MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35006	NC_002932	AGGGAG	2	12	1639761	1639772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674545
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35010	NC_002932	CG	3	6	1639874	1639879	0 %	0 %	50 %	50 %	21674545
35011	NC_002932	TGG	2	6	1639927	1639932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674545
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35235	NC_002932	AAC	2	6	1649282	1649287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35239	NC_002932	GGC	2	6	1649518	1649523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674552
35240	NC_002932	GCC	3	9	1649538	1649546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674552
35241	NC_002932	TCG	2	6	1649551	1649556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674552
35242	NC_002932	GAT	2	6	1649586	1649591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674552
35243	NC_002932	GGCAAT	2	12	1649607	1649618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21674552
35244	NC_002932	AT	3	6	1649713	1649718	50 %	50 %	0 %	0 %	21674552
35245	NC_002932	AGC	2	6	1649797	1649802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674552
35246	NC_002932	GC	3	6	1649813	1649818	0 %	0 %	50 %	50 %	21674552
35247	NC_002932	AGC	2	6	1649869	1649874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674552
35248	NC_002932	CCT	2	6	1649927	1649932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674552
35249	NC_002932	GCC	2	6	1649987	1649992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674552
35250	NC_002932	GGC	2	6	1650012	1650017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674552
35251	NC_002932	GCC	2	6	1650020	1650025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674552
35252	NC_002932	GCA	2	6	1650065	1650070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674552
35253	NC_002932	T	6	6	1650095	1650100	0 %	100 %	0 %	0 %	21674552
35254	NC_002932	CCG	2	6	1650232	1650237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674552
35255	NC_002932	CGA	2	6	1650370	1650375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674553
35256	NC_002932	GAG	3	9	1650399	1650407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674553
35257	NC_002932	ACC	2	6	1650438	1650443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674553
35258	NC_002932	CATCG	2	10	1650482	1650491	20 %	20 %	20 %	40 %	21674553
35259	NC_002932	A	6	6	1650531	1650536	100 %	0 %	0 %	0 %	21674553
35260	NC_002932	GAT	2	6	1650632	1650637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674553
35261	NC_002932	AGC	2	6	1650663	1650668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674553
35262	NC_002932	CGG	2	6	1650730	1650735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674553
35263	NC_002932	T	7	7	1650778	1650784	0 %	100 %	0 %	0 %	21674553
35264	NC_002932	GAT	2	6	1650796	1650801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35265	NC_002932	CGCC	2	8	1650836	1650843	0 %	0 %	25 %	75 %	21674554
35266	NC_002932	A	6	6	1650959	1650964	100 %	0 %	0 %	0 %	21674554
35267	NC_002932	CTC	2	6	1651002	1651007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674554
35268	NC_002932	CTC	2	6	1651023	1651028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674554
35269	NC_002932	ATG	2	6	1651030	1651035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674554
35270	NC_002932	GAT	2	6	1651085	1651090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674554
35271	NC_002932	TCG	2	6	1651121	1651126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674554
35272	NC_002932	GGCG	2	8	1651134	1651141	0 %	0 %	75 %	25 %	21674554
35273	NC_002932	TGAT	2	8	1651189	1651196	25 %	50 %	25 %	0 %	21674554
35274	NC_002932	TGA	2	6	1651308	1651313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674555
35275	NC_002932	GTG	2	6	1651337	1651342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674555
35276	NC_002932	CTG	2	6	1651379	1651384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674555
35277	NC_002932	CCT	2	6	1651417	1651422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674555
35278	NC_002932	GCCC	2	8	1651440	1651447	0 %	0 %	25 %	75 %	21674555
35279	NC_002932	TGA	2	6	1651459	1651464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674555
35280	NC_002932	GCA	2	6	1651477	1651482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674555
35281	NC_002932	CTC	3	9	1651499	1651507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674555
35282	NC_002932	TGC	2	6	1651509	1651514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674555
35283	NC_002932	GGA	2	6	1651531	1651536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674555
35284	NC_002932	AGT	2	6	1651549	1651554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674555
35285	NC_002932	CGC	2	6	1651622	1651627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674555
