MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_002932	CGG	2	6	843536	843541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673717
18003	NC_002932	TCA	2	6	843566	843571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673717
18004	NC_002932	GAT	2	6	843651	843656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673718
18005	NC_002932	CCG	2	6	843689	843694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673718
18006	NC_002932	GAG	2	6	843699	843704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673718
18007	NC_002932	GTG	2	6	843732	843737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673718
18008	NC_002932	CGT	2	6	843752	843757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673718
18009	NC_002932	GGA	2	6	843836	843841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673718
18010	NC_002932	TGC	2	6	843875	843880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673718
18011	NC_002932	CGG	2	6	843911	843916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673718
18012	NC_002932	GCG	2	6	843973	843978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673718
18013	NC_002932	CG	3	6	844007	844012	0 %	0 %	50 %	50 %	21673718
18014	NC_002932	CGG	2	6	844022	844027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673718
18015	NC_002932	GCG	2	6	844043	844048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673718
18016	NC_002932	GAT	2	6	844125	844130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673718
18017	NC_002932	CG	3	6	844131	844136	0 %	0 %	50 %	50 %	21673718
18018	NC_002932	CG	3	6	844158	844163	0 %	0 %	50 %	50 %	21673718
18019	NC_002932	GTT	2	6	844237	844242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21673718
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18023	NC_002932	GTCT	2	8	844440	844447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18024	NC_002932	TGCTG	2	10	844547	844556	0 %	40 %	40 %	20 %	21673720
18025	NC_002932	GTCGAG	2	12	844590	844601	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21673720
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18030	NC_002932	GGCT	2	8	844767	844774	0 %	25 %	50 %	25 %	21673720
18031	NC_002932	CGC	2	6	844836	844841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673720
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18033	NC_002932	CGA	2	6	844871	844876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673720
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18035	NC_002932	A	9	9	845085	845093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18037	NC_002932	AATTT	2	10	845143	845152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_002932	GAC	2	6	845220	845225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18040	NC_002932	AC	3	6	845276	845281	50 %	0 %	0 %	50 %	21673721
18041	NC_002932	ATCA	2	8	845289	845296	50 %	25 %	0 %	25 %	21673721
18042	NC_002932	A	7	7	845299	845305	100 %	0 %	0 %	0 %	21673721
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18053	NC_002932	AGA	2	6	845771	845776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673721
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18089	NC_002932	ACC	2	6	847102	847107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673723
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18103	NC_002932	GGC	2	6	847814	847819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673724
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18106	NC_002932	ATCT	2	8	847932	847939	25 %	50 %	0 %	25 %	21673724
18107	NC_002932	GGC	2	6	847968	847973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673724
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18110	NC_002932	CGG	2	6	848083	848088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673724
18111	NC_002932	GCC	2	6	848211	848216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673724
18112	NC_002932	GCCC	2	8	848241	848248	0 %	0 %	25 %	75 %	21673724
18113	NC_002932	ATC	2	6	848331	848336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673724
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18119	NC_002932	GC	3	6	848566	848571	0 %	0 %	50 %	50 %	21673725
18120	NC_002932	GCG	2	6	848578	848583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673725
18121	NC_002932	GTC	2	6	848589	848594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673725
18122	NC_002932	TCG	2	6	848701	848706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673725
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18124	NC_002932	CCG	2	6	848787	848792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673725
18125	NC_002932	GC	3	6	848800	848805	0 %	0 %	50 %	50 %	21673725
18126	NC_002932	CAT	2	6	848810	848815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673725
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18128	NC_002932	GCT	2	6	849002	849007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673725
18129	NC_002932	GCC	2	6	849087	849092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673725
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18133	NC_002932	TGC	3	9	849178	849186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673725
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18137	NC_002932	GCC	2	6	849417	849422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673725
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18144	NC_002932	TCG	2	6	849670	849675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673725
