MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_002971	CTC	2	6	829408	829413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29654202
18003	NC_002971	CTC	2	6	829423	829428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29654202
18004	NC_002971	AAC	2	6	829434	829439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654202
18005	NC_002971	T	6	6	829516	829521	0 %	100 %	0 %	0 %	29654202
18006	NC_002971	TTC	2	6	829633	829638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654202
18007	NC_002971	ATG	2	6	829656	829661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654202
18008	NC_002971	T	6	6	829703	829708	0 %	100 %	0 %	0 %	29654202
18009	NC_002971	A	6	6	829725	829730	100 %	0 %	0 %	0 %	29654202
18010	NC_002971	GCA	2	6	829815	829820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654202
18011	NC_002971	ACC	2	6	829834	829839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29654202
18012	NC_002971	CA	3	6	829846	829851	50 %	0 %	0 %	50 %	29654202
18013	NC_002971	AGCC	2	8	829972	829979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_002971	ATC	3	9	830037	830045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_002971	CAG	2	6	830057	830062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_002971	T	6	6	830085	830090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_002971	TTG	2	6	830146	830151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654203
18018	NC_002971	T	7	7	830186	830192	0 %	100 %	0 %	0 %	29654203
18019	NC_002971	A	8	8	830214	830221	100 %	0 %	0 %	0 %	29654203
18020	NC_002971	AATAA	2	10	830229	830238	80 %	20 %	0 %	0 %	29654203
18021	NC_002971	AAT	2	6	830245	830250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654203
18022	NC_002971	A	8	8	830268	830275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_002971	CGC	2	6	830281	830286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_002971	CAA	2	6	830391	830396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_002971	TTA	2	6	830405	830410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_002971	A	6	6	830420	830425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_002971	CAG	2	6	830443	830448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_002971	GAT	2	6	830450	830455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_002971	TAT	2	6	830472	830477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_002971	ATT	2	6	830527	830532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_002971	CAAA	2	8	830582	830589	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18032	NC_002971	TC	3	6	830643	830648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18033	NC_002971	T	6	6	830654	830659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_002971	ATG	2	6	830679	830684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_002971	AGCA	2	8	830697	830704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18036	NC_002971	GCA	2	6	830717	830722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_002971	GCT	2	6	830788	830793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_002971	AGG	2	6	830801	830806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_002971	CTC	2	6	830902	830907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18040	NC_002971	TGT	2	6	831004	831009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_002971	GT	3	6	831008	831013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_002971	TGG	2	6	831014	831019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_002971	ACA	2	6	831045	831050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_002971	TCC	2	6	831057	831062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18045	NC_002971	CAG	3	9	831075	831083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_002971	GTG	2	6	831084	831089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_002971	CAA	2	6	831129	831134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_002971	AGA	2	6	831139	831144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_002971	GAAA	2	8	831228	831235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_002971	A	6	6	831239	831244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_002971	GAA	2	6	831258	831263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_002971	AAT	2	6	831312	831317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_002971	ATC	2	6	831344	831349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_002971	CTA	2	6	831472	831477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919062
18055	NC_002971	GAA	2	6	831529	831534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919062
18056	NC_002971	TTA	2	6	831535	831540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919062
18057	NC_002971	AAG	2	6	831569	831574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919062
18058	NC_002971	GAA	2	6	831592	831597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919062
18059	NC_002971	TC	3	6	831637	831642	0 %	50 %	0 %	50 %	215919062
18060	NC_002971	CTT	2	6	831754	831759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919062
18061	NC_002971	TTC	2	6	831863	831868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919062
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18063	NC_002971	T	7	7	831952	831958	0 %	100 %	0 %	0 %	215919062
18064	NC_002971	CCAC	2	8	832100	832107	25 %	0 %	0 %	75 %	215919062
18065	NC_002971	TA	4	8	832184	832191	50 %	50 %	0 %	0 %	215919062
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18067	NC_002971	A	7	7	832273	832279	100 %	0 %	0 %	0 %	215919062
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18073	NC_002971	GAAA	2	8	832549	832556	75 %	0 %	25 %	0 %	215919062
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18077	NC_002971	TCT	2	6	832654	832659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919062
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18082	NC_002971	CATTG	2	10	832945	832954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18083	NC_002971	TTG	2	6	832965	832970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_002971	ACCT	2	8	833047	833054	25 %	25 %	0 %	50 %	29654207
18085	NC_002971	GCTT	2	8	833083	833090	0 %	50 %	25 %	25 %	29654207
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18093	NC_002971	TATT	2	8	833635	833642	25 %	75 %	0 %	0 %	29654207
18094	NC_002971	T	6	6	833648	833653	0 %	100 %	0 %	0 %	29654207
18095	NC_002971	A	7	7	833687	833693	100 %	0 %	0 %	0 %	29654207
18096	NC_002971	ATT	2	6	833704	833709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654207
18097	NC_002971	GTAAT	3	15	833726	833740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_002971	A	7	7	833781	833787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_002971	A	6	6	833801	833806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_002971	CAA	2	6	833839	833844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18101	NC_002971	TTC	2	6	833851	833856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_002971	ATC	3	9	833863	833871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_002971	TTG	2	6	833973	833978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_002971	GACAT	2	10	833998	834007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18105	NC_002971	TAA	2	6	834023	834028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_002971	GGTT	2	8	834035	834042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18107	NC_002971	TGA	2	6	834065	834070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_002971	TGCC	2	8	834121	834128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18109	NC_002971	ATA	2	6	834173	834178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_002971	T	6	6	834234	834239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_002971	GAT	2	6	834261	834266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_002971	AT	3	6	834265	834270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_002971	TCA	2	6	834311	834316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_002971	CCA	2	6	834331	834336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18115	NC_002971	ATA	2	6	834373	834378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_002971	GAT	2	6	834441	834446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_002971	TTG	2	6	834475	834480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_002971	TCA	2	6	834620	834625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_002971	GCAA	2	8	834628	834635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18120	NC_002971	GTTA	2	8	834697	834704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_002971	T	7	7	834772	834778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_002971	TTC	2	6	834790	834795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_002971	ATG	2	6	834851	834856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_002971	CTTT	2	8	834861	834868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18125	NC_002971	GT	3	6	835059	835064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_002971	ATGTC	2	10	835070	835079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18127	NC_002971	T	6	6	835111	835116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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