MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_002932	TA	3	6	1865257	1865262	50 %	50 %	0 %	0 %	21674776
40003	NC_002932	ATCA	2	8	1865323	1865330	50 %	25 %	0 %	25 %	21674776
40004	NC_002932	GACC	2	8	1865403	1865410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40005	NC_002932	GCG	2	6	1865419	1865424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40006	NC_002932	TTG	2	6	1865448	1865453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40007	NC_002932	CAT	2	6	1865456	1865461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40008	NC_002932	CGA	2	6	1865475	1865480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40009	NC_002932	TGC	2	6	1865604	1865609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40010	NC_002932	TGC	2	6	1865628	1865633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40011	NC_002932	TCG	2	6	1865699	1865704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40012	NC_002932	CGA	2	6	1865721	1865726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40013	NC_002932	TTGA	2	8	1865749	1865756	25 %	50 %	25 %	0 %	21674777
40014	NC_002932	TC	3	6	1865832	1865837	0 %	50 %	0 %	50 %	21674777
40015	NC_002932	TCG	2	6	1865867	1865872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674777
40016	NC_002932	CGCCAA	2	12	1865886	1865897	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21674777
40017	NC_002932	GCC	2	6	1865906	1865911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674777
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40020	NC_002932	AGT	2	6	1866050	1866055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674778
40021	NC_002932	CTG	2	6	1866106	1866111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674778
40022	NC_002932	CT	3	6	1866141	1866146	0 %	50 %	0 %	50 %	21674778
40023	NC_002932	A	6	6	1866172	1866177	100 %	0 %	0 %	0 %	21674778
40024	NC_002932	ATGA	2	8	1866250	1866257	50 %	25 %	25 %	0 %	21674778
40025	NC_002932	TC	3	6	1866264	1866269	0 %	50 %	0 %	50 %	21674778
40026	NC_002932	CAA	2	6	1866277	1866282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674778
40027	NC_002932	TTA	2	6	1866428	1866433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40028	NC_002932	TTCTT	2	10	1866435	1866444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40029	NC_002932	TCA	2	6	1866467	1866472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40030	NC_002932	TGATA	2	10	1866553	1866562	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40031	NC_002932	AGC	2	6	1866705	1866710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674779
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40052	NC_002932	CGCA	2	8	1867652	1867659	25 %	0 %	25 %	50 %	21674780
40053	NC_002932	CTG	2	6	1867686	1867691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674780
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40119	NC_002932	GGC	2	6	1870755	1870760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674782
40120	NC_002932	CCA	2	6	1870768	1870773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674782
40121	NC_002932	GCC	2	6	1870826	1870831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674782
40122	NC_002932	GCG	2	6	1870914	1870919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674782
40123	NC_002932	GCG	2	6	1871023	1871028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674782
40124	NC_002932	GCT	2	6	1871134	1871139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674782
40125	NC_002932	CTG	2	6	1871141	1871146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674782
40126	NC_002932	GCG	2	6	1871168	1871173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674782
40127	NC_002932	GCT	2	6	1871191	1871196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674782
40128	NC_002932	CGC	2	6	1871230	1871235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674782
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40130	NC_002932	CGC	2	6	1871263	1871268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674782
40131	NC_002932	CGC	2	6	1871305	1871310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674782
40132	NC_002932	CCG	2	6	1871313	1871318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674782
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40135	NC_002932	A	6	6	1871501	1871506	100 %	0 %	0 %	0 %	21674782
40136	NC_002932	CGA	2	6	1871553	1871558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674783
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40140	NC_002932	ACC	2	6	1871710	1871715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674783
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40146	NC_002932	CGA	2	6	1872152	1872157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674783
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40148	NC_002932	TCT	2	6	1872180	1872185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674783
40149	NC_002932	CAG	2	6	1872261	1872266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674783
40150	NC_002932	CGC	2	6	1872276	1872281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674783
40151	NC_002932	TC	3	6	1872286	1872291	0 %	50 %	0 %	50 %	21674783
40152	NC_002932	A	6	6	1872292	1872297	100 %	0 %	0 %	0 %	21674783
40153	NC_002932	ACG	3	9	1872344	1872352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674783
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40156	NC_002932	CGAT	2	8	1872419	1872426	25 %	25 %	25 %	25 %	21674783
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40160	NC_002932	GTTT	2	8	1872531	1872538	0 %	75 %	25 %	0 %	21674783
40161	NC_002932	GGA	2	6	1872616	1872621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674783
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40169	NC_002932	A	7	7	1872824	1872830	100 %	0 %	0 %	0 %	21674783
40170	NC_002932	AAAG	2	8	1872835	1872842	75 %	0 %	25 %	0 %	21674783
