MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_002932	TGC	2	6	1498262	1498267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674408
32003	NC_002932	GCC	2	6	1498281	1498286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674408
32004	NC_002932	ATG	2	6	1498306	1498311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674408
32005	NC_002932	CTT	2	6	1498404	1498409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674408
32006	NC_002932	CAA	2	6	1498442	1498447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674408
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32014	NC_002932	TCA	2	6	1498889	1498894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674409
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32044	NC_002932	CG	3	6	1500101	1500106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32045	NC_002932	TAT	2	6	1500130	1500135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32118	NC_002932	A	7	7	1503093	1503099	100 %	0 %	0 %	0 %	21674412
32119	NC_002932	GAA	2	6	1503169	1503174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32120	NC_002932	TTC	3	9	1503185	1503193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32121	NC_002932	CAA	2	6	1503196	1503201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32122	NC_002932	ACC	2	6	1503272	1503277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674413
32123	NC_002932	TGA	2	6	1503290	1503295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674413
32124	NC_002932	GCC	2	6	1503333	1503338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674413
32125	NC_002932	GCA	2	6	1503395	1503400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674413
32126	NC_002932	GTG	2	6	1503516	1503521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674413
32127	NC_002932	GAT	2	6	1503531	1503536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674413
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32130	NC_002932	TGA	2	6	1503740	1503745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674413
32131	NC_002932	GCGG	2	8	1503746	1503753	0 %	0 %	75 %	25 %	21674413
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32138	NC_002932	ATTTAA	2	12	1504145	1504156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32139	NC_002932	TTC	2	6	1504187	1504192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32140	NC_002932	TCC	2	6	1504225	1504230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32141	NC_002932	CAC	2	6	1504273	1504278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32142	NC_002932	A	7	7	1504334	1504340	100 %	0 %	0 %	0 %	21674414
32143	NC_002932	TGG	2	6	1504356	1504361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674414
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32150	NC_002932	TCG	2	6	1504582	1504587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674414
32151	NC_002932	GGC	2	6	1504650	1504655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674414
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32154	NC_002932	GCCT	2	8	1504810	1504817	0 %	25 %	25 %	50 %	21674414
32155	NC_002932	ATC	2	6	1504854	1504859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674414
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32167	NC_002932	GACG	2	8	1505456	1505463	25 %	0 %	50 %	25 %	21674414
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32172	NC_002932	CATCAG	2	12	1505706	1505717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21674414
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32175	NC_002932	CG	3	6	1505823	1505828	0 %	0 %	50 %	50 %	21674414
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32192	NC_002932	GCC	2	6	1506479	1506484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674415
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32216	NC_002932	GC	3	6	1507693	1507698	0 %	0 %	50 %	50 %	21674416
32217	NC_002932	CCT	2	6	1507879	1507884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674416
32218	NC_002932	ACTC	2	8	1508002	1508009	25 %	25 %	0 %	50 %	21674416
32219	NC_002932	CTG	2	6	1508084	1508089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674416
32220	NC_002932	GCGG	2	8	1508152	1508159	0 %	0 %	75 %	25 %	21674416
32221	NC_002932	AG	3	6	1508350	1508355	50 %	0 %	50 %	0 %	21674417
32222	NC_002932	GCC	2	6	1508360	1508365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674417
32223	NC_002932	GGC	2	6	1508372	1508377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674417
32224	NC_002932	A	6	6	1508390	1508395	100 %	0 %	0 %	0 %	21674417
32225	NC_002932	TCG	2	6	1508398	1508403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674417
32226	NC_002932	CAT	2	6	1508500	1508505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674417
32227	NC_002932	CCA	3	9	1508699	1508707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32228	NC_002932	TCA	2	6	1508773	1508778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674419
32229	NC_002932	CGG	2	6	1508780	1508785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674419