35286	NC_002932	AGC	2	6	1651632	1651637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674555
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35288	NC_002932	TCC	2	6	1651743	1651748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674555
35289	NC_002932	A	6	6	1651764	1651769	100 %	0 %	0 %	0 %	21674555
35290	NC_002932	GCTGT	2	10	1651773	1651782	0 %	40 %	40 %	20 %	21674555
35291	NC_002932	GAAT	2	8	1651893	1651900	50 %	25 %	25 %	0 %	21674555
35292	NC_002932	CCT	2	6	1651960	1651965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35293	NC_002932	A	8	8	1652003	1652010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35294	NC_002932	CGC	2	6	1652079	1652084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674556
35295	NC_002932	GCT	2	6	1652118	1652123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674556
35296	NC_002932	CAC	2	6	1652125	1652130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674556
35297	NC_002932	TCGAC	2	10	1652163	1652172	20 %	20 %	20 %	40 %	21674556
35298	NC_002932	CGA	2	6	1652176	1652181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674556
35299	NC_002932	GCTCC	2	10	1652221	1652230	0 %	20 %	20 %	60 %	21674556
35300	NC_002932	T	6	6	1652285	1652290	0 %	100 %	0 %	0 %	21674556
35301	NC_002932	ATC	2	6	1652357	1652362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674556
35302	NC_002932	CGATTC	2	12	1652376	1652387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35303	NC_002932	A	6	6	1652393	1652398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35304	NC_002932	CTT	2	6	1652407	1652412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35305	NC_002932	TCA	2	6	1652413	1652418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35306	NC_002932	CTTTC	2	10	1652440	1652449	0 %	60 %	0 %	40 %	21674557
35307	NC_002932	CAG	2	6	1652506	1652511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35308	NC_002932	CGC	2	6	1652527	1652532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674557
35309	NC_002932	C	6	6	1652550	1652555	0 %	0 %	0 %	100 %	21674557
35310	NC_002932	GTC	2	6	1652603	1652608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35311	NC_002932	GGTT	2	8	1652637	1652644	0 %	50 %	50 %	0 %	21674557
35312	NC_002932	CACG	2	8	1652671	1652678	25 %	0 %	25 %	50 %	21674557
35313	NC_002932	CACC	2	8	1652715	1652722	25 %	0 %	0 %	75 %	21674557
35314	NC_002932	CTTC	2	8	1652943	1652950	0 %	50 %	0 %	50 %	21674557
35315	NC_002932	GTT	2	6	1652962	1652967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674557
35316	NC_002932	CCT	2	6	1652985	1652990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674557
35317	NC_002932	TTC	2	6	1653032	1653037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674557
35318	NC_002932	CAC	2	6	1653160	1653165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674557
35319	NC_002932	GGC	2	6	1653263	1653268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674557
35320	NC_002932	ATG	2	6	1653275	1653280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674557
35321	NC_002932	GCC	2	6	1653401	1653406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674557
35322	NC_002932	TCA	3	9	1653456	1653464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674557
35323	NC_002932	ATG	2	6	1653470	1653475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674557
35324	NC_002932	TCG	2	6	1653485	1653490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35325	NC_002932	GCGG	2	8	1653499	1653506	0 %	0 %	75 %	25 %	21674557
35326	NC_002932	AGCCGA	2	12	1653528	1653539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35327	NC_002932	CG	3	6	1653607	1653612	0 %	0 %	50 %	50 %	21674557
35328	NC_002932	CGC	2	6	1653708	1653713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674557
35329	NC_002932	AGC	2	6	1653719	1653724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35330	NC_002932	AAGA	2	8	1653868	1653875	75 %	0 %	25 %	0 %	21674557
35331	NC_002932	GCC	2	6	1653959	1653964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674557
35332	NC_002932	ATC	2	6	1654018	1654023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674557
35333	NC_002932	CTC	2	6	1654051	1654056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674557
35334	NC_002932	AGC	2	6	1654115	1654120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35335	NC_002932	CGG	2	6	1654187	1654192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674557
35336	NC_002932	CGC	2	6	1654195	1654200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674557
35337	NC_002932	CCA	2	6	1654311	1654316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674557
35338	NC_002932	AGC	2	6	1654337	1654342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35339	NC_002932	GAC	2	6	1654343	1654348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35340	NC_002932	TTC	2	6	1654378	1654383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674557
