MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_002932	CCG	2	6	1818373	1818378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674734
39003	NC_002932	CG	3	6	1818399	1818404	0 %	0 %	50 %	50 %	21674734
39004	NC_002932	CCAA	2	8	1818409	1818416	50 %	0 %	0 %	50 %	21674734
39005	NC_002932	CGG	2	6	1818431	1818436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674734
39006	NC_002932	TGA	2	6	1818497	1818502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674734
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39008	NC_002932	CGC	2	6	1818615	1818620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674734
39009	NC_002932	AGA	2	6	1818624	1818629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674734
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39011	NC_002932	CAA	2	6	1818705	1818710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674735
39012	NC_002932	CCG	2	6	1818749	1818754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674735
39013	NC_002932	CTT	2	6	1818768	1818773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674735
39014	NC_002932	CTG	2	6	1818775	1818780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674735
39015	NC_002932	GGA	2	6	1818784	1818789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674735
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39017	NC_002932	GGC	2	6	1818915	1818920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674735
39018	NC_002932	CGT	2	6	1818933	1818938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674735
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39020	NC_002932	A	6	6	1818997	1819002	100 %	0 %	0 %	0 %	21674735
39021	NC_002932	GAT	2	6	1819053	1819058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674735
39022	NC_002932	GAT	2	6	1819074	1819079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674735
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39027	NC_002932	GAGG	2	8	1819317	1819324	25 %	0 %	75 %	0 %	21674736
39028	NC_002932	CTC	2	6	1819371	1819376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674736
39029	NC_002932	GGCT	2	8	1819505	1819512	0 %	25 %	50 %	25 %	21674736
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39032	NC_002932	CGG	2	6	1819593	1819598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674736
39033	NC_002932	TGC	2	6	1819600	1819605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674736
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39035	NC_002932	TGGC	2	8	1819667	1819674	0 %	25 %	50 %	25 %	21674736
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39040	NC_002932	AG	3	6	1819848	1819853	50 %	0 %	50 %	0 %	21674736
39041	NC_002932	CGGCT	2	10	1819895	1819904	0 %	20 %	40 %	40 %	21674736
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39049	NC_002932	A	7	7	1820183	1820189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39073	NC_002932	TAA	2	6	1821778	1821783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39088	NC_002932	CGCC	2	8	1822340	1822347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39089	NC_002932	CTG	2	6	1822349	1822354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39091	NC_002932	CA	3	6	1822422	1822427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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39118	NC_002932	C	6	6	1823520	1823525	0 %	0 %	0 %	100 %	21674741
39119	NC_002932	CGCA	2	8	1823557	1823564	25 %	0 %	25 %	50 %	21674741
39120	NC_002932	CGA	2	6	1823587	1823592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674741
39121	NC_002932	CCG	2	6	1823596	1823601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674741
39122	NC_002932	CAG	2	6	1823618	1823623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674741
39123	NC_002932	AGT	2	6	1823668	1823673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674741
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39125	NC_002932	GAT	2	6	1823731	1823736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674741
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39194	NC_002932	TCCG	2	8	1826652	1826659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39195	NC_002932	GGC	2	6	1826665	1826670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39196	NC_002932	TAA	3	9	1826738	1826746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39197	NC_002932	GAA	2	6	1826747	1826752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39198	NC_002932	ATCC	2	8	1826772	1826779	25 %	25 %	0 %	50 %	21674744
39199	NC_002932	A	6	6	1826791	1826796	100 %	0 %	0 %	0 %	21674744
39200	NC_002932	TATCG	2	10	1826797	1826806	20 %	40 %	20 %	20 %	21674744
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39202	NC_002932	GCTTG	2	10	1826929	1826938	0 %	40 %	40 %	20 %	21674744
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39217	NC_002932	A	7	7	1827554	1827560	100 %	0 %	0 %	0 %	21674744
39218	NC_002932	GAC	2	6	1827605	1827610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674744
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39221	NC_002932	TGAT	2	8	1827990	1827997	25 %	50 %	25 %	0 %	21674744
39222	NC_002932	GCC	2	6	1828028	1828033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674744
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39224	NC_002932	GAC	2	6	1828103	1828108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39225	NC_002932	A	6	6	1828163	1828168	100 %	0 %	0 %	0 %	21674745
39226	NC_002932	A	6	6	1828174	1828179	100 %	0 %	0 %	0 %	21674745
39227	NC_002932	CT	3	6	1828213	1828218	0 %	50 %	0 %	50 %	21674745
39228	NC_002932	GA	3	6	1828253	1828258	50 %	0 %	50 %	0 %	21674745
39229	NC_002932	ATT	2	6	1828335	1828340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21674746
39230	NC_002932	CAG	2	6	1828374	1828379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674746