18145	NC_002932	CG	3	6	849674	849679	0 %	0 %	50 %	50 %	21673725
18146	NC_002932	TTAT	2	8	849743	849750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18147	NC_002932	TCAA	2	8	849755	849762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18148	NC_002932	TTCA	2	8	849805	849812	25 %	50 %	0 %	25 %	21673726
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18152	NC_002932	TGG	2	6	849858	849863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673726
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18154	NC_002932	GCT	2	6	849931	849936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673726
18155	NC_002932	CGAC	2	8	849990	849997	25 %	0 %	25 %	50 %	21673726
18156	NC_002932	GCC	2	6	850057	850062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673726
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18226	NC_002932	TCG	2	6	853292	853297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18227	NC_002932	TGA	2	6	853304	853309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18229	NC_002932	CG	3	6	853346	853351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18230	NC_002932	GGT	2	6	853356	853361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18231	NC_002932	T	6	6	853455	853460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18232	NC_002932	CGG	2	6	853536	853541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18233	NC_002932	TAT	2	6	853569	853574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_002932	TCC	2	6	853594	853599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673731
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18243	NC_002932	GAT	2	6	854073	854078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673731
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18245	NC_002932	CGA	2	6	854154	854159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673731
18246	NC_002932	CAT	2	6	854211	854216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673731
18247	NC_002932	TC	3	6	854232	854237	0 %	50 %	0 %	50 %	21673731
18248	NC_002932	CGT	2	6	854238	854243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673731
18249	NC_002932	CTG	2	6	854295	854300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673731
18250	NC_002932	CTT	2	6	854343	854348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673732
18251	NC_002932	A	6	6	854373	854378	100 %	0 %	0 %	0 %	21673732
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18253	NC_002932	GCT	2	6	854468	854473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673733
18254	NC_002932	CGGG	2	8	854561	854568	0 %	0 %	75 %	25 %	21673733
18255	NC_002932	CTG	2	6	854575	854580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673733
18256	NC_002932	CGA	2	6	854591	854596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673733
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18269	NC_002932	CTC	2	6	855247	855252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673734
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18355	NC_002932	GCGCG	2	10	858173	858182	0 %	0 %	60 %	40 %	21673735
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18364	NC_002932	CTG	2	6	858615	858620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673735
18365	NC_002932	CGG	2	6	858667	858672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673735
18366	NC_002932	GGC	2	6	858677	858682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673735
18367	NC_002932	GC	3	6	858803	858808	0 %	0 %	50 %	50 %	21673735
18368	NC_002932	GCC	2	6	858813	858818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673735
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18371	NC_002932	ACA	2	6	858855	858860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18372	NC_002932	AAC	2	6	858864	858869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673736
18373	NC_002932	GCC	2	6	858974	858979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673736
18374	NC_002932	TGG	2	6	859005	859010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673736
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18377	NC_002932	CCCTG	2	10	859115	859124	0 %	20 %	20 %	60 %	21673736
18378	NC_002932	TGA	2	6	859158	859163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673736
18379	NC_002932	GCT	2	6	859192	859197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673736
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18382	NC_002932	ACA	2	6	859290	859295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673736
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18390	NC_002932	AACGC	2	10	859659	859668	40 %	0 %	20 %	40 %	21673736
18391	NC_002932	GCA	2	6	859685	859690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673736
18392	NC_002932	AGC	2	6	859732	859737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673736
18393	NC_002932	CT	3	6	859769	859774	0 %	50 %	0 %	50 %	21673736
18394	NC_002932	TGGCC	2	10	859836	859845	0 %	20 %	40 %	40 %	21673736
18395	NC_002932	AAG	2	6	859850	859855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673736
18396	NC_002932	TCC	2	6	859939	859944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673736
18397	NC_002932	CAA	2	6	859947	859952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673736
18398	NC_002932	A	6	6	859955	859960	100 %	0 %	0 %	0 %	21673736
