MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002932	TGC	2	6	585048	585053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12502	NC_002932	CGC	2	6	585078	585083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12503	NC_002932	GCC	2	6	585195	585200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12504	NC_002932	GGC	2	6	585254	585259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12505	NC_002932	ACT	2	6	585321	585326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673413
12506	NC_002932	GCG	2	6	585357	585362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12507	NC_002932	TCG	2	6	585371	585376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12508	NC_002932	TGA	2	6	585381	585386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673413
12509	NC_002932	CGG	2	6	585408	585413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12510	NC_002932	CAC	2	6	585436	585441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673413
12511	NC_002932	TCG	2	6	585465	585470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12512	NC_002932	ATC	2	6	585477	585482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673413
12513	NC_002932	AGG	3	9	585516	585524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12514	NC_002932	TGG	2	6	585540	585545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673413
12515	NC_002932	TCG	2	6	585582	585587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12516	NC_002932	ACCG	2	8	585608	585615	25 %	0 %	25 %	50 %	21673413
12517	NC_002932	TCA	2	6	585642	585647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673413
12518	NC_002932	CGG	2	6	585778	585783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12519	NC_002932	CAA	2	6	585793	585798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673413
12520	NC_002932	ACG	2	6	585840	585845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12521	NC_002932	CAC	2	6	585868	585873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673413
12522	NC_002932	AGG	2	6	585879	585884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12523	NC_002932	CGTGC	2	10	585887	585896	0 %	20 %	40 %	40 %	21673413
12524	NC_002932	GC	3	6	585895	585900	0 %	0 %	50 %	50 %	21673413
12525	NC_002932	TGA	2	6	585924	585929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673413
12526	NC_002932	TCGAC	2	10	585963	585972	20 %	20 %	20 %	40 %	21673413
12527	NC_002932	CGA	2	6	586048	586053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12528	NC_002932	CGA	2	6	586096	586101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12529	NC_002932	GTG	2	6	586157	586162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673413
12530	NC_002932	CGCC	2	8	586207	586214	0 %	0 %	25 %	75 %	21673413
12531	NC_002932	CGC	2	6	586296	586301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12532	NC_002932	GC	3	6	586300	586305	0 %	0 %	50 %	50 %	21673413
12533	NC_002932	GGC	2	6	586319	586324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12534	NC_002932	CCG	2	6	586362	586367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12535	NC_002932	CGA	2	6	586414	586419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12536	NC_002932	TGC	2	6	586422	586427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12537	NC_002932	CGCGC	2	10	586448	586457	0 %	0 %	40 %	60 %	21673413
12538	NC_002932	GGA	3	9	586468	586476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12539	NC_002932	GTC	2	6	586490	586495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12540	NC_002932	GCC	2	6	586544	586549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12541	NC_002932	AAG	2	6	586574	586579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673413
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12543	NC_002932	AAG	2	6	586700	586705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673413
12544	NC_002932	GCG	2	6	586713	586718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12545	NC_002932	GAG	2	6	586790	586795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
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12549	NC_002932	GAG	2	6	586961	586966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12550	NC_002932	AGC	2	6	586995	587000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12551	NC_002932	TTCG	2	8	587011	587018	0 %	50 %	25 %	25 %	21673413
12552	NC_002932	GAGC	2	8	587026	587033	25 %	0 %	50 %	25 %	21673413
12553	NC_002932	GGA	3	9	587044	587052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12554	NC_002932	GGC	2	6	587059	587064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
12555	NC_002932	ATG	2	6	587087	587092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673413
12556	NC_002932	GC	3	6	587100	587105	0 %	0 %	50 %	50 %	21673413
12557	NC_002932	ATG	2	6	587201	587206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673413
12558	NC_002932	CCG	2	6	587208	587213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
12559	NC_002932	CAG	2	6	587260	587265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12560	NC_002932	ACC	2	6	587270	587275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673413
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12563	NC_002932	GAG	2	6	587417	587422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673413
