MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002971	GTGG	2	8	580822	580829	0 %	25 %	75 %	0 %	215919010
12502	NC_002971	AGC	2	6	580836	580841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_002971	GTG	2	6	580906	580911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653970
12504	NC_002971	CGA	2	6	580976	580981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653970
12505	NC_002971	TTCT	2	8	581008	581015	0 %	75 %	0 %	25 %	29653970
12506	NC_002971	TCA	2	6	581018	581023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653970
12507	NC_002971	GGCA	2	8	581061	581068	25 %	0 %	50 %	25 %	29653970
12508	NC_002971	GTT	2	6	581076	581081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653970
12509	NC_002971	TCC	2	6	581105	581110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653970
12510	NC_002971	TTTC	2	8	581195	581202	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_002971	TCG	2	6	581236	581241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_002971	GAAA	2	8	581394	581401	75 %	0 %	25 %	0 %	215919011
12513	NC_002971	A	6	6	581410	581415	100 %	0 %	0 %	0 %	215919011
12514	NC_002971	GCA	2	6	581427	581432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215919011
12515	NC_002971	TTG	2	6	581471	581476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215919011
12516	NC_002971	ATT	2	6	581492	581497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919011
12517	NC_002971	CAT	2	6	581499	581504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919011
12518	NC_002971	AAC	2	6	581512	581517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919011
12519	NC_002971	ATTT	2	8	581567	581574	25 %	75 %	0 %	0 %	215919011
12520	NC_002971	AGG	2	6	581588	581593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215919011
12521	NC_002971	CTT	2	6	581609	581614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919011
12522	NC_002971	GTA	2	6	581630	581635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919011
12523	NC_002971	ACC	2	6	581667	581672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215919011
12524	NC_002971	ACA	2	6	581762	581767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919011
12525	NC_002971	TGG	2	6	581837	581842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215919011
12526	NC_002971	TAT	2	6	581862	581867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919011
12527	NC_002971	AAGG	2	8	581992	581999	50 %	0 %	50 %	0 %	215919011
12528	NC_002971	T	7	7	582002	582008	0 %	100 %	0 %	0 %	215919011
12529	NC_002971	ATC	2	6	582046	582051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919011
12530	NC_002971	AGAA	2	8	582081	582088	75 %	0 %	25 %	0 %	215919011
12531	NC_002971	A	6	6	582243	582248	100 %	0 %	0 %	0 %	215919011
12532	NC_002971	TTA	2	6	582260	582265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919011
12533	NC_002971	TAC	2	6	582290	582295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919011
12534	NC_002971	TTTAA	2	10	582367	582376	40 %	60 %	0 %	0 %	215919011
12535	NC_002971	TTTC	2	8	582407	582414	0 %	75 %	0 %	25 %	215919011
12536	NC_002971	CAA	2	6	582421	582426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919011
12537	NC_002971	TAC	2	6	582448	582453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919011
12538	NC_002971	TA	3	6	582686	582691	50 %	50 %	0 %	0 %	215919011
12539	NC_002971	CAT	2	6	582726	582731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919011
12540	NC_002971	GGT	2	6	582754	582759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215919011
12541	NC_002971	AGT	2	6	582772	582777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919011
12542	NC_002971	GAAG	2	8	582849	582856	50 %	0 %	50 %	0 %	215919011
12543	NC_002971	TGA	2	6	582870	582875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919011
12544	NC_002971	TTA	2	6	582919	582924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919011
12545	NC_002971	A	6	6	582956	582961	100 %	0 %	0 %	0 %	215919011
12546	NC_002971	AGA	2	6	582969	582974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919011
12547	NC_002971	AATT	2	8	583043	583050	50 %	50 %	0 %	0 %	215919011
12548	NC_002971	A	7	7	583172	583178	100 %	0 %	0 %	0 %	215919011
12549	NC_002971	TAA	2	6	583212	583217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215919011
12550	NC_002971	GAA	2	6	583231	583236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919011
12551	NC_002971	AGA	2	6	583240	583245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919011
12552	NC_002971	AGG	2	6	583304	583309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653973
12553	NC_002971	ATC	2	6	583468	583473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653973
12554	NC_002971	CTT	2	6	583480	583485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653973
12555	NC_002971	TTA	2	6	583558	583563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653973
12556	NC_002971	TAA	2	6	583575	583580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653973
