MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_002491	AAAGAA	2	12	672352	672363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15836116
14003	NC_002491	AAC	2	6	672437	672442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836116
14004	NC_002491	AAAG	2	8	672558	672565	75 %	0 %	25 %	0 %	15836116
14005	NC_002491	TCCTC	2	10	672571	672580	0 %	40 %	0 %	60 %	15836116
14006	NC_002491	CCA	2	6	672582	672587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836116
14007	NC_002491	CTC	2	6	672597	672602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836116
14008	NC_002491	ATC	2	6	672604	672609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836116
14009	NC_002491	TCT	2	6	672640	672645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836116
14010	NC_002491	CTT	2	6	672702	672707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836116
14011	NC_002491	CTCTT	2	10	672708	672717	0 %	60 %	0 %	40 %	15836116
14012	NC_002491	AG	3	6	672760	672765	50 %	0 %	50 %	0 %	15836116
14013	NC_002491	TTCC	2	8	672917	672924	0 %	50 %	0 %	50 %	15836116
14014	NC_002491	TTC	2	6	672952	672957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836116
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14016	NC_002491	AG	4	8	672965	672972	50 %	0 %	50 %	0 %	15836116
14017	NC_002491	A	6	6	673001	673006	100 %	0 %	0 %	0 %	15836116
14018	NC_002491	GGA	2	6	673021	673026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836116
14019	NC_002491	CCG	2	6	673052	673057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836116
14020	NC_002491	CTT	2	6	673062	673067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836116
14021	NC_002491	ATC	2	6	673072	673077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836116
14022	NC_002491	AAAG	2	8	673102	673109	75 %	0 %	25 %	0 %	15836116
14023	NC_002491	GCTA	2	8	673114	673121	25 %	25 %	25 %	25 %	15836116
14024	NC_002491	ATC	2	6	673165	673170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_002491	TTGCTC	2	12	673195	673206	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15836117
14026	NC_002491	TCT	2	6	673241	673246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836117
14027	NC_002491	TCT	2	6	673292	673297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836117
14028	NC_002491	GA	4	8	673305	673312	50 %	0 %	50 %	0 %	15836117
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14030	NC_002491	TGCA	2	8	673369	673376	25 %	25 %	25 %	25 %	15836117
14031	NC_002491	CTT	2	6	673398	673403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836117
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14033	NC_002491	GA	3	6	673555	673560	50 %	0 %	50 %	0 %	15836117
14034	NC_002491	AGC	2	6	673609	673614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836117
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14040	NC_002491	TGC	2	6	673874	673879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836117
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14044	NC_002491	GCT	2	6	673941	673946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836117
14045	NC_002491	CT	3	6	673967	673972	0 %	50 %	0 %	50 %	15836117
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14054	NC_002491	CAAAGC	2	12	674845	674856	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15836117
14055	NC_002491	CTG	2	6	674907	674912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836117
14056	NC_002491	GCA	2	6	674913	674918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836117
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14060	NC_002491	TCCA	2	8	674994	675001	25 %	25 %	0 %	50 %	15836117
14061	NC_002491	CTG	2	6	675004	675009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836117
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14063	NC_002491	CT	3	6	675082	675087	0 %	50 %	0 %	50 %	15836117
14064	NC_002491	CTA	2	6	675143	675148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_002491	ATT	2	6	675166	675171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_002491	ATA	2	6	675250	675255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_002491	T	6	6	675256	675261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_002491	TTCT	2	8	675265	675272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14069	NC_002491	A	6	6	675318	675323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14102	NC_002491	CTC	2	6	676391	676396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836118
14103	NC_002491	GGT	2	6	676627	676632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_002491	T	7	7	676667	676673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_002491	TATT	2	8	676712	676719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_002491	ATC	2	6	676785	676790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836119
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14108	NC_002491	CAA	2	6	676838	676843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836119
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14111	NC_002491	C	6	6	676902	676907	0 %	0 %	0 %	100 %	15836119
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14499	NC_002491	CTT	2	6	695938	695943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836137
14500	NC_002491	CAG	2	6	696060	696065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836138

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