12564	NC_002932	TGC	2	6	587502	587507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673413
12565	NC_002932	CGG	2	6	587545	587550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673413
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12573	NC_002932	CGC	2	6	587953	587958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673413
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12585	NC_002932	A	6	6	588319	588324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_002932	GGA	2	6	588342	588347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_002932	AAC	2	6	588350	588355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_002932	TGA	2	6	588404	588409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_002932	A	6	6	588452	588457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_002932	AAC	2	6	588477	588482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_002932	ACG	2	6	588509	588514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673415
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12594	NC_002932	TGA	2	6	588730	588735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_002932	GCC	2	6	588758	588763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12596	NC_002932	AAG	2	6	588857	588862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_002932	AAG	2	6	588866	588871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_002932	TA	3	6	588896	588901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_002932	TCGC	2	8	588908	588915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12600	NC_002932	AGGTT	2	10	588979	588988	20 %	40 %	40 %	0 %	21673416
12601	NC_002932	T	8	8	589012	589019	0 %	100 %	0 %	0 %	21673416
12602	NC_002932	AT	3	6	589110	589115	50 %	50 %	0 %	0 %	21673416
12603	NC_002932	T	7	7	589119	589125	0 %	100 %	0 %	0 %	21673416
12604	NC_002932	TGG	2	6	589129	589134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673416
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12606	NC_002932	A	6	6	589144	589149	100 %	0 %	0 %	0 %	21673416
12607	NC_002932	GAC	2	6	589150	589155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673416
12608	NC_002932	TAA	2	6	589208	589213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21673416
12609	NC_002932	TTTA	2	8	589235	589242	25 %	75 %	0 %	0 %	21673416
12610	NC_002932	TTTC	2	8	589280	589287	0 %	75 %	0 %	25 %	21673416
12611	NC_002932	TCA	2	6	589317	589322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673416
12612	NC_002932	TGAAT	2	10	589362	589371	40 %	40 %	20 %	0 %	21673416
12613	NC_002932	GCG	2	6	589393	589398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673416
12614	NC_002932	GTT	2	6	589419	589424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21673416
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12617	NC_002932	A	7	7	589531	589537	100 %	0 %	0 %	0 %	21673416
12618	NC_002932	ATG	2	6	589620	589625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673416
12619	NC_002932	AG	3	6	589723	589728	50 %	0 %	50 %	0 %	21673417
12620	NC_002932	GAG	2	6	589813	589818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673417
12621	NC_002932	TC	3	6	589858	589863	0 %	50 %	0 %	50 %	21673417
12622	NC_002932	CAT	2	6	589873	589878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_002932	CCG	2	6	589902	589907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12624	NC_002932	ACGT	2	8	589908	589915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12625	NC_002932	TTA	2	6	589949	589954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12641	NC_002932	TCG	2	6	590839	590844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673421
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12743	NC_002932	CGA	2	6	595396	595401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673428
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12861	NC_002932	T	7	7	601719	601725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12865	NC_002932	GGGC	2	8	601893	601900	0 %	0 %	75 %	25 %	21673435
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12989	NC_002932	TCG	2	6	606947	606952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673439
12990	NC_002932	CCA	2	6	607025	607030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673439
12991	NC_002932	CGG	2	6	607038	607043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673439
12992	NC_002932	CAT	2	6	607065	607070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673439
12993	NC_002932	ATC	2	6	607183	607188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673439
12994	NC_002932	ACA	2	6	607301	607306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673439
12995	NC_002932	AC	3	6	607384	607389	50 %	0 %	0 %	50 %	21673439
12996	NC_002932	A	7	7	607398	607404	100 %	0 %	0 %	0 %	21673439
12997	NC_002932	GGT	2	6	607450	607455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673439
12998	NC_002932	TCAT	2	8	607535	607542	25 %	50 %	0 %	25 %	21673439
12999	NC_002932	CGA	2	6	607550	607555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673439
13000	NC_002932	CAG	2	6	607561	607566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673439

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