35341	NC_002932	CCA	3	9	1654407	1654415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674557
35342	NC_002932	AGG	2	6	1654433	1654438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674557
35343	NC_002932	TCGG	2	8	1654459	1654466	0 %	25 %	50 %	25 %	21674557
35344	NC_002932	CGA	2	6	1654479	1654484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35345	NC_002932	ACA	2	6	1654490	1654495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674557
35346	NC_002932	ACG	2	6	1654551	1654556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35347	NC_002932	TCG	2	6	1654692	1654697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674557
35348	NC_002932	CAC	2	6	1654720	1654725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674557
35349	NC_002932	GTT	2	6	1654773	1654778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674557
35350	NC_002932	CAT	2	6	1654795	1654800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674557
35351	NC_002932	CCT	2	6	1654805	1654810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674558
35352	NC_002932	TTCAG	2	10	1655005	1655014	20 %	40 %	20 %	20 %	21674558
35353	NC_002932	ATG	2	6	1655023	1655028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674558
35354	NC_002932	CCT	2	6	1655033	1655038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674559
35355	NC_002932	TGCACC	2	12	1655088	1655099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21674559
35356	NC_002932	ATG	2	6	1655201	1655206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674559
35357	NC_002932	CAT	2	6	1655230	1655235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674559
35358	NC_002932	TGA	2	6	1655254	1655259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674559
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35452	NC_002932	GA	4	8	1659547	1659554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35453	NC_002932	T	6	6	1659576	1659581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35455	NC_002932	AT	3	6	1659670	1659675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35456	NC_002932	A	7	7	1659722	1659728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35473	NC_002932	CGG	2	6	1660669	1660674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35474	NC_002932	CCG	2	6	1660687	1660692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35475	NC_002932	GAC	2	6	1660815	1660820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35476	NC_002932	TCA	2	6	1660930	1660935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35477	NC_002932	ACG	2	6	1661012	1661017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674566
35478	NC_002932	CG	3	6	1661021	1661026	0 %	0 %	50 %	50 %	21674566
35479	NC_002932	CGC	2	6	1661067	1661072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674566
35480	NC_002932	CTC	2	6	1661079	1661084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674566
35481	NC_002932	CTT	2	6	1661088	1661093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674566
35482	NC_002932	CAG	2	6	1661115	1661120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674566
35483	NC_002932	ACA	2	6	1661190	1661195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674566
35484	NC_002932	CT	4	8	1661221	1661228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35485	NC_002932	CTC	2	6	1661285	1661290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35486	NC_002932	CGGCG	2	10	1661333	1661342	0 %	0 %	60 %	40 %	21674567
35487	NC_002932	GCC	2	6	1661429	1661434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674567
35488	NC_002932	GTA	2	6	1661555	1661560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674567
35489	NC_002932	CGC	2	6	1661563	1661568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674567
35490	NC_002932	CG	3	6	1661572	1661577	0 %	0 %	50 %	50 %	21674567
35491	NC_002932	CAC	2	6	1661588	1661593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674567
35492	NC_002932	AGC	2	6	1661619	1661624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674567
35493	NC_002932	CTC	2	6	1661637	1661642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674567
35494	NC_002932	TCC	2	6	1661707	1661712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674567
35495	NC_002932	CCA	2	6	1661746	1661751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674567
35496	NC_002932	CTGC	2	8	1661794	1661801	0 %	25 %	25 %	50 %	21674567
35497	NC_002932	AGA	2	6	1661835	1661840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674567
35498	NC_002932	GTC	2	6	1661871	1661876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674567
35499	NC_002932	ACC	2	6	1661900	1661905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674568
35500	NC_002932	GTT	2	6	1661939	1661944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674568

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