MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_002932	T	6	6	2085884	2085889	0 %	100 %	0 %	0 %	21675025
44502	NC_002932	ATA	2	6	2085896	2085901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21675025
44503	NC_002932	GCAAC	2	10	2085923	2085932	40 %	0 %	20 %	40 %	21675026
44504	NC_002932	A	6	6	2085988	2085993	100 %	0 %	0 %	0 %	21675026
44505	NC_002932	TTGG	2	8	2086006	2086013	0 %	50 %	50 %	0 %	21675026
44506	NC_002932	ATTC	2	8	2086030	2086037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44507	NC_002932	TTA	2	6	2086135	2086140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21675027
44508	NC_002932	AT	3	6	2086209	2086214	50 %	50 %	0 %	0 %	21675027
44509	NC_002932	GCA	2	6	2086261	2086266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675028
44510	NC_002932	AGC	2	6	2086304	2086309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675028
44511	NC_002932	AGC	2	6	2086374	2086379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675028
44512	NC_002932	GCC	2	6	2086512	2086517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675028
44513	NC_002932	CTTCG	2	10	2086581	2086590	0 %	40 %	20 %	40 %	21675028
44514	NC_002932	TCC	2	6	2086602	2086607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675028
44515	NC_002932	AGC	2	6	2086627	2086632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675028
44516	NC_002932	GCC	2	6	2086642	2086647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675028
44517	NC_002932	CCG	2	6	2086672	2086677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675028
44518	NC_002932	AGC	2	6	2086681	2086686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675028
44519	NC_002932	CGC	2	6	2086695	2086700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675028
44520	NC_002932	ACA	2	6	2086797	2086802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44521	NC_002932	T	6	6	2086910	2086915	0 %	100 %	0 %	0 %	21675029
44522	NC_002932	CGG	2	6	2086973	2086978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675029
44523	NC_002932	CGT	2	6	2086979	2086984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675029
44524	NC_002932	TGA	2	6	2087033	2087038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675029
44525	NC_002932	TGA	2	6	2087123	2087128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675029
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44527	NC_002932	T	6	6	2087219	2087224	0 %	100 %	0 %	0 %	21675029
44528	NC_002932	CGG	2	6	2087246	2087251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675029
44529	NC_002932	GC	3	6	2087260	2087265	0 %	0 %	50 %	50 %	21675029
44530	NC_002932	CCTT	2	8	2087278	2087285	0 %	50 %	0 %	50 %	21675029
44531	NC_002932	GTG	2	6	2087304	2087309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21675029
44532	NC_002932	GCC	2	6	2087328	2087333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44533	NC_002932	GGA	2	6	2087334	2087339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44534	NC_002932	TCC	2	6	2087374	2087379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675030
44535	NC_002932	GCC	3	9	2087460	2087468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675030
44536	NC_002932	T	7	7	2087493	2087499	0 %	100 %	0 %	0 %	21675030
44537	NC_002932	AG	3	6	2087503	2087508	50 %	0 %	50 %	0 %	21675030
44538	NC_002932	CATT	2	8	2087536	2087543	25 %	50 %	0 %	25 %	21675030
44539	NC_002932	CCG	2	6	2087544	2087549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675030
44540	NC_002932	CGCTGC	2	12	2087609	2087620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21675030
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44542	NC_002932	GAAG	2	8	2087699	2087706	50 %	0 %	50 %	0 %	21675030
44543	NC_002932	AGAT	2	8	2087710	2087717	50 %	25 %	25 %	0 %	21675030
44544	NC_002932	TCGG	2	8	2087721	2087728	0 %	25 %	50 %	25 %	21675030
44545	NC_002932	CAT	2	6	2087733	2087738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21675030
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44550	NC_002932	AGT	2	6	2087879	2087884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675030
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44553	NC_002932	AGGGC	2	10	2088043	2088052	20 %	0 %	60 %	20 %	21675030
44554	NC_002932	TGA	3	9	2088092	2088100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675030
44555	NC_002932	CGG	2	6	2088114	2088119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675030
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44577	NC_002932	GTTG	2	8	2089501	2089508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44578	NC_002932	ATA	2	6	2089543	2089548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44579	NC_002932	GCC	3	9	2089590	2089598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675032
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44586	NC_002932	CGC	2	6	2089752	2089757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675032
44587	NC_002932	AGTGG	2	10	2089838	2089847	20 %	20 %	60 %	0 %	21675032
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44591	NC_002932	CTT	2	6	2090065	2090070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21675032
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44595	NC_002932	GTCGA	2	10	2090212	2090221	20 %	20 %	40 %	20 %	21675032
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44602	NC_002932	GCG	2	6	2090463	2090468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675032
