MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_002932	CGT	2	6	1521209	1521214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674433
32502	NC_002932	TCA	2	6	1521244	1521249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674433
32503	NC_002932	CTG	2	6	1521309	1521314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674433
32504	NC_002932	CCG	2	6	1521382	1521387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674433
32505	NC_002932	AAAC	2	8	1521405	1521412	75 %	0 %	0 %	25 %	21674433
32506	NC_002932	ACC	2	6	1521418	1521423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674433
32507	NC_002932	CCGGG	2	10	1521430	1521439	0 %	0 %	60 %	40 %	21674433
32508	NC_002932	GCA	2	6	1521562	1521567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674433
32509	NC_002932	GACA	2	8	1521569	1521576	50 %	0 %	25 %	25 %	21674433
32510	NC_002932	CCG	2	6	1521604	1521609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674433
32511	NC_002932	AGG	2	6	1521682	1521687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674433
32512	NC_002932	TCC	2	6	1521742	1521747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674433
32513	NC_002932	CCT	2	6	1521748	1521753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674433
32514	NC_002932	AGG	2	6	1521772	1521777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674433
32515	NC_002932	ACC	2	6	1521786	1521791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674433
32516	NC_002932	CTT	2	6	1521855	1521860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32517	NC_002932	CA	4	8	1521881	1521888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32518	NC_002932	GGC	2	6	1521990	1521995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674434
32519	NC_002932	A	6	6	1522095	1522100	100 %	0 %	0 %	0 %	21674434
32520	NC_002932	AGA	3	9	1522115	1522123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674434
32521	NC_002932	TTC	2	6	1522145	1522150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674434
32522	NC_002932	CAG	2	6	1522239	1522244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32523	NC_002932	CATC	2	8	1522310	1522317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32524	NC_002932	GTC	2	6	1522323	1522328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674435
32525	NC_002932	TGC	2	6	1522343	1522348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674435
32526	NC_002932	CTT	2	6	1522390	1522395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674435
32527	NC_002932	GAC	2	6	1522414	1522419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674435
32528	NC_002932	AATG	2	8	1522428	1522435	50 %	25 %	25 %	0 %	21674435
32529	NC_002932	GCG	2	6	1522463	1522468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32530	NC_002932	GCAC	2	8	1522567	1522574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32531	NC_002932	T	6	6	1522620	1522625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32532	NC_002932	CCG	2	6	1522650	1522655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32533	NC_002932	CGA	2	6	1522716	1522721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32534	NC_002932	GGT	2	6	1522836	1522841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674436
32535	NC_002932	CGG	2	6	1522881	1522886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674436
32536	NC_002932	CGA	2	6	1522917	1522922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32537	NC_002932	GCG	2	6	1522956	1522961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674436
32538	NC_002932	GCT	2	6	1522988	1522993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674436
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32541	NC_002932	TCG	2	6	1523048	1523053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32542	NC_002932	ACC	2	6	1523072	1523077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674436
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32544	NC_002932	AACG	2	8	1523206	1523213	50 %	0 %	25 %	25 %	21674436
32545	NC_002932	TCG	2	6	1523282	1523287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674436
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32548	NC_002932	CT	3	6	1523410	1523415	0 %	50 %	0 %	50 %	21674436
32549	NC_002932	CGG	2	6	1523417	1523422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674436
32550	NC_002932	GCGCG	2	10	1523484	1523493	0 %	0 %	60 %	40 %	21674436
32551	NC_002932	GAG	2	6	1523506	1523511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674436
32552	NC_002932	TCG	2	6	1523522	1523527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32553	NC_002932	CGA	2	6	1523631	1523636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32554	NC_002932	GGCG	2	8	1523691	1523698	0 %	0 %	75 %	25 %	21674436
32555	NC_002932	GAC	2	6	1523703	1523708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32556	NC_002932	TCGGCG	2	12	1523746	1523757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21674436
32557	NC_002932	GCC	2	6	1523785	1523790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674436
32558	NC_002932	CAAC	2	8	1523960	1523967	50 %	0 %	0 %	50 %	21674436
32559	NC_002932	CGG	2	6	1524006	1524011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674436
32560	NC_002932	CG	3	6	1524020	1524025	0 %	0 %	50 %	50 %	21674436
32561	NC_002932	CGA	2	6	1524084	1524089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32562	NC_002932	GTCG	2	8	1524123	1524130	0 %	25 %	50 %	25 %	21674436
32563	NC_002932	CT	3	6	1524148	1524153	0 %	50 %	0 %	50 %	21674436
