MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002932	A	7	7	139309	139315	100 %	0 %	0 %	0 %	21672984
3002	NC_002932	A	6	6	139320	139325	100 %	0 %	0 %	0 %	21672984
3003	NC_002932	A	6	6	139342	139347	100 %	0 %	0 %	0 %	21672984
3004	NC_002932	ATC	2	6	139369	139374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_002932	TTG	2	6	139394	139399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_002932	GGC	2	6	139524	139529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_002932	GAT	2	6	139656	139661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_002932	TGT	2	6	139682	139687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_002932	ACG	2	6	139759	139764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_002932	GAT	2	6	139782	139787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_002932	GCA	2	6	139831	139836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_002932	GCA	2	6	139871	139876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_002932	CGC	2	6	139878	139883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_002932	GAT	2	6	139887	139892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_002932	TTC	2	6	139897	139902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_002932	CAG	2	6	139991	139996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_002932	GAA	2	6	140441	140446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_002932	CCT	2	6	140476	140481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_002932	AGGG	2	8	140485	140492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_002932	TGC	2	6	140515	140520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_002932	GTC	2	6	140527	140532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_002932	TCGTG	2	10	140536	140545	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3023	NC_002932	AG	3	6	140639	140644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_002932	GAGG	2	8	140645	140652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_002932	CA	3	6	140691	140696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_002932	A	6	6	140749	140754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_002932	GTC	2	6	140755	140760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_002932	AC	3	6	140858	140863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_002932	CG	3	6	140905	140910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_002932	CCT	2	6	140981	140986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_002932	CAA	2	6	141070	141075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002932	TTGTA	2	10	141079	141088	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_002932	CAG	2	6	141215	141220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_002932	A	7	7	141240	141246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_002932	GTT	3	9	141250	141258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_002932	T	6	6	141361	141366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_002932	TCA	2	6	141443	141448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_002932	ATA	2	6	141449	141454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_002932	AAG	2	6	141501	141506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_002932	GGA	2	6	141654	141659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_002932	AGT	2	6	141684	141689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_002932	GCGA	2	8	141691	141698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_002932	AGCG	2	8	141765	141772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_002932	AAG	2	6	141802	141807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_002932	AGG	2	6	141842	141847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_002932	TG	3	6	141878	141883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_002932	CT	3	6	141916	141921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_002932	AAG	2	6	141972	141977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_002932	GT	3	6	142085	142090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_002932	AAC	2	6	142475	142480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_002932	AGC	2	6	142567	142572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_002932	ATA	2	6	142623	142628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_002932	GTG	2	6	142642	142647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_002932	ATC	2	6	142831	142836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_002932	TTA	2	6	142921	142926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_002932	CGGA	2	8	142962	142969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_002932	GTG	2	6	142971	142976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_002932	TCA	2	6	143016	143021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_002932	CT	3	6	143089	143094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_002932	GAC	2	6	143097	143102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_002932	CCGTA	2	10	143112	143121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3062	NC_002932	TC	3	6	143277	143282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_002932	CGG	2	6	143390	143395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_002932	GC	3	6	143489	143494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_002932	ACC	2	6	143662	143667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_002932	CGA	2	6	143692	143697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_002932	CCT	2	6	143750	143755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_002932	GGT	2	6	143886	143891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_002932	CCG	2	6	143953	143958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_002932	TCA	2	6	144001	144006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_002932	CGT	2	6	144081	144086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_002932	AGT	2	6	144347	144352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_002932	TAA	2	6	144355	144360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_002932	T	6	6	144378	144383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_002932	ATT	2	6	144384	144389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_002932	GTC	2	6	144587	144592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_002932	CA	3	6	144608	144613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_002932	TCA	2	6	144624	144629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_002932	GCA	2	6	144689	144694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_002932	TGA	2	6	144695	144700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_002932	GAT	2	6	144701	144706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_002932	TGC	2	6	144710	144715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_002932	T	9	9	144724	144732	0 %	100 %	0 %	0 %	21672985
3084	NC_002932	CTT	2	6	144784	144789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672985
3085	NC_002932	TGA	2	6	144889	144894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3086	NC_002932	GGC	2	6	145061	145066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672985
3087	NC_002932	GAT	2	6	145099	145104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3088	NC_002932	ACC	2	6	145119	145124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672985
3089	NC_002932	CGAT	2	8	145168	145175	25 %	25 %	25 %	25 %	21672985
3090	NC_002932	CCG	2	6	145195	145200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672985
3091	NC_002932	CGC	2	6	145222	145227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672985
3092	NC_002932	GGCCGC	2	12	145303	145314	0 %	0 %	50 %	50 %	21672985
3093	NC_002932	CTACCT	2	12	145390	145401	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21672985
3094	NC_002932	TGA	3	9	145429	145437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3095	NC_002932	CAT	2	6	145489	145494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672985
3096	NC_002932	TCT	2	6	145515	145520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672985
3097	NC_002932	CGG	2	6	145540	145545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672985
3098	NC_002932	TCT	2	6	145549	145554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672985
3099	NC_002932	TCG	2	6	145557	145562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672985
3100	NC_002932	GAG	2	6	145587	145592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672985