44603	NC_002932	CTTC	2	8	2090507	2090514	0 %	50 %	0 %	50 %	21675032
44604	NC_002932	CAC	2	6	2090553	2090558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21675032
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44607	NC_002932	CTG	2	6	2090680	2090685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675033
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44612	NC_002932	GTC	2	6	2090974	2090979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675033
44613	NC_002932	GTA	2	6	2091012	2091017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44614	NC_002932	CCT	2	6	2091095	2091100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675034
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44619	NC_002932	GAC	2	6	2091279	2091284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675034
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44857	NC_002932	GCA	2	6	2102431	2102436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675047
44858	NC_002932	TCG	2	6	2102442	2102447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675047
44859	NC_002932	GCA	2	6	2102470	2102475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675047
44860	NC_002932	AGC	2	6	2102496	2102501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675047
44861	NC_002932	CCCGCG	2	12	2102517	2102528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675047
44862	NC_002932	CT	3	6	2102542	2102547	0 %	50 %	0 %	50 %	21675047
44863	NC_002932	GGA	2	6	2102696	2102701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21675048
44864	NC_002932	TGA	2	6	2102728	2102733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675048
44865	NC_002932	CGA	2	6	2102770	2102775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675048
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44868	NC_002932	TGA	2	6	2102991	2102996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675048
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44870	NC_002932	TGT	2	6	2103031	2103036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675048
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44873	NC_002932	CCG	2	6	2103337	2103342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675049
44874	NC_002932	ACC	2	6	2103379	2103384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21675049
44875	NC_002932	GC	3	6	2103407	2103412	0 %	0 %	50 %	50 %	21675049
44876	NC_002932	GCG	2	6	2103420	2103425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
44877	NC_002932	GCG	2	6	2103428	2103433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
44878	NC_002932	GA	3	6	2103436	2103441	50 %	0 %	50 %	0 %	21675049
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44883	NC_002932	GAA	2	6	2103594	2103599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21675049
44884	NC_002932	CCT	2	6	2103650	2103655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675049
44885	NC_002932	CTT	2	6	2103678	2103683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21675049
44886	NC_002932	CGG	2	6	2103719	2103724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
44887	NC_002932	GCGCG	2	10	2103744	2103753	0 %	0 %	60 %	40 %	21675049
44888	NC_002932	CGG	2	6	2103758	2103763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
44889	NC_002932	GGC	2	6	2103776	2103781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
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44891	NC_002932	GCG	2	6	2103977	2103982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675049
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44904	NC_002932	TCGG	2	8	2104726	2104733	0 %	25 %	50 %	25 %	21675050
44905	NC_002932	GGC	2	6	2104750	2104755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675050
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44909	NC_002932	CGG	2	6	2105060	2105065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675050
44910	NC_002932	TTG	2	6	2105322	2105327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675051
44911	NC_002932	TCGG	2	8	2105358	2105365	0 %	25 %	50 %	25 %	21675051
44912	NC_002932	GC	3	6	2105392	2105397	0 %	0 %	50 %	50 %	21675051
44913	NC_002932	GCC	2	6	2105415	2105420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675051
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44915	NC_002932	GCC	2	6	2105490	2105495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44916	NC_002932	GCG	2	6	2105514	2105519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44917	NC_002932	ACTG	2	8	2105533	2105540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44918	NC_002932	TCG	2	6	2105551	2105556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675052
44919	NC_002932	TCC	2	6	2105560	2105565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675052
44920	NC_002932	TC	4	8	2105585	2105592	0 %	50 %	0 %	50 %	21675052
44921	NC_002932	TTCTT	2	10	2105603	2105612	0 %	80 %	0 %	20 %	21675052
44922	NC_002932	TCCA	2	8	2105616	2105623	25 %	25 %	0 %	50 %	21675052
44923	NC_002932	TGA	2	6	2105624	2105629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675052
44924	NC_002932	ACCA	2	8	2105637	2105644	50 %	0 %	0 %	50 %	21675052
44925	NC_002932	CTC	2	6	2105817	2105822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675052
44926	NC_002932	GCA	2	6	2105847	2105852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675052
