MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 23890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_002620	A	6	6	624452	624457	100 %	0 %	0 %	0 %	15835134
14003	NC_002620	TGT	3	9	624468	624476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835134
14004	NC_002620	AGA	2	6	624540	624545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835134
14005	NC_002620	GAT	2	6	624622	624627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835134
14006	NC_002620	CTG	2	6	624701	624706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835134
14007	NC_002620	AGA	2	6	624717	624722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835134
14008	NC_002620	TGA	2	6	624781	624786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835135
14009	NC_002620	GAA	2	6	624824	624829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835135
14010	NC_002620	GACC	2	8	624885	624892	25 %	0 %	25 %	50 %	15835135
14011	NC_002620	ATT	2	6	624971	624976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835135
14012	NC_002620	GCT	2	6	625100	625105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835135
14013	NC_002620	CAG	2	6	625191	625196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835135
14014	NC_002620	CTT	2	6	625208	625213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835135
14015	NC_002620	GCT	2	6	625217	625222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835135
14016	NC_002620	ATA	2	6	625230	625235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835135
14017	NC_002620	GAAT	2	8	625255	625262	50 %	25 %	25 %	0 %	15835135
14018	NC_002620	AAG	2	6	625335	625340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835135
14019	NC_002620	CAT	2	6	625354	625359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835135
14020	NC_002620	AGCT	2	8	625389	625396	25 %	25 %	25 %	25 %	15835135
14021	NC_002620	A	7	7	625493	625499	100 %	0 %	0 %	0 %	15835135
14022	NC_002620	TTG	2	6	625512	625517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835135
14023	NC_002620	ATT	2	6	625530	625535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835135
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14026	NC_002620	TGA	2	6	625802	625807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835136
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14050	NC_002620	TCT	2	6	627025	627030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_002620	AT	3	6	627055	627060	50 %	50 %	0 %	0 %	15835137
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14101	NC_002620	TTACA	2	10	629683	629692	40 %	40 %	0 %	20 %	15835138
14102	NC_002620	AG	3	6	629699	629704	50 %	0 %	50 %	0 %	15835138
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14111	NC_002620	CTA	2	6	630050	630055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14123	NC_002620	GTT	2	6	630560	630565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835139
14124	NC_002620	TTC	2	6	630569	630574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835139
14125	NC_002620	CT	3	6	630597	630602	0 %	50 %	0 %	50 %	15835139
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14128	NC_002620	TTC	2	6	630750	630755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835139
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14132	NC_002620	CT	3	6	630967	630972	0 %	50 %	0 %	50 %	15835139
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14141	NC_002620	TCT	2	6	631500	631505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14249	NC_002620	T	6	6	636360	636365	0 %	100 %	0 %	0 %	15835143
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14252	NC_002620	CTT	2	6	636424	636429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835143
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14262	NC_002620	TC	3	6	636800	636805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14263	NC_002620	CTT	2	6	636809	636814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14355	NC_002620	T	8	8	641810	641817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14356	NC_002620	A	6	6	641818	641823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_002620	TAAA	2	8	641934	641941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14358	NC_002620	A	6	6	641963	641968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14359	NC_002620	GAC	2	6	642044	642049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14366	NC_002620	ATTAA	2	10	642408	642417	60 %	40 %	0 %	0 %	15835149
14367	NC_002620	A	7	7	642482	642488	100 %	0 %	0 %	0 %	15835149
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14370	NC_002620	T	6	6	642559	642564	0 %	100 %	0 %	0 %	15835150
14371	NC_002620	AAC	2	6	642575	642580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835150
14372	NC_002620	GCT	2	6	642618	642623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835150
