MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_002971	A	6	6	322454	322459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_002971	A	6	6	322663	322668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_002971	CGCA	2	8	322718	322725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_002971	AAG	2	6	322735	322740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_002971	AT	3	6	322748	322753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_002971	TAT	2	6	322812	322817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_002971	GCT	2	6	322818	322823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_002971	CGAGC	2	10	322874	322883	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7009	NC_002971	AATT	2	8	322898	322905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_002971	TGC	2	6	322916	322921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_002971	TCA	2	6	322932	322937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_002971	ACAA	2	8	322985	322992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7013	NC_002971	TGC	2	6	323017	323022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_002971	A	6	6	323076	323081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_002971	GTG	2	6	323097	323102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_002971	GTGGA	2	10	323125	323134	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_002971	ATG	2	6	323147	323152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_002971	AGG	2	6	323194	323199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_002971	CAA	2	6	323200	323205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_002971	TGC	2	6	323218	323223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_002971	A	7	7	323236	323242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_002971	CAA	2	6	323296	323301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_002971	TG	3	6	323328	323333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_002971	AT	3	6	323353	323358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_002971	GGT	2	6	323393	323398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_002971	CGC	2	6	323422	323427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_002971	TACAG	2	10	323486	323495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7028	NC_002971	TGC	2	6	323524	323529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_002971	ATAA	2	8	323594	323601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_002971	GATT	2	8	323680	323687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_002971	CAA	2	6	323697	323702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_002971	TGCAT	2	10	323716	323725	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7033	NC_002971	GCC	2	6	323729	323734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7034	NC_002971	ATGT	2	8	323802	323809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_002971	GAA	2	6	323894	323899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_002971	AGA	2	6	323920	323925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_002971	GC	3	6	323968	323973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_002971	GAC	2	6	324021	324026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_002971	T	6	6	324032	324037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_002971	AAT	2	6	324060	324065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_002971	TGT	2	6	324095	324100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653706
7042	NC_002971	GC	3	6	324132	324137	0 %	0 %	50 %	50 %	29653706
7043	NC_002971	GC	3	6	324143	324148	0 %	0 %	50 %	50 %	29653706
7044	NC_002971	CA	3	6	324153	324158	50 %	0 %	0 %	50 %	29653706
7045	NC_002971	AAAATG	2	12	324179	324190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29653706
7046	NC_002971	GGT	2	6	324224	324229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653706
7047	NC_002971	ATC	2	6	324332	324337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_002971	AATT	2	8	324424	324431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_002971	TAA	2	6	324493	324498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_002971	ATTCA	2	10	324538	324547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7051	NC_002971	AAC	2	6	324564	324569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_002971	ATA	2	6	324581	324586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_002971	ATT	2	6	324619	324624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_002971	AATG	2	8	324638	324645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_002971	GAA	2	6	324664	324669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_002971	AACATC	2	12	324714	324725	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_002971	GCCAG	2	10	324747	324756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7058	NC_002971	AAATTG	2	12	324782	324793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_002971	TAA	2	6	324847	324852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_002971	AAT	2	6	324881	324886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_002971	TAA	2	6	324929	324934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_002971	TAG	2	6	324976	324981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_002971	T	6	6	325033	325038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_002971	TCGA	2	8	325046	325053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7065	NC_002971	T	8	8	325063	325070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_002971	CGG	2	6	325098	325103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_002971	TGG	2	6	325113	325118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_002971	ATTG	2	8	325148	325155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_002971	ATA	2	6	325165	325170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_002971	GATT	2	8	325235	325242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_002971	TTC	2	6	325247	325252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_002971	ATA	2	6	325291	325296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_002971	T	8	8	325375	325382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_002971	TAA	2	6	325412	325417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7076	NC_002971	CGT	2	6	325452	325457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_002971	TAA	2	6	325573	325578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_002971	TGT	2	6	325581	325586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_002971	GTTAA	2	10	325634	325643	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_002971	AAT	2	6	325875	325880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_002971	ACC	2	6	325896	325901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_002971	GC	3	6	326019	326024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7088	NC_002971	CCG	2	6	326174	326179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_002971	ATT	2	6	326241	326246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_002971	T	8	8	326488	326495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_002971	CCA	2	6	326530	326535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7100	NC_002971	CGG	2	6	326576	326581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_002971	ATC	3	9	326718	326726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7103	NC_002971	A	7	7	326911	326917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_002971	TTTCCT	2	12	326941	326952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7118	NC_002971	ATTG	2	8	327565	327572	25 %	50 %	25 %	0 %	29653711
7119	NC_002971	TAA	2	6	327577	327582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653711
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7121	NC_002971	ATCAT	2	10	327636	327645	40 %	40 %	0 %	20 %	29653711
7122	NC_002971	TGA	2	6	327712	327717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653711
7123	NC_002971	TAG	2	6	327814	327819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653711
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7131	NC_002971	ACG	2	6	328104	328109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653711
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