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39232	NC_002932	GC	3	6	1828389	1828394	0 %	0 %	50 %	50 %	21674746
39233	NC_002932	CAGG	2	8	1828418	1828425	25 %	0 %	50 %	25 %	21674746
39234	NC_002932	GAG	3	9	1828524	1828532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674746
39235	NC_002932	CAGC	2	8	1828543	1828550	25 %	0 %	25 %	50 %	21674746
39236	NC_002932	CA	3	6	1828658	1828663	50 %	0 %	0 %	50 %	21674746
39237	NC_002932	CGA	2	6	1828682	1828687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674746
39238	NC_002932	TGC	2	6	1828751	1828756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674746
39239	NC_002932	GAA	2	6	1828826	1828831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674746
39240	NC_002932	ACC	2	6	1828837	1828842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674746
39241	NC_002932	GCG	2	6	1828948	1828953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674746
39242	NC_002932	GAC	2	6	1829013	1829018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674746
39243	NC_002932	CAGC	2	8	1829036	1829043	25 %	0 %	25 %	50 %	21674746
39244	NC_002932	TGG	2	6	1829188	1829193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674746
39245	NC_002932	GGC	2	6	1829238	1829243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674746
39246	NC_002932	GA	4	8	1829265	1829272	50 %	0 %	50 %	0 %	21674746
39247	NC_002932	TTC	2	6	1829274	1829279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674746
39248	NC_002932	AGA	2	6	1829332	1829337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674746
39249	NC_002932	ACTG	2	8	1829417	1829424	25 %	25 %	25 %	25 %	21674746
39250	NC_002932	ACCT	2	8	1829442	1829449	25 %	25 %	0 %	50 %	21674746
39251	NC_002932	CAT	2	6	1829471	1829476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674746
39252	NC_002932	AAG	2	6	1829536	1829541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674746
39253	NC_002932	TGA	2	6	1829613	1829618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39254	NC_002932	T	7	7	1829622	1829628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39255	NC_002932	AGG	2	6	1829733	1829738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674747
39256	NC_002932	CA	3	6	1829752	1829757	50 %	0 %	0 %	50 %	21674747
39257	NC_002932	TCG	2	6	1829771	1829776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674747
39258	NC_002932	TTC	2	6	1829930	1829935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674747
39259	NC_002932	CGA	2	6	1829985	1829990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674747
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39261	NC_002932	GAA	2	6	1830227	1830232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674748
39262	NC_002932	GGC	2	6	1830242	1830247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674748
39263	NC_002932	TGC	2	6	1830275	1830280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674748
39264	NC_002932	CCT	2	6	1830347	1830352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674748
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39266	NC_002932	TAA	2	6	1830457	1830462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21674748
39267	NC_002932	ACAT	2	8	1830526	1830533	50 %	25 %	0 %	25 %	21674748
39268	NC_002932	ACCAAG	2	12	1830765	1830776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	21674748
39269	NC_002932	A	6	6	1830870	1830875	100 %	0 %	0 %	0 %	21674748
39270	NC_002932	T	6	6	1830899	1830904	0 %	100 %	0 %	0 %	21674748
39271	NC_002932	T	6	6	1830991	1830996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39272	NC_002932	GCCATT	2	12	1831023	1831034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39273	NC_002932	TCC	2	6	1831096	1831101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39274	NC_002932	TC	3	6	1831112	1831117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39275	NC_002932	CG	3	6	1831120	1831125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39276	NC_002932	TCA	2	6	1831137	1831142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674749
39277	NC_002932	T	6	6	1831172	1831177	0 %	100 %	0 %	0 %	21674749
39278	NC_002932	T	8	8	1831244	1831251	0 %	100 %	0 %	0 %	21674749
39279	NC_002932	GCC	2	6	1831264	1831269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674749
39280	NC_002932	GAT	2	6	1831276	1831281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674749
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39282	NC_002932	CAT	2	6	1831317	1831322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674749
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39285	NC_002932	GAG	2	6	1831399	1831404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674749
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39287	NC_002932	CGG	2	6	1831458	1831463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674749
39288	NC_002932	ATCGGC	2	12	1831534	1831545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21674750
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39296	NC_002932	A	7	7	1832051	1832057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39297	NC_002932	ACC	2	6	1832062	1832067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39298	NC_002932	GCA	2	6	1832185	1832190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674751
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39300	NC_002932	CGA	2	6	1832218	1832223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674751
39301	NC_002932	GTAC	2	8	1832290	1832297	25 %	25 %	25 %	25 %	21674751
39302	NC_002932	CCT	2	6	1832413	1832418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674751
39303	NC_002932	GGA	2	6	1832420	1832425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674751
39304	NC_002932	GATC	2	8	1832494	1832501	25 %	25 %	25 %	25 %	21674751
39305	NC_002932	GCA	2	6	1832536	1832541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674751
