MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_002491	ATA	2	6	936781	936786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836363
19503	NC_002491	GAA	3	9	936870	936878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836363
19504	NC_002491	T	6	6	936879	936884	0 %	100 %	0 %	0 %	15836363
19505	NC_002491	TAT	2	6	936949	936954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836363
19506	NC_002491	AAC	2	6	937025	937030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836363
19507	NC_002491	AG	3	6	937055	937060	50 %	0 %	50 %	0 %	15836363
19508	NC_002491	CGT	2	6	937067	937072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836363
19509	NC_002491	T	8	8	937080	937087	0 %	100 %	0 %	0 %	15836363
19510	NC_002491	AGA	2	6	937121	937126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836363
19511	NC_002491	T	6	6	937141	937146	0 %	100 %	0 %	0 %	15836363
19512	NC_002491	ATC	2	6	937197	937202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836363
19513	NC_002491	TGC	2	6	937274	937279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836363
19514	NC_002491	TTCC	2	8	937342	937349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19515	NC_002491	CTCTA	2	10	937444	937453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19516	NC_002491	AGAAA	2	10	937484	937493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_002491	TATTTA	2	12	937554	937565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_002491	AAT	2	6	937582	937587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_002491	T	7	7	937620	937626	0 %	100 %	0 %	0 %	15836364
19520	NC_002491	TATCTC	2	12	937718	937729	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15836364
19521	NC_002491	ATAG	2	8	937758	937765	50 %	25 %	25 %	0 %	15836364
19522	NC_002491	TTTC	2	8	937809	937816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19523	NC_002491	CTT	2	6	937860	937865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19524	NC_002491	ATT	2	6	937916	937921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_002491	TTGT	2	8	937936	937943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_002491	TTC	2	6	937994	937999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19527	NC_002491	ATC	2	6	938008	938013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19530	NC_002491	GATTT	2	10	938422	938431	20 %	60 %	20 %	0 %	15836365
19531	NC_002491	TTC	2	6	938637	938642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836365
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19541	NC_002491	TC	3	6	939205	939210	0 %	50 %	0 %	50 %	15836366
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19567	NC_002491	C	6	6	940486	940491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19571	NC_002491	TA	3	6	940602	940607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19572	NC_002491	T	6	6	940649	940654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19573	NC_002491	GAA	2	6	940827	940832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19593	NC_002491	CATA	2	8	941686	941693	50 %	25 %	0 %	25 %	15836368
19594	NC_002491	CAC	2	6	941696	941701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836368
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19604	NC_002491	TTC	2	6	942074	942079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836368
19605	NC_002491	TC	3	6	942109	942114	0 %	50 %	0 %	50 %	15836368
19606	NC_002491	AT	3	6	942129	942134	50 %	50 %	0 %	0 %	15836368
19607	NC_002491	T	7	7	942209	942215	0 %	100 %	0 %	0 %	15836368
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19615	NC_002491	GAAA	2	8	942611	942618	75 %	0 %	25 %	0 %	15836368
19616	NC_002491	A	6	6	942616	942621	100 %	0 %	0 %	0 %	15836368
19617	NC_002491	GAT	2	6	942637	942642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836368
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19998	NC_002491	GCTT	2	8	959961	959968	0 %	50 %	25 %	25 %	15836381
19999	NC_002491	ATCT	2	8	960041	960048	25 %	50 %	0 %	25 %	15836381
20000	NC_002491	AAG	2	6	960105	960110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836381

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