18399	NC_002932	T	6	6	860023	860028	0 %	100 %	0 %	0 %	21673736
18400	NC_002932	ATCG	2	8	860056	860063	25 %	25 %	25 %	25 %	21673736
18401	NC_002932	GAC	2	6	860081	860086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673736
18402	NC_002932	AGC	2	6	860118	860123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673736
18403	NC_002932	CTT	2	6	860191	860196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673736
18404	NC_002932	CAC	2	6	860209	860214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673736
18405	NC_002932	CGC	2	6	860239	860244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673736
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18407	NC_002932	CGC	2	6	860258	860263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673736
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18410	NC_002932	CG	3	6	860477	860482	0 %	0 %	50 %	50 %	21673736
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18412	NC_002932	GCT	3	9	860575	860583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673736
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18414	NC_002932	TGC	2	6	860664	860669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673736
18415	NC_002932	GCCT	2	8	860672	860679	0 %	25 %	25 %	50 %	21673736
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18422	NC_002932	TCG	2	6	861005	861010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673737
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18430	NC_002932	CCG	2	6	861449	861454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673737
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18438	NC_002932	CGGA	2	8	861701	861708	25 %	0 %	50 %	25 %	21673737
18439	NC_002932	ACC	2	6	861753	861758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673737
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18443	NC_002932	TGGA	2	8	862018	862025	25 %	25 %	50 %	0 %	21673737
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18448	NC_002932	CTG	2	6	862128	862133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673738
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18451	NC_002932	GGAT	2	8	862237	862244	25 %	25 %	50 %	0 %	21673738
18452	NC_002932	AAGATC	2	12	862254	862265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21673738
18453	NC_002932	GATC	2	8	862274	862281	25 %	25 %	25 %	25 %	21673738
18454	NC_002932	GTG	2	6	862372	862377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673738
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18456	NC_002932	ATCGC	2	10	862396	862405	20 %	20 %	20 %	40 %	21673738
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18461	NC_002932	TCGC	2	8	862631	862638	0 %	25 %	25 %	50 %	21673738
18462	NC_002932	GCCT	2	8	862671	862678	0 %	25 %	25 %	50 %	21673738
18463	NC_002932	GCT	2	6	862858	862863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673739
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18465	NC_002932	ACCGGC	2	12	862964	862975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21673739
18466	NC_002932	GTG	2	6	863045	863050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673739
18467	NC_002932	CCGT	2	8	863051	863058	0 %	25 %	25 %	50 %	21673739
18468	NC_002932	AGG	2	6	863067	863072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673739
18469	NC_002932	GT	3	6	863073	863078	0 %	50 %	50 %	0 %	21673739
18470	NC_002932	GAG	2	6	863099	863104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673739
18471	NC_002932	ACT	2	6	863139	863144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673739
18472	NC_002932	TGG	2	6	863211	863216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673739
18473	NC_002932	CAA	2	6	863233	863238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673739
18474	NC_002932	CAA	2	6	863248	863253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673739
18475	NC_002932	CGG	2	6	863278	863283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673739
18476	NC_002932	CATCGT	2	12	863320	863331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21673739
18477	NC_002932	CGG	2	6	863353	863358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673739
18478	NC_002932	CCAGGG	2	12	863362	863373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	21673739
18479	NC_002932	CCAC	2	8	863424	863431	25 %	0 %	0 %	75 %	21673739
18480	NC_002932	CAC	2	6	863441	863446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673739
18481	NC_002932	GGA	2	6	863524	863529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673739
18482	NC_002932	CAA	2	6	863536	863541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673739
18483	NC_002932	CAA	2	6	863569	863574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673739
18484	NC_002932	GC	3	6	863589	863594	0 %	0 %	50 %	50 %	21673739
18485	NC_002932	GGC	2	6	863621	863626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673739
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18487	NC_002932	ACC	2	6	863678	863683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673739
18488	NC_002932	CGA	2	6	863737	863742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673739
18489	NC_002932	CGG	2	6	863764	863769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673739
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18491	NC_002932	GAT	2	6	863833	863838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673739
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