32230	NC_002932	CTC	2	6	1508811	1508816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674419
32231	NC_002932	TGC	3	9	1508836	1508844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674419
32232	NC_002932	GCT	2	6	1508945	1508950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674419
32233	NC_002932	CTT	2	6	1508967	1508972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674419
32234	NC_002932	TGC	3	9	1509010	1509018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674419
32235	NC_002932	ACC	2	6	1509114	1509119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674419
32236	NC_002932	AGG	2	6	1509148	1509153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21674419
32237	NC_002932	TGAA	2	8	1509192	1509199	50 %	25 %	25 %	0 %	21674419
32238	NC_002932	CGT	2	6	1509213	1509218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32239	NC_002932	TGA	2	6	1509227	1509232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32240	NC_002932	CGG	2	6	1509335	1509340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674420
32241	NC_002932	CAA	2	6	1509417	1509422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674420
32242	NC_002932	CTG	2	6	1509434	1509439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32243	NC_002932	GCT	2	6	1509451	1509456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32244	NC_002932	CTG	2	6	1509473	1509478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32245	NC_002932	CAC	2	6	1509628	1509633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674420
32246	NC_002932	TCA	2	6	1509639	1509644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674420
32247	NC_002932	CGA	2	6	1509646	1509651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32248	NC_002932	CCA	2	6	1509666	1509671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674420
32249	NC_002932	TTG	2	6	1509737	1509742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674420
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32251	NC_002932	GCGCCA	2	12	1509876	1509887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21674420
32252	NC_002932	GTC	2	6	1509907	1509912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674420
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32254	NC_002932	CCA	2	6	1509978	1509983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674420
32255	NC_002932	GAT	2	6	1510039	1510044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674420
32256	NC_002932	CCAGC	2	10	1510057	1510066	20 %	0 %	20 %	60 %	21674420
32257	NC_002932	CAC	2	6	1510132	1510137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674420
32258	NC_002932	TTG	2	6	1510169	1510174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21674420
32259	NC_002932	AGC	2	6	1510181	1510186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674420
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32262	NC_002932	CGGT	2	8	1510277	1510284	0 %	25 %	50 %	25 %	21674420
32263	NC_002932	TCC	2	6	1510311	1510316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674420
32264	NC_002932	CAT	2	6	1510321	1510326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674420
32265	NC_002932	CGA	2	6	1510329	1510334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32266	NC_002932	CAC	2	6	1510354	1510359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674420
32267	NC_002932	CGA	2	6	1510420	1510425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674420
32268	NC_002932	TGG	2	6	1510443	1510448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674420
32269	NC_002932	ATC	3	9	1510451	1510459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674420
32270	NC_002932	ACCG	2	8	1510465	1510472	25 %	0 %	25 %	50 %	21674420
32271	NC_002932	TC	3	6	1510507	1510512	0 %	50 %	0 %	50 %	21674420
32272	NC_002932	AAGG	2	8	1510546	1510553	50 %	0 %	50 %	0 %	21674420
32273	NC_002932	TCA	2	6	1510595	1510600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32274	NC_002932	CAA	2	6	1510603	1510608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32275	NC_002932	CAA	2	6	1510657	1510662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32276	NC_002932	TAA	2	6	1510668	1510673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32277	NC_002932	AACT	2	8	1510693	1510700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32278	NC_002932	GAG	2	6	1510709	1510714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32279	NC_002932	AGC	2	6	1510717	1510722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32280	NC_002932	A	7	7	1510726	1510732	100 %	0 %	0 %	0 %	21674421
32281	NC_002932	GCG	2	6	1510760	1510765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674421
32282	NC_002932	TCA	2	6	1510778	1510783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674421
32283	NC_002932	CCT	2	6	1510860	1510865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674421
32284	NC_002932	CGA	2	6	1510890	1510895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674421