44927	NC_002932	TTG	2	6	2105908	2105913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675052
44928	NC_002932	CTC	2	6	2105928	2105933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675052
44929	NC_002932	CATGCC	2	12	2105937	2105948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21675052
44930	NC_002932	GGT	2	6	2105976	2105981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21675052
44931	NC_002932	GAGCTT	2	12	2106009	2106020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21675052
44932	NC_002932	TGA	2	6	2106029	2106034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675052
44933	NC_002932	CGA	2	6	2106050	2106055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675052
44934	NC_002932	TGG	2	6	2106068	2106073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21675052
44935	NC_002932	CTC	2	6	2106117	2106122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675052
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44937	NC_002932	CGC	2	6	2106191	2106196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675052
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44939	NC_002932	TCA	2	6	2106257	2106262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21675052
44940	NC_002932	TTCG	2	8	2106264	2106271	0 %	50 %	25 %	25 %	21675052
44941	NC_002932	CAG	3	9	2106345	2106353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675052
44942	NC_002932	CAT	2	6	2106360	2106365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21675052
44943	NC_002932	CCA	2	6	2106482	2106487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21675052
44944	NC_002932	ATG	2	6	2106493	2106498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675052
44945	NC_002932	GTT	3	9	2106576	2106584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675052
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44947	NC_002932	CAT	2	6	2106615	2106620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21675052
44948	NC_002932	CGG	2	6	2106629	2106634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675052
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44952	NC_002932	TCG	2	6	2107030	2107035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675052
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44955	NC_002932	CTT	2	6	2107137	2107142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21675052
44956	NC_002932	T	6	6	2107155	2107160	0 %	100 %	0 %	0 %	21675052
44957	NC_002932	TTG	2	6	2107186	2107191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675052
44958	NC_002932	ATT	2	6	2107202	2107207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21675052
44959	NC_002932	T	6	6	2107238	2107243	0 %	100 %	0 %	0 %	21675053
44960	NC_002932	TGT	2	6	2107325	2107330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21675053
44961	NC_002932	AGC	2	6	2107402	2107407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675053
44962	NC_002932	ATG	2	6	2107507	2107512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675053
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44964	NC_002932	GAACAG	2	12	2107563	2107574	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21675053
44965	NC_002932	GGC	2	6	2107625	2107630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675053
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44967	NC_002932	AGC	2	6	2107650	2107655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675053
44968	NC_002932	GC	3	6	2107761	2107766	0 %	0 %	50 %	50 %	21675053
44969	NC_002932	ATG	2	6	2107780	2107785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675053
44970	NC_002932	GCCAA	2	10	2107812	2107821	40 %	0 %	20 %	40 %	21675053
44971	NC_002932	GCC	2	6	2107854	2107859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675053
44972	NC_002932	AGCG	2	8	2107888	2107895	25 %	0 %	50 %	25 %	21675053
44973	NC_002932	GGT	2	6	2108001	2108006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21675053
44974	NC_002932	T	6	6	2108190	2108195	0 %	100 %	0 %	0 %	21675053
44975	NC_002932	CCT	2	6	2108207	2108212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675054
44976	NC_002932	CGG	2	6	2108232	2108237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675054
44977	NC_002932	TCGGC	2	10	2108446	2108455	0 %	20 %	40 %	40 %	21675054
44978	NC_002932	CTC	2	6	2108501	2108506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675054
44979	NC_002932	CCG	2	6	2108544	2108549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21675054
44980	NC_002932	GTT	2	6	2108654	2108659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44981	NC_002932	AGC	2	6	2108829	2108834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21675055
44982	NC_002932	CTT	2	6	2108868	2108873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21675055
44983	NC_002932	GCG	2	6	2108881	2108886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21675055
44984	NC_002932	AGT	2	6	2108918	2108923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21675055
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44986	NC_002932	GCC	2	6	2109116	2109121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44988	NC_002932	CCT	2	6	2109260	2109265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21675056
44989	NC_002932	TCG	2	6	2109370	2109375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21675056
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