MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_002971	CT	3	6	602957	602962	0 %	50 %	0 %	50 %	29653997
13003	NC_002971	TCAT	2	8	603011	603018	25 %	50 %	0 %	25 %	29653997
13004	NC_002971	CTTT	2	8	603054	603061	0 %	75 %	0 %	25 %	29653997
13005	NC_002971	GAGC	2	8	603063	603070	25 %	0 %	50 %	25 %	29653997
13006	NC_002971	GCG	2	6	603071	603076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653997
13007	NC_002971	TGA	2	6	603089	603094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653997
13008	NC_002971	AAT	2	6	603179	603184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653997
13009	NC_002971	TTTG	2	8	603189	603196	0 %	75 %	25 %	0 %	29653997
13010	NC_002971	GTCA	2	8	603223	603230	25 %	25 %	25 %	25 %	29653997
13011	NC_002971	TGC	2	6	603248	603253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653997
13012	NC_002971	ATG	2	6	603306	603311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653997
13013	NC_002971	CTT	2	6	603345	603350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653997
13014	NC_002971	GCA	2	6	603405	603410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653997
13015	NC_002971	GAG	2	6	603432	603437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653997
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13019	NC_002971	AAG	2	6	603664	603669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653997
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13040	NC_002971	TAC	2	6	604626	604631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653998
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13043	NC_002971	TTC	2	6	604809	604814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_002971	AGTTA	2	10	604981	604990	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_002971	TGAA	2	8	604998	605005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13121	NC_002971	AAATT	2	10	608376	608385	60 %	40 %	0 %	0 %	29654004
13122	NC_002971	GCA	2	6	608415	608420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654004
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13248	NC_002971	GCC	2	6	614016	614021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29654010
13249	NC_002971	GCA	2	6	614080	614085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654010
13250	NC_002971	TTG	2	6	614144	614149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654010
13251	NC_002971	GAG	2	6	614195	614200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29654010
13252	NC_002971	TCA	2	6	614317	614322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654010
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13255	NC_002971	TCA	2	6	614365	614370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654010
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13290	NC_002971	T	7	7	616048	616054	0 %	100 %	0 %	0 %	215919016
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13314	NC_002971	TCA	2	6	616933	616938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654013
13315	NC_002971	GAGC	2	8	616976	616983	25 %	0 %	50 %	25 %	29654013
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13317	NC_002971	GTTG	2	8	617040	617047	0 %	50 %	50 %	0 %	29654013
13318	NC_002971	AT	3	6	617059	617064	50 %	50 %	0 %	0 %	29654013
13319	NC_002971	GTA	2	6	617187	617192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13320	NC_002971	AATT	2	8	617202	617209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13321	NC_002971	T	11	11	617272	617282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13322	NC_002971	ATT	2	6	617326	617331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13351	NC_002971	A	6	6	618691	618696	100 %	0 %	0 %	0 %	215919017
13352	NC_002971	CTT	2	6	618710	618715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919017
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13356	NC_002971	GCA	2	6	619030	619035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215919017
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13358	NC_002971	TGG	2	6	619113	619118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215919017
13359	NC_002971	AT	3	6	619128	619133	50 %	50 %	0 %	0 %	215919017
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13362	NC_002971	ATAAA	2	10	619377	619386	80 %	20 %	0 %	0 %	215919017
13363	NC_002971	GA	3	6	619428	619433	50 %	0 %	50 %	0 %	29654016
13364	NC_002971	AAAGC	2	10	619506	619515	60 %	0 %	20 %	20 %	29654016
13365	NC_002971	TGC	2	6	619597	619602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654016
13366	NC_002971	AGC	2	6	619609	619614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654016
13367	NC_002971	AT	3	6	619711	619716	50 %	50 %	0 %	0 %	29654016
13368	NC_002971	GGT	2	6	619721	619726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29654016
13369	NC_002971	GAGGAA	2	12	619745	619756	50 %	0 %	50 %	0 %	29654016
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13494	NC_002971	T	6	6	625085	625090	0 %	100 %	0 %	0 %	29654021
13495	NC_002971	CATT	2	8	625120	625127	25 %	50 %	0 %	25 %	29654021
13496	NC_002971	TAAA	2	8	625183	625190	75 %	25 %	0 %	0 %	29654021
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