32564	NC_002932	GTC	2	6	1524223	1524228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674436
32565	NC_002932	CCTC	2	8	1524335	1524342	0 %	25 %	0 %	75 %	21674436
32566	NC_002932	T	8	8	1524436	1524443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32567	NC_002932	CAA	2	6	1524466	1524471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674437
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32569	NC_002932	A	6	6	1524566	1524571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32570	NC_002932	A	6	6	1524576	1524581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32571	NC_002932	GGC	2	6	1524582	1524587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32572	NC_002932	T	6	6	1524600	1524605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32573	NC_002932	CCA	2	6	1524680	1524685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674438
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32576	NC_002932	CGA	2	6	1524768	1524773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674438
32577	NC_002932	TGC	2	6	1524807	1524812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674438
32578	NC_002932	CTT	2	6	1524898	1524903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674438
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32580	NC_002932	TTC	2	6	1524956	1524961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674438
32581	NC_002932	GTC	2	6	1525031	1525036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674438
32582	NC_002932	CCCATG	2	12	1525220	1525231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21674438
32583	NC_002932	GATTT	2	10	1525262	1525271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32584	NC_002932	TCA	2	6	1525359	1525364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674439
32585	NC_002932	GA	3	6	1525367	1525372	50 %	0 %	50 %	0 %	21674439
32586	NC_002932	TTA	3	9	1525420	1525428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32587	NC_002932	TA	3	6	1525427	1525432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32588	NC_002932	A	8	8	1525500	1525507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32589	NC_002932	TAAA	2	8	1525565	1525572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32590	NC_002932	ACT	2	6	1525577	1525582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32591	NC_002932	AGG	2	6	1525629	1525634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32593	NC_002932	CGA	2	6	1525707	1525712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674440
32594	NC_002932	GCC	2	6	1525803	1525808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674440
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32596	NC_002932	CG	3	6	1525843	1525848	0 %	0 %	50 %	50 %	21674440
32597	NC_002932	GGCG	2	8	1525863	1525870	0 %	0 %	75 %	25 %	21674440
32598	NC_002932	CGTCGC	2	12	1525905	1525916	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21674440
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32601	NC_002932	GTG	2	6	1526110	1526115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674440
32602	NC_002932	AAG	2	6	1526116	1526121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674440
32603	NC_002932	CGC	2	6	1526126	1526131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674440
32604	NC_002932	GGC	2	6	1526200	1526205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674440
32605	NC_002932	GCT	2	6	1526217	1526222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674440
32606	NC_002932	ACC	2	6	1526264	1526269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674440
32607	NC_002932	GA	3	6	1526273	1526278	50 %	0 %	50 %	0 %	21674440
32608	NC_002932	CGCT	2	8	1526291	1526298	0 %	25 %	25 %	50 %	21674440
32609	NC_002932	CG	3	6	1526312	1526317	0 %	0 %	50 %	50 %	21674440
32610	NC_002932	CGC	2	6	1526319	1526324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674440
32611	NC_002932	CGG	2	6	1526349	1526354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674440
32612	NC_002932	GC	3	6	1526368	1526373	0 %	0 %	50 %	50 %	21674440
32613	NC_002932	AT	3	6	1526384	1526389	50 %	50 %	0 %	0 %	21674440
32614	NC_002932	AGC	2	6	1526408	1526413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674440
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32616	NC_002932	TTC	2	6	1526470	1526475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674440
32617	NC_002932	CCA	2	6	1526544	1526549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674440
32618	NC_002932	GGA	2	6	1526552	1526557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674440
32619	NC_002932	GAT	2	6	1526632	1526637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674440
32620	NC_002932	CGG	2	6	1526638	1526643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674440
32621	NC_002932	GCA	2	6	1526664	1526669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674440
32622	NC_002932	GCCGC	2	10	1526676	1526685	0 %	0 %	40 %	60 %	21674440
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32624	NC_002932	GTC	2	6	1526824	1526829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674440
32625	NC_002932	ACC	2	6	1526834	1526839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674440
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32627	NC_002932	CG	3	6	1527102	1527107	0 %	0 %	50 %	50 %	21674440
32628	NC_002932	TCCA	2	8	1527128	1527135	25 %	25 %	0 %	50 %	21674440
32629	NC_002932	CGC	2	6	1527136	1527141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674440