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14374	NC_002620	ATA	3	9	642802	642810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835150
14375	NC_002620	GATT	2	8	642881	642888	25 %	50 %	25 %	0 %	15835150
14376	NC_002620	A	6	6	642903	642908	100 %	0 %	0 %	0 %	15835150
14377	NC_002620	AAT	2	6	642972	642977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835150
14378	NC_002620	CAGAT	2	10	643048	643057	40 %	20 %	20 %	20 %	15835150
14379	NC_002620	AGC	2	6	643211	643216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835150
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14383	NC_002620	CTT	2	6	643323	643328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835151
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14385	NC_002620	TTCT	2	8	643491	643498	0 %	75 %	0 %	25 %	15835151
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14390	NC_002620	CCTTTA	2	12	643745	643756	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15835151
14391	NC_002620	CTG	2	6	643785	643790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835151
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14395	NC_002620	CT	4	8	643974	643981	0 %	50 %	0 %	50 %	15835151
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14404	NC_002620	CTT	2	6	644510	644515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835152
14405	NC_002620	TC	3	6	644534	644539	0 %	50 %	0 %	50 %	15835152
14406	NC_002620	A	6	6	644541	644546	100 %	0 %	0 %	0 %	15835152
14407	NC_002620	A	6	6	644589	644594	100 %	0 %	0 %	0 %	15835152
14408	NC_002620	CAC	2	6	644602	644607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835152
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14412	NC_002620	TAGA	2	8	644746	644753	50 %	25 %	25 %	0 %	15835153
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14418	NC_002620	TAA	2	6	644977	644982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835153
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14443	NC_002620	CTG	2	6	645774	645779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835153
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14445	NC_002620	GATTT	2	10	645818	645827	20 %	60 %	20 %	0 %	15835153
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14448	NC_002620	ACAA	2	8	645906	645913	75 %	0 %	0 %	25 %	15835153
14449	NC_002620	TA	3	6	645949	645954	50 %	50 %	0 %	0 %	15835153
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14454	NC_002620	A	6	6	646138	646143	100 %	0 %	0 %	0 %	15835153
14455	NC_002620	GTT	2	6	646148	646153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835153
14456	NC_002620	CAA	4	12	646167	646178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835153
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14459	NC_002620	TAAC	2	8	646377	646384	50 %	25 %	0 %	25 %	15835153
14460	NC_002620	TAT	2	6	646386	646391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835153
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14476	NC_002620	T	6	6	647359	647364	0 %	100 %	0 %	0 %	15835154
14477	NC_002620	TCTA	2	8	647372	647379	25 %	50 %	0 %	25 %	15835154
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14479	NC_002620	T	7	7	647433	647439	0 %	100 %	0 %	0 %	15835154
14480	NC_002620	T	6	6	647458	647463	0 %	100 %	0 %	0 %	15835154
14481	NC_002620	AGT	2	6	647493	647498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835154
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14483	NC_002620	A	6	6	647525	647530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14484	NC_002620	AAT	2	6	647547	647552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_002620	AAC	2	6	647560	647565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14486	NC_002620	ATT	2	6	647609	647614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14487	NC_002620	GAA	2	6	647627	647632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14488	NC_002620	A	8	8	647648	647655	100 %	0 %	0 %	0 %	15835155
14489	NC_002620	TTAA	2	8	647685	647692	50 %	50 %	0 %	0 %	15835155
14490	NC_002620	A	6	6	647691	647696	100 %	0 %	0 %	0 %	15835155
14491	NC_002620	A	6	6	647731	647736	100 %	0 %	0 %	0 %	15835155
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14493	NC_002620	AGA	2	6	647921	647926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835155
14494	NC_002620	CA	3	6	648103	648108	50 %	0 %	0 %	50 %	15835155
14495	NC_002620	A	7	7	648179	648185	100 %	0 %	0 %	0 %	15835155
14496	NC_002620	ACCGCT	2	12	648206	648217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15835155
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14498	NC_002620	A	6	6	648313	648318	100 %	0 %	0 %	0 %	15835155
14499	NC_002620	ACTT	2	8	648322	648329	25 %	50 %	0 %	25 %	15835155
14500	NC_002620	T	6	6	648337	648342	0 %	100 %	0 %	0 %	15835155

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