MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002932	TC	3	6	258448	258453	0 %	50 %	0 %	50 %	21673086
5502	NC_002932	CTC	2	6	258533	258538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673086
5503	NC_002932	GCT	2	6	258637	258642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673086
5504	NC_002932	GGA	2	6	258667	258672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673086
5505	NC_002932	CGC	2	6	258680	258685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673086
5506	NC_002932	GC	3	6	258692	258697	0 %	0 %	50 %	50 %	21673086
5507	NC_002932	ACG	2	6	258789	258794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673086
5508	NC_002932	TTC	2	6	258840	258845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673086
5509	NC_002932	AAAG	2	8	258946	258953	75 %	0 %	25 %	0 %	21673087
5510	NC_002932	AGG	3	9	258966	258974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673087
5511	NC_002932	CTG	2	6	258998	259003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673087
5512	NC_002932	GAT	2	6	259015	259020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673087
5513	NC_002932	CAG	2	6	259112	259117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673087
5514	NC_002932	CGAAA	2	10	259171	259180	60 %	0 %	20 %	20 %	21673087
5515	NC_002932	GATGAA	2	12	259196	259207	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21673087
5516	NC_002932	ACG	2	6	259243	259248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673088
5517	NC_002932	CCG	2	6	259378	259383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673088
5518	NC_002932	GC	3	6	259386	259391	0 %	0 %	50 %	50 %	21673088
5519	NC_002932	GCC	2	6	259449	259454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673088
5520	NC_002932	CGC	2	6	259503	259508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673088
5521	NC_002932	CCG	2	6	259640	259645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673088
5522	NC_002932	A	7	7	259671	259677	100 %	0 %	0 %	0 %	21673088
5523	NC_002932	CGG	3	9	259769	259777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673089
5524	NC_002932	TCT	2	6	259874	259879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673089
5525	NC_002932	GAT	2	6	259893	259898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673089
5526	NC_002932	TCG	2	6	259921	259926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5527	NC_002932	ATCG	2	8	259953	259960	25 %	25 %	25 %	25 %	21673089
5528	NC_002932	GGC	2	6	259965	259970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673089
5529	NC_002932	AGAA	2	8	260014	260021	75 %	0 %	25 %	0 %	21673089
5530	NC_002932	CCA	2	6	260025	260030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673089
5531	NC_002932	TTC	2	6	260032	260037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673089
5532	NC_002932	TCA	2	6	260137	260142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673089
5533	NC_002932	CGG	2	6	260150	260155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673089
5534	NC_002932	GAC	2	6	260157	260162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5535	NC_002932	GCT	2	6	260193	260198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5536	NC_002932	ACT	2	6	260251	260256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673089
5537	NC_002932	TCA	2	6	260300	260305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673089
5538	NC_002932	AGC	2	6	260477	260482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5539	NC_002932	GAT	2	6	260528	260533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673089
5540	NC_002932	GCA	2	6	260536	260541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5541	NC_002932	GAT	2	6	260543	260548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673089
5542	NC_002932	CGG	2	6	260562	260567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673089
5543	NC_002932	ACG	2	6	260569	260574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5544	NC_002932	CAG	2	6	260655	260660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5545	NC_002932	TGG	2	6	260770	260775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673089
5546	NC_002932	GTC	2	6	260819	260824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673089
5547	NC_002932	CTA	2	6	260867	260872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673089
5548	NC_002932	TTA	2	6	260915	260920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21673089
5549	NC_002932	GTG	2	6	260958	260963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_002932	T	6	6	261014	261019	0 %	100 %	0 %	0 %	21673090
5551	NC_002932	GTT	2	6	261063	261068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21673090
5552	NC_002932	T	6	6	261124	261129	0 %	100 %	0 %	0 %	21673090
5553	NC_002932	TTG	2	6	261188	261193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21673090
5554	NC_002932	TCT	2	6	261272	261277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673090
5555	NC_002932	CGA	2	6	261297	261302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673090
5556	NC_002932	TGA	2	6	261333	261338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673090
5557	NC_002932	GTC	2	6	261358	261363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673090
5558	NC_002932	CGG	2	6	261369	261374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673090
5559	NC_002932	CT	3	6	261421	261426	0 %	50 %	0 %	50 %	21673090
5560	NC_002932	GCG	2	6	261447	261452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673090
5561	NC_002932	GAT	2	6	261466	261471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673090
5562	NC_002932	TC	3	6	261474	261479	0 %	50 %	0 %	50 %	21673090