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32631	NC_002932	CG	3	6	1527222	1527227	0 %	0 %	50 %	50 %	21674440
32632	NC_002932	GCGG	2	8	1527337	1527344	0 %	0 %	75 %	25 %	21674440
32633	NC_002932	AGC	2	6	1527440	1527445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674440
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32640	NC_002932	GCG	2	6	1527775	1527780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674440
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32651	NC_002932	TCG	2	6	1528268	1528273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674440
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32665	NC_002932	CTTGC	2	10	1528840	1528849	0 %	40 %	20 %	40 %	21674440
32666	NC_002932	GAT	2	6	1528918	1528923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674440
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32687	NC_002932	TCG	2	6	1529960	1529965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674440
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32689	NC_002932	CTC	2	6	1530136	1530141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674440
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32693	NC_002932	A	7	7	1530234	1530240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32694	NC_002932	GAT	2	6	1530256	1530261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32695	NC_002932	CCGA	2	8	1530303	1530310	25 %	0 %	25 %	50 %	21674441
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32698	NC_002932	CTGT	2	8	1530342	1530349	0 %	50 %	25 %	25 %	21674441
32699	NC_002932	ATC	2	6	1530378	1530383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674441
32700	NC_002932	CGT	2	6	1530444	1530449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32701	NC_002932	T	6	6	1530461	1530466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32702	NC_002932	ATTCA	2	10	1530489	1530498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32703	NC_002932	TCT	2	6	1530536	1530541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32704	NC_002932	TCA	2	6	1530636	1530641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674442
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32707	NC_002932	TTC	2	6	1530713	1530718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674442
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32717	NC_002932	TAC	2	6	1530913	1530918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674442
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32720	NC_002932	ATC	2	6	1530988	1530993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674442
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32722	NC_002932	AGG	2	6	1531082	1531087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674442
32723	NC_002932	CGA	2	6	1531122	1531127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674442
32724	NC_002932	TGA	2	6	1531148	1531153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674442
32725	NC_002932	TGC	2	6	1531172	1531177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674442
32726	NC_002932	CGG	2	6	1531191	1531196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674442
32727	NC_002932	GGC	2	6	1531215	1531220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674442
32728	NC_002932	GGT	2	6	1531236	1531241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674442
32729	NC_002932	CAA	2	6	1531428	1531433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674442
32730	NC_002932	GATC	2	8	1531484	1531491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32731	NC_002932	CAAA	2	8	1531494	1531501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32732	NC_002932	A	6	6	1531499	1531504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32733	NC_002932	T	7	7	1531523	1531529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32734	NC_002932	AAG	2	6	1531541	1531546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32735	NC_002932	TCT	2	6	1531633	1531638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674443
32736	NC_002932	T	6	6	1531671	1531676	0 %	100 %	0 %	0 %	21674443
32737	NC_002932	TCT	2	6	1531685	1531690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674443
32738	NC_002932	GAT	2	6	1531692	1531697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674443
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32785	NC_002932	T	7	7	1534297	1534303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32974	NC_002932	CAT	2	6	1543157	1543162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674450
32975	NC_002932	GC	3	6	1543220	1543225	0 %	0 %	50 %	50 %	21674450
32976	NC_002932	TCG	2	6	1543240	1543245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674450
32977	NC_002932	GAA	2	6	1543322	1543327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674450
32978	NC_002932	GTG	2	6	1543426	1543431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32979	NC_002932	AGC	2	6	1543507	1543512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32980	NC_002932	TCA	2	6	1543550	1543555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674451
32981	NC_002932	GC	3	6	1543595	1543600	0 %	0 %	50 %	50 %	21674451
32982	NC_002932	TTG	2	6	1543604	1543609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674451
32983	NC_002932	TC	3	6	1543624	1543629	0 %	50 %	0 %	50 %	21674451
32984	NC_002932	CGG	2	6	1543641	1543646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674451
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