40171	NC_002932	CAA	2	6	1872848	1872853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674783
40172	NC_002932	A	6	6	1872862	1872867	100 %	0 %	0 %	0 %	21674783
40173	NC_002932	ATT	2	6	1872876	1872881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21674783
40174	NC_002932	GCG	2	6	1872926	1872931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674783
40175	NC_002932	ACG	2	6	1872989	1872994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674783
40176	NC_002932	ACGGC	2	10	1873012	1873021	20 %	0 %	40 %	40 %	21674783
40177	NC_002932	A	6	6	1873057	1873062	100 %	0 %	0 %	0 %	21674783
40178	NC_002932	TCA	2	6	1873131	1873136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40179	NC_002932	AGAAA	2	10	1873173	1873182	80 %	0 %	20 %	0 %	21674784
40180	NC_002932	GCC	3	9	1873243	1873251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674784
40181	NC_002932	GCCGA	2	10	1873259	1873268	20 %	0 %	40 %	40 %	21674784
40182	NC_002932	CGC	2	6	1873353	1873358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674784
40183	NC_002932	CGC	2	6	1873362	1873367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674784
40184	NC_002932	CG	3	6	1873374	1873379	0 %	0 %	50 %	50 %	21674784
40185	NC_002932	CGG	2	6	1873477	1873482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674784
40186	NC_002932	GAG	2	6	1873504	1873509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674784
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40188	NC_002932	CAGC	2	8	1873587	1873594	25 %	0 %	25 %	50 %	21674784
40189	NC_002932	GAC	2	6	1873609	1873614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674784
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40191	NC_002932	CGC	2	6	1873659	1873664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674784
40192	NC_002932	GAG	2	6	1873678	1873683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674784
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40194	NC_002932	ATCCTC	2	12	1873878	1873889	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21674785
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40200	NC_002932	CGT	2	6	1874083	1874088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674785
40201	NC_002932	TGC	2	6	1874128	1874133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674785
40202	NC_002932	AGCA	2	8	1874148	1874155	50 %	0 %	25 %	25 %	21674785
40203	NC_002932	ACCGT	2	10	1874161	1874170	20 %	20 %	20 %	40 %	21674785
40204	NC_002932	TGC	2	6	1874200	1874205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674785
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40207	NC_002932	ACC	2	6	1874328	1874333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40208	NC_002932	AAC	2	6	1874337	1874342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674786
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40210	NC_002932	CCTG	2	8	1874398	1874405	0 %	25 %	25 %	50 %	21674786
40211	NC_002932	GAC	2	6	1874412	1874417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674786
40212	NC_002932	CGG	2	6	1874444	1874449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674786
40213	NC_002932	CCCGCG	2	12	1874455	1874466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674786
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40219	NC_002932	GCC	3	9	1874625	1874633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674786
40220	NC_002932	CTT	2	6	1874651	1874656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674786
40221	NC_002932	CGC	2	6	1874693	1874698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674786
40222	NC_002932	CGC	2	6	1874714	1874719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674786
40223	NC_002932	GAA	2	6	1874753	1874758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674786
40224	NC_002932	TGG	2	6	1874809	1874814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674786
40225	NC_002932	CGT	2	6	1874848	1874853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674786
40226	NC_002932	TTC	2	6	1874898	1874903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674786
40227	NC_002932	CGA	2	6	1874912	1874917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674786
40228	NC_002932	CTA	2	6	1874975	1874980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674786
40229	NC_002932	CGG	2	6	1875023	1875028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674786
40230	NC_002932	AAC	2	6	1875098	1875103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674786
40231	NC_002932	GGC	2	6	1875201	1875206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674786
40232	NC_002932	TCC	2	6	1875211	1875216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674786
40233	NC_002932	AGC	2	6	1875259	1875264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674786
40234	NC_002932	GCTC	2	8	1875271	1875278	0 %	25 %	25 %	50 %	21674786
40235	NC_002932	CGG	2	6	1875305	1875310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674786
40236	NC_002932	GCT	2	6	1875493	1875498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674787
40237	NC_002932	CTG	2	6	1875499	1875504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674787
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40355	NC_002932	TCGG	2	8	1881188	1881195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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40477	NC_002932	T	6	6	1886822	1886827	0 %	100 %	0 %	0 %	21674799
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40479	NC_002932	CCA	2	6	1886965	1886970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674799
40480	NC_002932	GAT	2	6	1886987	1886992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674799
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40482	NC_002932	TCG	2	6	1887087	1887092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674799
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