12557	NC_002971	TTTC	2	8	583598	583605	0 %	75 %	0 %	25 %	29653973
12558	NC_002971	GGT	2	6	583639	583644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653973
12559	NC_002971	CCT	2	6	583658	583663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653973
12560	NC_002971	TG	3	6	583682	583687	0 %	50 %	50 %	0 %	29653973
12561	NC_002971	TTGC	2	8	583691	583698	0 %	50 %	25 %	25 %	29653973
12562	NC_002971	A	8	8	583736	583743	100 %	0 %	0 %	0 %	29653973
12563	NC_002971	ATC	2	6	583757	583762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653973
12564	NC_002971	GGT	2	6	583783	583788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653973
12565	NC_002971	TAA	2	6	583791	583796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653973
12566	NC_002971	TTA	2	6	583799	583804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653973
12567	NC_002971	ATCT	2	8	583850	583857	25 %	50 %	0 %	25 %	29653973
12568	NC_002971	CT	3	6	583882	583887	0 %	50 %	0 %	50 %	29653973
12569	NC_002971	CG	3	6	583942	583947	0 %	0 %	50 %	50 %	29653973
12570	NC_002971	GAT	2	6	583966	583971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653973
12571	NC_002971	GAA	2	6	583984	583989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653973
12572	NC_002971	CCA	2	6	583992	583997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653973
12573	NC_002971	T	7	7	584058	584064	0 %	100 %	0 %	0 %	29653973
12574	NC_002971	GCGG	2	8	584113	584120	0 %	0 %	75 %	25 %	29653973
12575	NC_002971	AAT	2	6	584130	584135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653973
12576	NC_002971	AGGA	2	8	584159	584166	50 %	0 %	50 %	0 %	29653973
12577	NC_002971	GTT	2	6	584172	584177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653973
12578	NC_002971	CG	3	6	584198	584203	0 %	0 %	50 %	50 %	29653973
12579	NC_002971	TAAA	2	8	584216	584223	75 %	25 %	0 %	0 %	29653973
12580	NC_002971	ATT	2	6	584224	584229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653973
12581	NC_002971	GCCT	2	8	584259	584266	0 %	25 %	25 %	50 %	29653973
12582	NC_002971	GTT	2	6	584281	584286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653973
12583	NC_002971	GAA	2	6	584290	584295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653973
12584	NC_002971	CAG	2	6	584330	584335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653973
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12586	NC_002971	AAG	2	6	584556	584561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653973
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12588	NC_002971	GAA	2	6	584634	584639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653973
12589	NC_002971	GGA	2	6	584808	584813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_002971	TTTTAA	2	12	584858	584869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653974
12591	NC_002971	TATTGT	2	12	584937	584948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29653974
12592	NC_002971	TTCA	2	8	584950	584957	25 %	50 %	0 %	25 %	29653974
12593	NC_002971	TGTT	2	8	584968	584975	0 %	75 %	25 %	0 %	29653974
12594	NC_002971	TGC	2	6	585044	585049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653974
12595	NC_002971	ATG	2	6	585055	585060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653974
12596	NC_002971	T	7	7	585072	585078	0 %	100 %	0 %	0 %	29653974
12597	NC_002971	TTTG	2	8	585161	585168	0 %	75 %	25 %	0 %	29653974
12598	NC_002971	AGC	2	6	585324	585329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653974
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12600	NC_002971	T	6	6	585378	585383	0 %	100 %	0 %	0 %	29653974
12601	NC_002971	CTACC	2	10	585398	585407	20 %	20 %	0 %	60 %	29653974
12602	NC_002971	TAT	2	6	585414	585419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653974
12603	NC_002971	ACT	2	6	585544	585549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653974
12604	NC_002971	TAG	2	6	585552	585557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653974
12605	NC_002971	GAAA	2	8	585594	585601	75 %	0 %	25 %	0 %	29653974
12606	NC_002971	GTT	2	6	585658	585663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653974
12607	NC_002971	A	7	7	585699	585705	100 %	0 %	0 %	0 %	29653974
12608	NC_002971	AGA	2	6	585737	585742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653975
12609	NC_002971	TGC	2	6	585787	585792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653975
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12611	NC_002971	CTTT	2	8	585833	585840	0 %	75 %	0 %	25 %	29653975
12612	NC_002971	GTT	2	6	585868	585873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653975
12613	NC_002971	TTC	2	6	585922	585927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653975
12614	NC_002971	TGT	2	6	585963	585968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653975
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12617	NC_002971	TGA	2	6	586188	586193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653975
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