3101	NC_002932	GAT	2	6	145610	145615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3102	NC_002932	ACC	2	6	145683	145688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672985
3103	NC_002932	CAG	2	6	145706	145711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672985
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3105	NC_002932	TCGGGA	2	12	145899	145910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21672985
3106	NC_002932	GCA	2	6	145912	145917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672985
3107	NC_002932	TCG	2	6	145923	145928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672985
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3110	NC_002932	GAA	2	6	146123	146128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672985
3111	NC_002932	TCA	2	6	146134	146139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672985
3112	NC_002932	CTC	2	6	146141	146146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672985
3113	NC_002932	TGC	2	6	146233	146238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672985
3114	NC_002932	TCA	2	6	146269	146274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672985
3115	NC_002932	TGG	2	6	146295	146300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672985
3116	NC_002932	CTC	2	6	146309	146314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672985
3117	NC_002932	CG	3	6	146387	146392	0 %	0 %	50 %	50 %	21672985
3118	NC_002932	GTA	2	6	146432	146437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3119	NC_002932	ATA	2	6	146574	146579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672985
3120	NC_002932	TCT	3	9	146584	146592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672985
3121	NC_002932	TC	3	6	146636	146641	0 %	50 %	0 %	50 %	21672985
3122	NC_002932	TCG	2	6	146646	146651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672985
3123	NC_002932	TGC	2	6	146686	146691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672985
3124	NC_002932	TGA	2	6	146701	146706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672985
3125	NC_002932	GATT	2	8	146828	146835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_002932	GCC	2	6	146844	146849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_002932	A	7	7	146924	146930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_002932	TTC	2	6	147032	147037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_002932	GTCA	2	8	147063	147070	25 %	25 %	25 %	25 %	21672986
3130	NC_002932	TGC	2	6	147159	147164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672986
3131	NC_002932	GCG	2	6	147173	147178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672986
3132	NC_002932	GACAAG	2	12	147214	147225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21672986
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3139	NC_002932	CGA	2	6	147666	147671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672986
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3141	NC_002932	GTCAT	2	10	147791	147800	20 %	40 %	20 %	20 %	21672986
3142	NC_002932	ACG	2	6	147833	147838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672986
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3144	NC_002932	TCC	2	6	147868	147873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672986
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3148	NC_002932	ATGGC	2	10	147953	147962	20 %	20 %	40 %	20 %	21672986
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3152	NC_002932	TCA	2	6	148181	148186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672986
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3159	NC_002932	CCT	2	6	148530	148535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672987
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3162	NC_002932	TCAT	2	8	148847	148854	25 %	50 %	0 %	25 %	21672988
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3221	NC_002932	T	6	6	151958	151963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_002932	GCT	2	6	152005	152010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3228	NC_002932	ATC	2	6	152263	152268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3230	NC_002932	CCT	2	6	152356	152361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3231	NC_002932	GCAG	2	8	152367	152374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3232	NC_002932	GAA	2	6	152423	152428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672990
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3234	NC_002932	TGT	2	6	152462	152467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672990
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3240	NC_002932	A	8	8	152649	152656	100 %	0 %	0 %	0 %	21672991
3241	NC_002932	GGT	2	6	152657	152662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672991
3242	NC_002932	AG	3	6	152735	152740	50 %	0 %	50 %	0 %	21672991
3243	NC_002932	TCG	2	6	152812	152817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672991
3244	NC_002932	GAT	2	6	152952	152957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672991
3245	NC_002932	AGA	2	6	152989	152994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672991
3246	NC_002932	GGT	2	6	153029	153034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672991
3247	NC_002932	CTT	2	6	153152	153157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672991
3248	NC_002932	CCGA	2	8	153171	153178	25 %	0 %	25 %	50 %	21672991
3249	NC_002932	ATTC	2	8	153238	153245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3250	NC_002932	AG	3	6	153257	153262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_002932	A	6	6	153275	153280	100 %	0 %	0 %	0 %	21672992
3252	NC_002932	TCA	2	6	153292	153297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672992
3253	NC_002932	AGG	2	6	153314	153319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672992
3254	NC_002932	C	6	6	153333	153338	0 %	0 %	0 %	100 %	21672992
3255	NC_002932	ATC	2	6	153426	153431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672992
3256	NC_002932	CGC	2	6	153484	153489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672992
3257	NC_002932	GCC	2	6	153492	153497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672992
3258	NC_002932	AGG	2	6	153511	153516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672992
3259	NC_002932	CAA	2	6	153551	153556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672992
3260	NC_002932	GCA	2	6	153667	153672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672992
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3263	NC_002932	CAC	3	9	153854	153862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672993
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3266	NC_002932	GATG	2	8	154193	154200	25 %	25 %	50 %	0 %	21672993
3267	NC_002932	AGG	2	6	154216	154221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672993
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3284	NC_002932	AAT	2	6	155046	155051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672995
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3290	NC_002932	AGA	2	6	155211	155216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672995
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3297	NC_002932	CAACAC	2	12	155858	155869	50 %	0 %	0 %	50 %	21672996
3298	NC_002932	C	6	6	155908	155913	0 %	0 %	0 %	100 %	21672996
3299	NC_002932	AT	3	6	156057	156062	50 %	50 %	0 %	0 %	21672996
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3363	NC_002932	GTC	2	6	159083	159088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672996
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3366	NC_002932	GGGC	2	8	159236	159243	0 %	0 %	75 %	25 %	21672996
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3369	NC_002932	ACG	2	6	159383	159388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672996
3370	NC_002932	GGTT	2	8	159396	159403	0 %	50 %	50 %	0 %	21672996
3371	NC_002932	CGA	2	6	159435	159440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672996
3372	NC_002932	CAG	2	6	159484	159489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672996
3373	NC_002932	GA	3	6	159581	159586	50 %	0 %	50 %	0 %	21672996
3374	NC_002932	CGA	2	6	159735	159740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672996
3375	NC_002932	ATG	2	6	159755	159760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3377	NC_002932	AAG	2	6	159797	159802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3483	NC_002932	TTA	2	6	164806	164811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_002932	T	7	7	165683	165689	0 %	100 %	0 %	0 %	21672998

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