MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 23890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10125	NC_002620	AAG	2	6	454584	454589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835009
10126	NC_002620	A	6	6	454607	454612	100 %	0 %	0 %	0 %	15835009
10127	NC_002620	TC	3	6	454720	454725	0 %	50 %	0 %	50 %	15835009
10128	NC_002620	CTC	2	6	454740	454745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835009
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10150	NC_002620	AG	3	6	455569	455574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_002620	T	7	7	455577	455583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_002620	A	6	6	455586	455591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_002620	T	9	9	455602	455610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_002620	ATT	2	6	455630	455635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_002620	T	8	8	455648	455655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10157	NC_002620	GGA	2	6	455706	455711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10179	NC_002620	TAA	2	6	456927	456932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835012
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10224	NC_002620	TAG	2	6	458619	458624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10228	NC_002620	AGA	2	6	458862	458867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_002620	AG	4	8	458869	458876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_002620	A	6	6	458887	458892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_002620	TAT	2	6	458916	458921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835016
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10237	NC_002620	TAT	2	6	459150	459155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835016
10238	NC_002620	GCA	2	6	459169	459174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835016
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10240	NC_002620	TG	3	6	459281	459286	0 %	50 %	50 %	0 %	15835016
10241	NC_002620	GGT	2	6	459424	459429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835016
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10244	NC_002620	T	7	7	459495	459501	0 %	100 %	0 %	0 %	15835016
10245	NC_002620	A	6	6	459502	459507	100 %	0 %	0 %	0 %	15835016
10246	NC_002620	GAAA	2	8	459522	459529	75 %	0 %	25 %	0 %	15835016
10247	NC_002620	GAA	2	6	459550	459555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835016
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10249	NC_002620	GTT	2	6	459698	459703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835017
10250	NC_002620	GAAA	2	8	459707	459714	75 %	0 %	25 %	0 %	15835017
10251	NC_002620	GAAA	2	8	459850	459857	75 %	0 %	25 %	0 %	15835017
10252	NC_002620	T	6	6	459915	459920	0 %	100 %	0 %	0 %	15835017
10253	NC_002620	GGA	2	6	459995	460000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835017
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10255	NC_002620	TCC	2	6	460042	460047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835017
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10257	NC_002620	AT	3	6	460096	460101	50 %	50 %	0 %	0 %	15835017
10258	NC_002620	AG	4	8	460222	460229	50 %	0 %	50 %	0 %	15835018
10259	NC_002620	T	6	6	460257	460262	0 %	100 %	0 %	0 %	15835018
10260	NC_002620	AAGA	2	8	460293	460300	75 %	0 %	25 %	0 %	15835018
10261	NC_002620	AAG	2	6	460341	460346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835018
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10264	NC_002620	TGA	2	6	460509	460514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835018
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10269	NC_002620	AT	3	6	460709	460714	50 %	50 %	0 %	0 %	15835019
10270	NC_002620	AAG	2	6	460728	460733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835019
10271	NC_002620	TGA	2	6	460753	460758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835019
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10275	NC_002620	A	6	6	461064	461069	100 %	0 %	0 %	0 %	15835019
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10292	NC_002620	T	6	6	462000	462005	0 %	100 %	0 %	0 %	15835019
10293	NC_002620	A	7	7	462031	462037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10294	NC_002620	TGT	2	6	462041	462046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10295	NC_002620	AGAGA	2	10	462059	462068	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10296	NC_002620	T	8	8	462069	462076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10297	NC_002620	TTTTC	2	10	462081	462090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10298	NC_002620	TGC	2	6	462114	462119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10300	NC_002620	ATC	2	6	462139	462144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10302	NC_002620	TAAT	2	8	462254	462261	50 %	50 %	0 %	0 %	15835020
10303	NC_002620	CTC	2	6	462338	462343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835020
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10307	NC_002620	GAA	3	9	462687	462695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835021
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10310	NC_002620	TGATT	2	10	462841	462850	20 %	60 %	20 %	0 %	15835021
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10316	NC_002620	GAA	2	6	463180	463185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835022
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10320	NC_002620	T	6	6	463297	463302	0 %	100 %	0 %	0 %	15835022
10321	NC_002620	AAGA	2	8	463303	463310	75 %	0 %	25 %	0 %	15835022
10322	NC_002620	TCC	2	6	463315	463320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835022
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10335	NC_002620	ATT	2	6	463843	463848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835022
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10337	NC_002620	ATA	2	6	463905	463910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835022
10338	NC_002620	ACC	2	6	463948	463953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835022
10339	NC_002620	AAG	2	6	463970	463975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10340	NC_002620	A	8	8	464013	464020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10341	NC_002620	CAT	2	6	464051	464056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835023
10342	NC_002620	CAGTCA	2	12	464059	464070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15835023
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10345	NC_002620	CTG	2	6	464145	464150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835023
10346	NC_002620	TGA	2	6	464174	464179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835023
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10349	NC_002620	CTA	2	6	464288	464293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835023
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10355	NC_002620	TTG	2	6	464547	464552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835023
10356	NC_002620	TCA	2	6	464557	464562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835023
10357	NC_002620	GATTT	2	10	464626	464635	20 %	60 %	20 %	0 %	15835023
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10359	NC_002620	GA	3	6	464700	464705	50 %	0 %	50 %	0 %	15835023
10360	NC_002620	TAA	2	6	464718	464723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835023
10361	NC_002620	ATG	2	6	464761	464766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835023
10362	NC_002620	AAGA	2	8	464769	464776	75 %	0 %	25 %	0 %	15835023
10363	NC_002620	G	6	6	464777	464782	0 %	0 %	100 %	0 %	15835023
10364	NC_002620	AATAC	2	10	464796	464805	60 %	20 %	0 %	20 %	15835023
10365	NC_002620	A	6	6	464884	464889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_002620	T	7	7	464919	464925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_002620	ATG	2	6	464974	464979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_002620	AGT	2	6	464987	464992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10369	NC_002620	CTT	2	6	465021	465026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835024
10370	NC_002620	TATT	2	8	465046	465053	25 %	75 %	0 %	0 %	15835024
10371	NC_002620	GT	3	6	465069	465074	0 %	50 %	50 %	0 %	15835024
10372	NC_002620	TTGG	2	8	465085	465092	0 %	50 %	50 %	0 %	15835024
10373	NC_002620	TATT	2	8	465184	465191	25 %	75 %	0 %	0 %	15835024
10374	NC_002620	TTG	2	6	465250	465255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835024
10375	NC_002620	GCT	2	6	465285	465290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835024
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