MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_002491	ATA	3	9	528038	528046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_002491	A	6	6	528147	528152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_002491	A	6	6	528203	528208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_002491	A	6	6	528225	528230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_002491	GAA	2	6	528231	528236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_002491	A	6	6	528242	528247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_002491	CTG	2	6	528253	528258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_002491	TAA	2	6	528262	528267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_002491	TCA	2	6	528274	528279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_002491	AAAC	2	8	528280	528287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11012	NC_002491	GT	3	6	528299	528304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_002491	CA	4	8	528409	528416	50 %	0 %	0 %	50 %	15835993
11014	NC_002491	CTG	2	6	528492	528497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835993
11015	NC_002491	T	6	6	528569	528574	0 %	100 %	0 %	0 %	15835993
11016	NC_002491	ACT	2	6	528636	528641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835993
11017	NC_002491	ACG	2	6	528724	528729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835993
11018	NC_002491	CAG	2	6	528799	528804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835993
11019	NC_002491	AC	3	6	528945	528950	50 %	0 %	0 %	50 %	15835993
11020	NC_002491	GTTC	2	8	529006	529013	0 %	50 %	25 %	25 %	15835993
11021	NC_002491	T	6	6	529047	529052	0 %	100 %	0 %	0 %	15835993
11022	NC_002491	ATT	2	6	529064	529069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835993
11023	NC_002491	TCA	2	6	529098	529103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835993
11024	NC_002491	ACC	2	6	529129	529134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835993
11025	NC_002491	TTG	2	6	529197	529202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835993
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11029	NC_002491	GAAA	2	8	529465	529472	75 %	0 %	25 %	0 %	15835993
11030	NC_002491	TAG	2	6	529473	529478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835993
11031	NC_002491	GAA	2	6	529533	529538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835993
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11035	NC_002491	AG	3	6	529698	529703	50 %	0 %	50 %	0 %	15835993
11036	NC_002491	TAAA	2	8	529772	529779	75 %	25 %	0 %	0 %	15835993
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11038	NC_002491	CGA	2	6	529870	529875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835993
11039	NC_002491	CG	3	6	529949	529954	0 %	0 %	50 %	50 %	15835993
11040	NC_002491	TGA	2	6	529974	529979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835993
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11042	NC_002491	T	6	6	530131	530136	0 %	100 %	0 %	0 %	15835993
11043	NC_002491	AAC	2	6	530228	530233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835993
11044	NC_002491	TGA	2	6	530257	530262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835993
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11046	NC_002491	TGC	2	6	530328	530333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835993
11047	NC_002491	TA	3	6	530411	530416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_002491	A	7	7	530424	530430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_002491	TAA	2	6	530452	530457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_002491	AAC	2	6	530459	530464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_002491	TA	3	6	530476	530481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_002491	A	6	6	530481	530486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_002491	GAT	2	6	530530	530535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835994
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11055	NC_002491	T	6	6	530653	530658	0 %	100 %	0 %	0 %	15835994
11056	NC_002491	TACGA	2	10	530685	530694	40 %	20 %	20 %	20 %	15835994
11057	NC_002491	TATC	2	8	530740	530747	25 %	50 %	0 %	25 %	15835994
11058	NC_002491	GCTT	2	8	530775	530782	0 %	50 %	25 %	25 %	15835994
11059	NC_002491	GCG	2	6	530787	530792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15835994
11060	NC_002491	CTG	2	6	530947	530952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835994
11061	NC_002491	GCA	2	6	531042	531047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835994
11062	NC_002491	CT	3	6	531068	531073	0 %	50 %	0 %	50 %	15835994
11063	NC_002491	ACT	2	6	531203	531208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835994
11064	NC_002491	AT	3	6	531226	531231	50 %	50 %	0 %	0 %	15835994
11065	NC_002491	AGT	2	6	531241	531246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835994
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11073	NC_002491	CTG	2	6	531427	531432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835994
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11083	NC_002491	CT	3	6	531842	531847	0 %	50 %	0 %	50 %	15835995
11084	NC_002491	TA	3	6	532039	532044	50 %	50 %	0 %	0 %	15835995
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11091	NC_002491	AG	3	6	532364	532369	50 %	0 %	50 %	0 %	15835996
11092	NC_002491	TACA	2	8	532385	532392	50 %	25 %	0 %	25 %	15835996
11093	NC_002491	AAT	2	6	532400	532405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835996
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11095	NC_002491	TGC	2	6	532475	532480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835996