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32288	NC_002932	TCG	2	6	1511183	1511188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674421
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32290	NC_002932	GCG	2	6	1511276	1511281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674421
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32294	NC_002932	TCG	2	6	1511453	1511458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674421
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32299	NC_002932	TCG	2	6	1511591	1511596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674421
32300	NC_002932	GC	3	6	1511649	1511654	0 %	0 %	50 %	50 %	21674421
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32302	NC_002932	GCA	2	6	1511701	1511706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674421
32303	NC_002932	ATCG	2	8	1511841	1511848	25 %	25 %	25 %	25 %	21674421
32304	NC_002932	CTC	2	6	1512018	1512023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674422
32305	NC_002932	A	6	6	1512033	1512038	100 %	0 %	0 %	0 %	21674422
32306	NC_002932	AGA	2	6	1512057	1512062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674422
32307	NC_002932	T	7	7	1512077	1512083	0 %	100 %	0 %	0 %	21674422
32308	NC_002932	TCA	2	6	1512093	1512098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674422
32309	NC_002932	CGT	2	6	1512181	1512186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674423
32310	NC_002932	GCT	2	6	1512247	1512252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674423
32311	NC_002932	CGA	2	6	1512259	1512264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674423
32312	NC_002932	CCG	2	6	1512271	1512276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674423
32313	NC_002932	CAA	2	6	1512364	1512369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674423
32314	NC_002932	CGTC	2	8	1512385	1512392	0 %	25 %	25 %	50 %	21674423
32315	NC_002932	GC	3	6	1512414	1512419	0 %	0 %	50 %	50 %	21674423
32316	NC_002932	ACCT	2	8	1512479	1512486	25 %	25 %	0 %	50 %	21674423
32317	NC_002932	GGC	2	6	1512578	1512583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674423
32318	NC_002932	TCA	2	6	1512603	1512608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674423
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32320	NC_002932	GTC	2	6	1512698	1512703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674423
32321	NC_002932	AAC	2	6	1512707	1512712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674423
32322	NC_002932	CG	3	6	1512822	1512827	0 %	0 %	50 %	50 %	21674423
32323	NC_002932	CGA	2	6	1512844	1512849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674423
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32325	NC_002932	GCG	2	6	1513216	1513221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674424
32326	NC_002932	GCC	2	6	1513234	1513239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674424
32327	NC_002932	GACC	2	8	1513241	1513248	25 %	0 %	25 %	50 %	21674424
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32330	NC_002932	AAG	2	6	1513332	1513337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674424
32331	NC_002932	GCT	2	6	1513367	1513372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32332	NC_002932	CGA	2	6	1513373	1513378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32333	NC_002932	A	6	6	1513385	1513390	100 %	0 %	0 %	0 %	21674424
32334	NC_002932	TTC	2	6	1513395	1513400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674424
32335	NC_002932	GGT	2	6	1513442	1513447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21674424
32336	NC_002932	CTCG	2	8	1513466	1513473	0 %	25 %	25 %	50 %	21674424
32337	NC_002932	CG	3	6	1513477	1513482	0 %	0 %	50 %	50 %	21674424
32338	NC_002932	CGG	2	6	1513484	1513489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674424
32339	NC_002932	TCA	2	6	1513501	1513506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674424
32340	NC_002932	CAA	2	6	1513541	1513546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674424
32341	NC_002932	CTC	2	6	1513548	1513553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674424
32342	NC_002932	GCT	2	6	1513556	1513561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32343	NC_002932	CGT	2	6	1513580	1513585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32344	NC_002932	TCTCG	2	10	1513592	1513601	0 %	40 %	20 %	40 %	21674424
32345	NC_002932	TGC	2	6	1513618	1513623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32346	NC_002932	CGCC	2	8	1513658	1513665	0 %	0 %	25 %	75 %	21674424
32347	NC_002932	CGG	2	6	1513672	1513677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674424
32348	NC_002932	GC	3	6	1513768	1513773	0 %	0 %	50 %	50 %	21674424
32349	NC_002932	CGG	2	6	1513813	1513818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674424
32350	NC_002932	CAA	2	6	1513832	1513837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674424
32351	NC_002932	TGC	2	6	1513957	1513962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674424
32352	NC_002932	TCT	2	6	1513963	1513968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674424
