MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_002932	CGA	2	6	1684227	1684232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
36003	NC_002932	CAA	2	6	1684245	1684250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674591
36004	NC_002932	GAA	2	6	1684251	1684256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674591
36005	NC_002932	TGG	2	6	1684355	1684360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674591
36006	NC_002932	ACA	2	6	1684424	1684429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674591
36007	NC_002932	ATC	2	6	1684465	1684470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674591
36008	NC_002932	CGA	2	6	1684548	1684553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
36009	NC_002932	ATC	2	6	1684603	1684608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674591
36010	NC_002932	TCA	2	6	1684703	1684708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674591
36011	NC_002932	GCT	2	6	1684728	1684733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674591
36012	NC_002932	GCC	2	6	1684861	1684866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674591
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36014	NC_002932	CTGG	2	8	1684985	1684992	0 %	25 %	50 %	25 %	21674592
36015	NC_002932	GAA	2	6	1685029	1685034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674592
36016	NC_002932	A	6	6	1685033	1685038	100 %	0 %	0 %	0 %	21674592
36017	NC_002932	ATCG	2	8	1685053	1685060	25 %	25 %	25 %	25 %	21674592
36018	NC_002932	CGA	2	6	1685080	1685085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674592
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36022	NC_002932	CGCC	2	8	1685173	1685180	0 %	0 %	25 %	75 %	21674592
36023	NC_002932	CAT	2	6	1685206	1685211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674592
36024	NC_002932	CGA	2	6	1685212	1685217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674592
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36027	NC_002932	AGAAAA	2	12	1685301	1685312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21674592
36028	NC_002932	A	6	6	1685309	1685314	100 %	0 %	0 %	0 %	21674592
36029	NC_002932	TCA	2	6	1685316	1685321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674592
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36031	NC_002932	CAAAA	2	10	1685435	1685444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36032	NC_002932	AACC	2	8	1685450	1685457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36033	NC_002932	ATGTTC	2	12	1685567	1685578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21674593
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36036	NC_002932	CTCGAT	2	12	1685761	1685772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21674593
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36039	NC_002932	CGGCG	2	10	1685865	1685874	0 %	0 %	60 %	40 %	21674593
36040	NC_002932	GCC	2	6	1686029	1686034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674593
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36044	NC_002932	A	8	8	1686280	1686287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36045	NC_002932	T	6	6	1686306	1686311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36050	NC_002932	GTA	2	6	1686455	1686460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674594
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36052	NC_002932	CTC	2	6	1686497	1686502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674594
36053	NC_002932	CTG	2	6	1686524	1686529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674594
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36063	NC_002932	CAT	2	6	1687121	1687126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674594
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36101	NC_002932	AAG	2	6	1689111	1689116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36102	NC_002932	CGC	2	6	1689152	1689157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36103	NC_002932	TCG	2	6	1689249	1689254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674598
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36105	NC_002932	GC	3	6	1689391	1689396	0 %	0 %	50 %	50 %	21674598
36106	NC_002932	AGA	2	6	1689483	1689488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674598
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36108	NC_002932	CAA	2	6	1689520	1689525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674598
36109	NC_002932	ATCTC	2	10	1689591	1689600	20 %	40 %	0 %	40 %	21674598
36110	NC_002932	GC	3	6	1689602	1689607	0 %	0 %	50 %	50 %	21674598
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36116	NC_002932	GCTC	2	8	1689909	1689916	0 %	25 %	25 %	50 %	21674598
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36118	NC_002932	ATC	2	6	1690001	1690006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674598
36119	NC_002932	CAA	2	6	1690048	1690053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674598
36120	NC_002932	AGA	2	6	1690167	1690172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674598
36121	NC_002932	AGA	2	6	1690224	1690229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674598
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36123	NC_002932	CTT	2	6	1690357	1690362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674598
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36126	NC_002932	GCTG	2	8	1690535	1690542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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36230	NC_002932	CCG	2	6	1696065	1696070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674604
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36232	NC_002932	GAT	2	6	1696121	1696126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674604
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36463	NC_002932	AAC	2	6	1705479	1705484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36464	NC_002932	CA	3	6	1705499	1705504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36465	NC_002932	CACTT	2	10	1705518	1705527	20 %	40 %	0 %	40 %	21674615
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36471	NC_002932	AGCG	2	8	1705890	1705897	25 %	0 %	50 %	25 %	21674615
36472	NC_002932	CGA	2	6	1705947	1705952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674615
36473	NC_002932	GGCG	2	8	1706124	1706131	0 %	0 %	75 %	25 %	21674615
36474	NC_002932	GCC	2	6	1706164	1706169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674615
36475	NC_002932	GCC	2	6	1706290	1706295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674615
36476	NC_002932	ACT	2	6	1706297	1706302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674615
36477	NC_002932	ACG	2	6	1706353	1706358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674615
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36479	NC_002932	ACG	2	6	1706494	1706499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674616
36480	NC_002932	AAAGG	2	10	1706523	1706532	60 %	0 %	40 %	0 %	21674616
36481	NC_002932	CAGC	2	8	1706569	1706576	25 %	0 %	25 %	50 %	21674616
36482	NC_002932	ATC	2	6	1706588	1706593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674616
36483	NC_002932	GTC	2	6	1706599	1706604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674616
36484	NC_002932	GCCG	2	8	1706634	1706641	0 %	0 %	50 %	50 %	21674616
36485	NC_002932	GTG	2	6	1706677	1706682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674616
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36491	NC_002932	AC	3	6	1706918	1706923	50 %	0 %	0 %	50 %	21674617
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36494	NC_002932	T	7	7	1707132	1707138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36496	NC_002932	T	8	8	1707245	1707252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36497	NC_002932	TAACCA	2	12	1707286	1707297	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36498	NC_002932	T	8	8	1707307	1707314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36499	NC_002932	TTGCC	2	10	1707321	1707330	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36500	NC_002932	ACCG	2	8	1707344	1707351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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