35024	NC_002971	GAT	2	6	1599962	1599967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654953
35025	NC_002971	AAT	2	6	1599974	1599979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654953
35026	NC_002971	GCG	2	6	1600005	1600010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35027	NC_002971	TGA	2	6	1600166	1600171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654954
35028	NC_002971	AATGA	2	10	1600234	1600243	60 %	20 %	20 %	0 %	29654954
35029	NC_002971	CTG	3	9	1600261	1600269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654954
35030	NC_002971	GAT	2	6	1600276	1600281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654954
35031	NC_002971	ATT	2	6	1600291	1600296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654954
35032	NC_002971	CGT	2	6	1600299	1600304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654954
35033	NC_002971	AGA	2	6	1600311	1600316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654954
35034	NC_002971	GTTA	2	8	1600377	1600384	25 %	50 %	25 %	0 %	29654954
35035	NC_002971	ATC	2	6	1600501	1600506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654954
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35037	NC_002971	TAC	2	6	1600548	1600553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654954
35038	NC_002971	GTC	2	6	1600565	1600570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654954
35039	NC_002971	TTC	2	6	1600671	1600676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654955
35040	NC_002971	TGA	2	6	1600699	1600704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654955
35041	NC_002971	A	7	7	1600704	1600710	100 %	0 %	0 %	0 %	29654955
35042	NC_002971	CGAT	2	8	1600725	1600732	25 %	25 %	25 %	25 %	29654955
35043	NC_002971	ATC	2	6	1600737	1600742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654955
35044	NC_002971	CGC	2	6	1600753	1600758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29654955
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35046	NC_002971	TCGC	2	8	1600943	1600950	0 %	25 %	25 %	50 %	29654955
35047	NC_002971	AGAAAC	2	12	1601026	1601037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	29654955
35048	NC_002971	T	6	6	1601106	1601111	0 %	100 %	0 %	0 %	29654955
35049	NC_002971	ATG	2	6	1601127	1601132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654955
35050	NC_002971	TAT	2	6	1601156	1601161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654955
35051	NC_002971	T	6	6	1601288	1601293	0 %	100 %	0 %	0 %	29654955
35052	NC_002971	CCT	2	6	1601312	1601317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29654955
35053	NC_002971	TTTC	2	8	1601426	1601433	0 %	75 %	0 %	25 %	29654955
35054	NC_002971	CCTT	2	8	1601434	1601441	0 %	50 %	0 %	50 %	29654955
35055	NC_002971	A	7	7	1601481	1601487	100 %	0 %	0 %	0 %	29654955
35056	NC_002971	ATT	2	6	1601800	1601805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654955
35057	NC_002971	ACG	2	6	1601884	1601889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654955
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35060	NC_002971	AGAA	2	8	1601986	1601993	75 %	0 %	25 %	0 %	29654955
35061	NC_002971	TAA	2	6	1602019	1602024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654955
35062	NC_002971	GCC	2	6	1602106	1602111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29654955
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35064	NC_002971	TTA	2	6	1602247	1602252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654955
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35068	NC_002971	TATTT	2	10	1602372	1602381	20 %	80 %	0 %	0 %	29654955
35069	NC_002971	AAC	2	6	1602420	1602425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35070	NC_002971	ATAG	2	8	1602480	1602487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35071	NC_002971	A	7	7	1602494	1602500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35072	NC_002971	A	6	6	1602586	1602591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35073	NC_002971	AAG	2	6	1602612	1602617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35078	NC_002971	AATC	2	8	1602755	1602762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35079	NC_002971	CT	3	6	1602770	1602775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35080	NC_002971	A	8	8	1602777	1602784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35081	NC_002971	GCAAAA	2	12	1602790	1602801	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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35086	NC_002971	TAT	2	6	1602937	1602942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35087	NC_002971	TA	3	6	1603013	1603018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35088	NC_002971	GAA	2	6	1603097	1603102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35089	NC_002971	T	7	7	1603106	1603112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35090	NC_002971	T	6	6	1603153	1603158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35091	NC_002971	T	6	6	1603205	1603210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35092	NC_002971	CGG	2	6	1603216	1603221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35093	NC_002971	AAG	2	6	1603232	1603237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35095	NC_002971	TTA	2	6	1603308	1603313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35096	NC_002971	GTA	2	6	1603320	1603325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35097	NC_002971	TC	3	6	1603341	1603346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35098	NC_002971	ATT	2	6	1603364	1603369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35099	NC_002971	TGT	2	6	1603411	1603416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35101	NC_002971	T	6	6	1603586	1603591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35102	NC_002971	AATA	2	8	1603621	1603628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35103	NC_002971	CAT	2	6	1603726	1603731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35105	NC_002971	CG	3	6	1603750	1603755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35106	NC_002971	GCC	2	6	1603766	1603771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35107	NC_002971	GCC	2	6	1603826	1603831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35108	NC_002971	CAT	2	6	1603834	1603839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35109	NC_002971	A	6	6	1603887	1603892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35110	NC_002971	CTT	2	6	1604001	1604006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35111	NC_002971	T	6	6	1604139	1604144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35112	NC_002971	CGG	2	6	1604231	1604236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35113	NC_002971	AGCGA	2	10	1604285	1604294	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35114	NC_002971	TCGCT	2	10	1604334	1604343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35115	NC_002971	T	6	6	1604389	1604394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35117	NC_002971	TGC	2	6	1604457	1604462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654959
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35119	NC_002971	ATA	2	6	1604754	1604759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654959
35120	NC_002971	CGG	2	6	1604760	1604765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29654959
35121	NC_002971	TCT	2	6	1604802	1604807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654959
35122	NC_002971	CTT	2	6	1604827	1604832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654959
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