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39309	NC_002932	TGA	2	6	1832614	1832619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674751
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39320	NC_002932	CGA	2	6	1832971	1832976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674751
39321	NC_002932	CGT	2	6	1832989	1832994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674751
39322	NC_002932	GAG	2	6	1833006	1833011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674751
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39324	NC_002932	GCGA	2	8	1833182	1833189	25 %	0 %	50 %	25 %	21674751
39325	NC_002932	GGT	2	6	1833215	1833220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674751
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39327	NC_002932	TGCT	2	8	1833304	1833311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39328	NC_002932	TGAC	2	8	1833359	1833366	25 %	25 %	25 %	25 %	21674752
39329	NC_002932	GAA	2	6	1833374	1833379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674752
39330	NC_002932	AT	3	6	1833482	1833487	50 %	50 %	0 %	0 %	21674752
39331	NC_002932	TCT	2	6	1833566	1833571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674752
39332	NC_002932	GGCTCA	2	12	1833623	1833634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39333	NC_002932	GATTT	2	10	1833641	1833650	20 %	60 %	20 %	0 %	21674752
39334	NC_002932	ACC	2	6	1833665	1833670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674752
39335	NC_002932	TCAGTT	2	12	1833683	1833694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21674752
39336	NC_002932	T	6	6	1833707	1833712	0 %	100 %	0 %	0 %	21674752
39337	NC_002932	CT	3	6	1833752	1833757	0 %	50 %	0 %	50 %	21674752
39338	NC_002932	TTTC	2	8	1833784	1833791	0 %	75 %	0 %	25 %	21674752
39339	NC_002932	TCG	2	6	1833884	1833889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39340	NC_002932	TCT	2	6	1833954	1833959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674752
39341	NC_002932	CGA	2	6	1833962	1833967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39342	NC_002932	TGA	2	6	1833997	1834002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674752
39343	NC_002932	TCG	2	6	1834043	1834048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39344	NC_002932	TCA	2	6	1834053	1834058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674752
39345	NC_002932	GTC	2	6	1834078	1834083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39346	NC_002932	CTT	2	6	1834102	1834107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674752
39347	NC_002932	GCT	2	6	1834153	1834158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39348	NC_002932	TGG	2	6	1834168	1834173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674752
39349	NC_002932	TCA	2	6	1834238	1834243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674752
39350	NC_002932	TCT	2	6	1834257	1834262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674752
39351	NC_002932	GCG	2	6	1834264	1834269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674752
39352	NC_002932	TCG	2	6	1834272	1834277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674752
39353	NC_002932	CTC	2	6	1834294	1834299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674752
39354	NC_002932	CTC	2	6	1834339	1834344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674752
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39475	NC_002932	TGA	2	6	1840215	1840220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674760
39476	NC_002932	AGG	2	6	1840230	1840235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674760
39477	NC_002932	ACC	2	6	1840274	1840279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674760
39478	NC_002932	CAG	2	6	1840341	1840346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674760
39479	NC_002932	CGCC	2	8	1840402	1840409	0 %	0 %	25 %	75 %	21674760
39480	NC_002932	GCC	2	6	1840418	1840423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674760
39481	NC_002932	GCC	2	6	1840463	1840468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674760
39482	NC_002932	ATT	2	6	1840478	1840483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21674760
39483	NC_002932	CGA	2	6	1840492	1840497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674760
39484	NC_002932	GCA	2	6	1840522	1840527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674760
39485	NC_002932	CAG	2	6	1840547	1840552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39486	NC_002932	CTG	2	6	1840588	1840593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674761
39487	NC_002932	CCGCT	2	10	1840660	1840669	0 %	20 %	20 %	60 %	21674761
39488	NC_002932	TTG	2	6	1840721	1840726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674761
39489	NC_002932	CGC	2	6	1840758	1840763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674761
39490	NC_002932	GCC	2	6	1840844	1840849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674761
39491	NC_002932	CGAGG	2	10	1840877	1840886	20 %	0 %	60 %	20 %	21674761
39492	NC_002932	CGG	2	6	1840905	1840910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674761
39493	NC_002932	CCG	2	6	1840995	1841000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674761
39494	NC_002932	TTC	2	6	1841015	1841020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674761
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39496	NC_002932	AGC	2	6	1841132	1841137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674761
39497	NC_002932	TGC	2	6	1841139	1841144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674761
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39499	NC_002932	CGA	2	6	1841227	1841232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674761
39500	NC_002932	A	6	6	1841240	1841245	100 %	0 %	0 %	0 %	21674761

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