MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 23890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15126	NC_002620	TCA	2	6	677201	677206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835183
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15134	NC_002620	CAAT	2	8	677456	677463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15135	NC_002620	ATT	2	6	677470	677475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15236	NC_002620	CGTCA	2	10	682606	682615	20 %	20 %	20 %	40 %	15835188
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15247	NC_002620	TCTCT	2	10	683196	683205	0 %	60 %	0 %	40 %	15835189
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15375	NC_002620	TCA	2	6	688622	688627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835193
15376	NC_002620	AATC	2	8	688651	688658	50 %	25 %	0 %	25 %	15835193
15377	NC_002620	TTC	2	6	688798	688803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835193
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15379	NC_002620	GAA	2	6	688838	688843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835193
15380	NC_002620	CCT	2	6	688899	688904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835193
15381	NC_002620	CTCCAT	2	12	688911	688922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15835193
15382	NC_002620	TCA	2	6	688943	688948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835193
15383	NC_002620	TTA	2	6	688952	688957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835193
15384	NC_002620	CCA	2	6	688981	688986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835193
15385	NC_002620	ATT	2	6	689017	689022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835193
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15387	NC_002620	TGAA	2	8	689106	689113	50 %	25 %	25 %	0 %	15835193
15388	NC_002620	AAAC	2	8	689121	689128	75 %	0 %	0 %	25 %	15835193
15389	NC_002620	AAT	2	6	689152	689157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835193
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15391	NC_002620	AACA	2	8	689209	689216	75 %	0 %	0 %	25 %	15835193
15392	NC_002620	ATA	2	6	689240	689245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835193
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15394	NC_002620	C	6	6	689284	689289	0 %	0 %	0 %	100 %	15835193
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15399	NC_002620	TAA	2	6	689568	689573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835193
15400	NC_002620	CTC	2	6	689575	689580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835193
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15402	NC_002620	CTC	2	6	689626	689631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835193
15403	NC_002620	TCA	2	6	689642	689647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835193
15404	NC_002620	CAAA	2	8	689718	689725	75 %	0 %	0 %	25 %	15835193
15405	NC_002620	T	7	7	689737	689743	0 %	100 %	0 %	0 %	15835193
15406	NC_002620	TTC	2	6	689875	689880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835193
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15410	NC_002620	ATTT	2	8	690227	690234	25 %	75 %	0 %	0 %	15835193
15411	NC_002620	TCCA	2	8	690384	690391	25 %	25 %	0 %	50 %	15835194
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15423	NC_002620	CAA	2	6	690830	690835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835194
15424	NC_002620	CA	3	6	690900	690905	50 %	0 %	0 %	50 %	15835195
15425	NC_002620	CAG	2	6	690977	690982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835195
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15429	NC_002620	CA	3	6	691251	691256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15430	NC_002620	CCA	2	6	691492	691497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835196
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15434	NC_002620	ATAG	2	8	691718	691725	50 %	25 %	25 %	0 %	15835196
15435	NC_002620	AGA	2	6	691769	691774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835196
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15439	NC_002620	GTA	2	6	692006	692011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835196
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15448	NC_002620	TAAA	2	8	692423	692430	75 %	25 %	0 %	0 %	15835196
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15454	NC_002620	TTC	4	12	692654	692665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835196
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15462	NC_002620	GTTT	2	8	693115	693122	0 %	75 %	25 %	0 %	15835196
15463	NC_002620	T	6	6	693120	693125	0 %	100 %	0 %	0 %	15835196
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15468	NC_002620	T	8	8	693346	693353	0 %	100 %	0 %	0 %	15835197
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15482	NC_002620	ATC	2	6	694239	694244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835198
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15484	NC_002620	ATGA	2	8	694530	694537	50 %	25 %	25 %	0 %	15835198
15485	NC_002620	TTC	2	6	694575	694580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835198
15486	NC_002620	A	6	6	694584	694589	100 %	0 %	0 %	0 %	15835198
15487	NC_002620	CAA	2	6	694598	694603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835198
15488	NC_002620	ATCCC	2	10	694610	694619	20 %	20 %	0 %	60 %	15835198
15489	NC_002620	GAA	3	9	694690	694698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835198
15490	NC_002620	A	6	6	694697	694702	100 %	0 %	0 %	0 %	15835198
15491	NC_002620	ATCA	2	8	694740	694747	50 %	25 %	0 %	25 %	15835198
15492	NC_002620	AAG	2	6	694802	694807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835198
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15495	NC_002620	GCTC	2	8	695038	695045	0 %	25 %	25 %	50 %	15835198
15496	NC_002620	TA	3	6	695123	695128	50 %	50 %	0 %	0 %	15835198
15497	NC_002620	A	6	6	695329	695334	100 %	0 %	0 %	0 %	15835199
15498	NC_002620	GTAA	2	8	695392	695399	50 %	25 %	25 %	0 %	15835199
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