5563	NC_002932	ATG	2	6	261512	261517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673090
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5565	NC_002932	GAT	2	6	261607	261612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673090
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5569	NC_002932	GC	3	6	261882	261887	0 %	0 %	50 %	50 %	21673091
5570	NC_002932	ATG	3	9	261916	261924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673091
5571	NC_002932	TCG	2	6	261928	261933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673091
5572	NC_002932	GC	3	6	261941	261946	0 %	0 %	50 %	50 %	21673091
5573	NC_002932	GCC	2	6	261952	261957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673091
5574	NC_002932	GAT	2	6	261999	262004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673091
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5577	NC_002932	CTTC	2	8	262105	262112	0 %	50 %	0 %	50 %	21673091
5578	NC_002932	ACG	2	6	262180	262185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_002932	ATT	2	6	262199	262204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21673092
5580	NC_002932	TGC	2	6	262337	262342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673092
5581	NC_002932	GAC	2	6	262395	262400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673092
5582	NC_002932	TCC	2	6	262500	262505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673092
5583	NC_002932	TC	3	6	262526	262531	0 %	50 %	0 %	50 %	21673092
5584	NC_002932	ACC	2	6	262594	262599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673092
5585	NC_002932	CAG	2	6	262646	262651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_002932	CCG	2	6	262652	262657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_002932	CCT	2	6	262667	262672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_002932	CAGC	2	8	262687	262694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_002932	A	8	8	262718	262725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_002932	AC	3	6	262823	262828	50 %	0 %	0 %	50 %	21673093
5591	NC_002932	T	6	6	262863	262868	0 %	100 %	0 %	0 %	21673093
5592	NC_002932	GAGC	2	8	262934	262941	25 %	0 %	50 %	25 %	21673093
5593	NC_002932	CTCTTT	2	12	262995	263006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673093
5594	NC_002932	CTTT	2	8	263023	263030	0 %	75 %	0 %	25 %	21673093
5595	NC_002932	GC	3	6	263057	263062	0 %	0 %	50 %	50 %	21673093
5596	NC_002932	CTG	2	6	263064	263069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673093
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5599	NC_002932	GCA	2	6	263194	263199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673093
5600	NC_002932	T	6	6	263265	263270	0 %	100 %	0 %	0 %	21673093
5601	NC_002932	GT	3	6	263297	263302	0 %	50 %	50 %	0 %	21673093
5602	NC_002932	A	6	6	263365	263370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_002932	GA	3	6	263418	263423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_002932	T	6	6	263454	263459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_002932	T	6	6	263571	263576	0 %	100 %	0 %	0 %	21673094
5606	NC_002932	CTGA	2	8	263604	263611	25 %	25 %	25 %	25 %	21673094
5607	NC_002932	CGA	2	6	263619	263624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673094
5608	NC_002932	CTC	2	6	263632	263637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673094
5609	NC_002932	A	6	6	263790	263795	100 %	0 %	0 %	0 %	21673094
5610	NC_002932	ATC	2	6	263852	263857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673094
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5612	NC_002932	CGA	2	6	263880	263885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673094
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5614	NC_002932	CGG	2	6	264015	264020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673094
5615	NC_002932	CAT	2	6	264100	264105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673094
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5618	NC_002932	GCGA	2	8	264221	264228	25 %	0 %	50 %	25 %	21673094
5619	NC_002932	GTG	2	6	264300	264305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673094
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5622	NC_002932	CGG	2	6	264420	264425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673094
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5624	NC_002932	CAT	2	6	264471	264476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673094
5625	NC_002932	GAG	2	6	264487	264492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673094
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5747	NC_002932	GCA	2	6	269497	269502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673098
5748	NC_002932	GAT	2	6	269510	269515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673098
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5858	NC_002932	CGA	2	6	274535	274540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673103
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5995	NC_002932	CAT	2	6	281677	281682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673107
5996	NC_002932	CGG	2	6	281703	281708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673107
5997	NC_002932	CTA	2	6	281722	281727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673107
5998	NC_002932	A	6	6	281729	281734	100 %	0 %	0 %	0 %	21673107
5999	NC_002932	GCA	2	6	281737	281742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673107
6000	NC_002932	CGC	2	6	281747	281752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673107

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