MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_002932	AAC	2	6	1661994	1661999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674568
35503	NC_002932	TCT	2	6	1662058	1662063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674568
35504	NC_002932	CCG	2	6	1662067	1662072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674568
35505	NC_002932	GAA	2	6	1662173	1662178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674568
35506	NC_002932	GCGA	2	8	1662255	1662262	25 %	0 %	50 %	25 %	21674568
35507	NC_002932	CG	3	6	1662280	1662285	0 %	0 %	50 %	50 %	21674568
35508	NC_002932	CTGGTA	2	12	1662305	1662316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21674568
35509	NC_002932	GTG	3	9	1662327	1662335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674568
35510	NC_002932	ACC	2	6	1662404	1662409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674568
35511	NC_002932	CTT	2	6	1662483	1662488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674568
35512	NC_002932	GTC	2	6	1662492	1662497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35513	NC_002932	CCGAA	2	10	1662613	1662622	40 %	0 %	20 %	40 %	21674568
35514	NC_002932	GTC	2	6	1662632	1662637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35515	NC_002932	GAT	2	6	1662653	1662658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674568
35516	NC_002932	TGTC	2	8	1662736	1662743	0 %	50 %	25 %	25 %	21674568
35517	NC_002932	CCA	2	6	1662745	1662750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674568
35518	NC_002932	ACC	2	6	1662789	1662794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674568
35519	NC_002932	TGC	2	6	1662808	1662813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35520	NC_002932	TCG	2	6	1662940	1662945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35521	NC_002932	GTC	2	6	1662954	1662959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35522	NC_002932	GTG	2	6	1662960	1662965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674568
35523	NC_002932	CGT	2	6	1663000	1663005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35524	NC_002932	TGC	2	6	1663036	1663041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35525	NC_002932	CGAG	2	8	1663165	1663172	25 %	0 %	50 %	25 %	21674568
35526	NC_002932	CCG	2	6	1663191	1663196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674568
35527	NC_002932	GTC	2	6	1663259	1663264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35528	NC_002932	CCG	2	6	1663348	1663353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674568
35529	NC_002932	CCA	2	6	1663428	1663433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674568
35530	NC_002932	TCG	2	6	1663444	1663449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35531	NC_002932	TGA	2	6	1663459	1663464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674568
35532	NC_002932	TGA	2	6	1663468	1663473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674568
35533	NC_002932	CGC	2	6	1663474	1663479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674568
35534	NC_002932	CCGG	2	8	1663545	1663552	0 %	0 %	50 %	50 %	21674568
35535	NC_002932	GCT	2	6	1663625	1663630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674568
35536	NC_002932	CCGT	2	8	1663661	1663668	0 %	25 %	25 %	50 %	21674568
35537	NC_002932	TCC	2	6	1663692	1663697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674568
35538	NC_002932	CT	3	6	1663734	1663739	0 %	50 %	0 %	50 %	21674568
35539	NC_002932	GAT	2	6	1663883	1663888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674568
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35542	NC_002932	ATC	2	6	1664001	1664006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674568
35543	NC_002932	GTC	2	6	1664126	1664131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674569
35544	NC_002932	GCC	2	6	1664149	1664154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674569
35545	NC_002932	TGA	2	6	1664160	1664165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674569
35546	NC_002932	GAC	2	6	1664169	1664174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674569
35547	NC_002932	GTGG	2	8	1664203	1664210	0 %	25 %	75 %	0 %	21674569
35548	NC_002932	TCT	2	6	1664223	1664228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674569
35549	NC_002932	T	6	6	1664254	1664259	0 %	100 %	0 %	0 %	21674569
35550	NC_002932	CGAT	2	8	1664261	1664268	25 %	25 %	25 %	25 %	21674569
35551	NC_002932	TCG	2	6	1664285	1664290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674569
35552	NC_002932	GAC	2	6	1664296	1664301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674569
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35554	NC_002932	ATC	2	6	1664333	1664338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674569
35555	NC_002932	CGT	2	6	1664377	1664382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674569
35556	NC_002932	CGCC	2	8	1664397	1664404	0 %	0 %	25 %	75 %	21674569
35557	NC_002932	CAC	2	6	1664434	1664439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674569
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35562	NC_002932	CGAG	2	8	1664553	1664560	25 %	0 %	50 %	25 %	21674569
35563	NC_002932	CCAT	2	8	1664631	1664638	25 %	25 %	0 %	50 %	21674569
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35579	NC_002932	GGCGC	2	10	1665243	1665252	0 %	0 %	60 %	40 %	21674570
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35585	NC_002932	CAT	2	6	1665636	1665641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674570
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35604	NC_002932	CG	3	6	1666469	1666474	0 %	0 %	50 %	50 %	21674571
35605	NC_002932	GCC	2	6	1666478	1666483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674571
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35607	NC_002932	AGC	2	6	1666643	1666648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674571
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35609	NC_002932	GGGCA	2	10	1666733	1666742	20 %	0 %	60 %	20 %	21674571
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35613	NC_002932	GCTG	2	8	1666818	1666825	0 %	25 %	50 %	25 %	21674571
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35615	NC_002932	GAAA	2	8	1666975	1666982	75 %	0 %	25 %	0 %	21674572
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35617	NC_002932	CGG	2	6	1667084	1667089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674572
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35664	NC_002932	AGTA	2	8	1668855	1668862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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35733	NC_002932	GCTG	2	8	1671948	1671955	0 %	25 %	50 %	25 %	21674576
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35971	NC_002932	CGG	2	6	1682373	1682378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674588
35972	NC_002932	CAT	2	6	1682398	1682403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674588
35973	NC_002932	TTC	2	6	1682429	1682434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35974	NC_002932	GCT	2	6	1682480	1682485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35975	NC_002932	T	7	7	1682505	1682511	0 %	100 %	0 %	0 %	21674589
35976	NC_002932	ATC	2	6	1682627	1682632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674589
35977	NC_002932	TCGT	2	8	1682778	1682785	0 %	50 %	25 %	25 %	21674590
35978	NC_002932	T	7	7	1682788	1682794	0 %	100 %	0 %	0 %	21674590
35979	NC_002932	CGA	2	6	1682861	1682866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674590
35980	NC_002932	TCCA	2	8	1682887	1682894	25 %	25 %	0 %	50 %	21674590
35981	NC_002932	TGC	2	6	1682936	1682941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674590
35982	NC_002932	TCC	2	6	1682947	1682952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674590
35983	NC_002932	CCA	2	6	1683121	1683126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674590
35984	NC_002932	TGCGT	2	10	1683183	1683192	0 %	40 %	40 %	20 %	21674590
35985	NC_002932	TTGC	2	8	1683233	1683240	0 %	50 %	25 %	25 %	21674590
35986	NC_002932	TTA	2	6	1683355	1683360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35987	NC_002932	TCA	2	6	1683422	1683427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35988	NC_002932	T	6	6	1683493	1683498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35989	NC_002932	T	6	6	1683511	1683516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35990	NC_002932	CAG	2	6	1683539	1683544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35991	NC_002932	GAC	2	6	1683595	1683600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
35992	NC_002932	CGC	2	6	1683653	1683658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674591
35993	NC_002932	CGA	2	6	1683780	1683785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
35994	NC_002932	GTG	2	6	1683808	1683813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674591
35995	NC_002932	CGG	2	6	1683816	1683821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674591
35996	NC_002932	GAC	2	6	1683900	1683905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
35997	NC_002932	CGA	2	6	1683912	1683917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674591
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