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11098	NC_002491	TACTT	2	10	532554	532563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11099	NC_002491	A	6	6	532565	532570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_002491	A	6	6	532574	532579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_002491	TAT	2	6	532582	532587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_002491	TAA	2	6	532592	532597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_002491	AGG	2	6	532735	532740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11105	NC_002491	TGC	2	6	532843	532848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_002491	ATG	2	6	532862	532867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_002491	A	6	6	532906	532911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_002491	GTCTT	2	10	532925	532934	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11109	NC_002491	ACT	2	6	532952	532957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_002491	A	6	6	532990	532995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_002491	TTTC	2	8	533020	533027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_002491	T	7	7	533049	533055	0 %	100 %	0 %	0 %	15835997
11113	NC_002491	AGC	2	6	533150	533155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835997
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11115	NC_002491	TCT	2	6	533305	533310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835997
11116	NC_002491	GAA	2	6	533315	533320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835997
11117	NC_002491	TGTC	2	8	533321	533328	0 %	50 %	25 %	25 %	15835997
11118	NC_002491	TGC	2	6	533351	533356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835997
11119	NC_002491	TAC	2	6	533396	533401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835997
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11121	NC_002491	TAA	2	6	533483	533488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835997
11122	NC_002491	G	6	6	533531	533536	0 %	0 %	100 %	0 %	15835997
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11125	NC_002491	A	6	6	533757	533762	100 %	0 %	0 %	0 %	15835997
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11251	NC_002491	GCA	2	6	539919	539924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836000
11252	NC_002491	GCG	2	6	539929	539934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836000
11253	NC_002491	AC	3	6	539942	539947	50 %	0 %	0 %	50 %	15836000
11254	NC_002491	TAA	2	6	539990	539995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836000
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11259	NC_002491	AAT	2	6	540096	540101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836000
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11288	NC_002491	TCCA	2	8	541520	541527	25 %	25 %	0 %	50 %	15836001
11289	NC_002491	CAT	2	6	541588	541593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836001
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11325	NC_002491	ATA	3	9	542958	542966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836002
11326	NC_002491	TAC	2	6	543075	543080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836002
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11328	NC_002491	AT	3	6	543160	543165	50 %	50 %	0 %	0 %	15836002
11329	NC_002491	TGA	2	6	543187	543192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836002
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11342	NC_002491	AG	3	6	544141	544146	50 %	0 %	50 %	0 %	15836002
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11345	NC_002491	CT	4	8	544263	544270	0 %	50 %	0 %	50 %	15836002
11346	NC_002491	CT	3	6	544273	544278	0 %	50 %	0 %	50 %	15836002
11347	NC_002491	CGTT	2	8	544336	544343	0 %	50 %	25 %	25 %	15836002
11348	NC_002491	TA	3	6	544407	544412	50 %	50 %	0 %	0 %	15836002
11349	NC_002491	CCTA	2	8	544466	544473	25 %	25 %	0 %	50 %	15836002
11350	NC_002491	GCTT	2	8	544486	544493	0 %	50 %	25 %	25 %	15836002
11351	NC_002491	CAA	2	6	544511	544516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836002
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11353	NC_002491	GAA	2	6	544608	544613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836002
11354	NC_002491	TCA	2	6	544673	544678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836002
11355	NC_002491	ACG	2	6	544679	544684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836002
11356	NC_002491	TA	3	6	544732	544737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11357	NC_002491	AG	3	6	544764	544769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_002491	CT	3	6	544779	544784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11359	NC_002491	CAT	2	6	544787	544792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11360	NC_002491	ACT	2	6	544885	544890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11361	NC_002491	GTA	2	6	544932	544937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836003
11362	NC_002491	GGA	2	6	545009	545014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836003
11363	NC_002491	CT	3	6	545021	545026	0 %	50 %	0 %	50 %	15836003
11364	NC_002491	TCA	2	6	545177	545182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836003
11365	NC_002491	TCTA	2	8	545236	545243	25 %	50 %	0 %	25 %	15836003
11366	NC_002491	AT	3	6	545284	545289	50 %	50 %	0 %	0 %	15836003
11367	NC_002491	CACCTG	2	12	545349	545360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15836003
11368	NC_002491	CTC	2	6	545392	545397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836003
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11370	NC_002491	GCT	2	6	545452	545457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836003
11371	NC_002491	GAAG	2	8	545510	545517	50 %	0 %	50 %	0 %	15836003
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11373	NC_002491	CAG	2	6	545580	545585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836003
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11497	NC_002491	AGG	2	6	551037	551042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836006
11498	NC_002491	TCCCT	2	10	551103	551112	0 %	40 %	0 %	60 %	15836006
11499	NC_002491	TCA	3	9	551128	551136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836006
11500	NC_002491	AGGA	2	8	551186	551193	50 %	0 %	50 %	0 %	15836006

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