32353	NC_002932	CCG	2	6	1513982	1513987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674424
32354	NC_002932	CAA	2	6	1514015	1514020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21674424
32355	NC_002932	ACCG	2	8	1514040	1514047	25 %	0 %	25 %	50 %	21674424
32356	NC_002932	GAA	2	6	1514100	1514105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674424
32357	NC_002932	CGG	2	6	1514161	1514166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674424
32358	NC_002932	GGAA	2	8	1514219	1514226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32359	NC_002932	ATA	2	6	1514236	1514241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32442	NC_002932	AATT	2	8	1518450	1518457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32443	NC_002932	TCA	2	6	1518466	1518471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32444	NC_002932	T	6	6	1518483	1518488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32445	NC_002932	A	6	6	1518500	1518505	100 %	0 %	0 %	0 %	21674430
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32457	NC_002932	ATC	2	6	1519046	1519051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674431
32458	NC_002932	GCTG	2	8	1519058	1519065	0 %	25 %	50 %	25 %	21674431
32459	NC_002932	ACG	2	6	1519124	1519129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674431
32460	NC_002932	ATC	2	6	1519130	1519135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674431
32461	NC_002932	CTC	2	6	1519244	1519249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674431
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32464	NC_002932	GCT	2	6	1519318	1519323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674431
32465	NC_002932	GAA	2	6	1519344	1519349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21674431
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32467	NC_002932	CGGTC	2	10	1519378	1519387	0 %	20 %	40 %	40 %	21674431
32468	NC_002932	GCCG	2	8	1519445	1519452	0 %	0 %	50 %	50 %	21674431
32469	NC_002932	CAG	3	9	1519519	1519527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674431
32470	NC_002932	TTC	2	6	1519544	1519549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674431
32471	NC_002932	GC	3	6	1519662	1519667	0 %	0 %	50 %	50 %	21674431
32472	NC_002932	GTCG	2	8	1519702	1519709	0 %	25 %	50 %	25 %	21674431
32473	NC_002932	GCA	2	6	1519726	1519731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674431
32474	NC_002932	TTC	2	6	1519811	1519816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674431
32475	NC_002932	GCT	2	6	1519891	1519896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674431
32476	NC_002932	GAT	2	6	1520001	1520006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674432
32477	NC_002932	ACC	2	6	1520054	1520059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21674432
32478	NC_002932	TGC	2	6	1520133	1520138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32479	NC_002932	GCC	2	6	1520230	1520235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674432
32480	NC_002932	CTC	2	6	1520359	1520364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21674432
32481	NC_002932	ATC	2	6	1520428	1520433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21674432
32482	NC_002932	TC	3	6	1520432	1520437	0 %	50 %	0 %	50 %	21674432
32483	NC_002932	GAC	2	6	1520440	1520445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32484	NC_002932	TTC	2	6	1520452	1520457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21674432
32485	NC_002932	TGA	2	6	1520502	1520507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674432
32486	NC_002932	GCA	2	6	1520664	1520669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32487	NC_002932	T	6	6	1520692	1520697	0 %	100 %	0 %	0 %	21674432
32488	NC_002932	TGA	2	6	1520704	1520709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21674432
32489	NC_002932	ACGA	2	8	1520774	1520781	50 %	0 %	25 %	25 %	21674432
32490	NC_002932	TCG	2	6	1520783	1520788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32491	NC_002932	GCA	2	6	1520808	1520813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32492	NC_002932	GGC	2	6	1520838	1520843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21674432
32493	NC_002932	GCA	2	6	1520847	1520852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32494	NC_002932	GCA	2	6	1520877	1520882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32495	NC_002932	GCC	2	6	1520899	1520904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21674432
32496	NC_002932	CAG	2	6	1520914	1520919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21674432
32497	NC_002932	T	6	6	1520971	1520976	0 %	100 %	0 %	0 %	21674432
32498	NC_002932	CAT	2	6	1521059	1521064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32499	NC_002932	AT	3	6	1521066	1521071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32500	NC_002932	ATG	2	6	1521121	1521126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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