MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002491	TTAG	2	8	261686	261693	25 %	50 %	25 %	0 %	15835756
5502	NC_002491	A	6	6	261713	261718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_002491	TTC	2	6	261784	261789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_002491	ATGA	2	8	261856	261863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_002491	CT	3	6	261893	261898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_002491	AAG	2	6	261905	261910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_002491	CA	3	6	261949	261954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_002491	TC	4	8	262026	262033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_002491	CTT	2	6	262262	262267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835757
5510	NC_002491	ATG	2	6	262301	262306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835757
5511	NC_002491	AAGA	2	8	262371	262378	75 %	0 %	25 %	0 %	15835757
5512	NC_002491	ATC	2	6	262448	262453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835757
5513	NC_002491	T	7	7	262476	262482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_002491	TTA	2	6	262532	262537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_002491	AGT	2	6	262596	262601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835758
5516	NC_002491	CAA	2	6	262621	262626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835758
5517	NC_002491	A	6	6	262625	262630	100 %	0 %	0 %	0 %	15835758
5518	NC_002491	CCT	2	6	262714	262719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835758
5519	NC_002491	TTC	2	6	262738	262743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835758
5520	NC_002491	CT	3	6	262745	262750	0 %	50 %	0 %	50 %	15835758
5521	NC_002491	CT	3	6	262797	262802	0 %	50 %	0 %	50 %	15835758
5522	NC_002491	CTTAGG	2	12	262868	262879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15835758
5523	NC_002491	ATT	2	6	262902	262907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835758
5524	NC_002491	AAC	2	6	262957	262962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835758
5525	NC_002491	A	8	8	263042	263049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_002491	TAT	2	6	263071	263076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835759
5527	NC_002491	T	7	7	263076	263082	0 %	100 %	0 %	0 %	15835759
5528	NC_002491	GAC	2	6	263241	263246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835759
5529	NC_002491	A	6	6	263282	263287	100 %	0 %	0 %	0 %	15835759
5530	NC_002491	AC	3	6	263299	263304	50 %	0 %	0 %	50 %	15835759
5531	NC_002491	ACC	2	6	263369	263374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_002491	TTA	2	6	263377	263382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_002491	ACA	2	6	263522	263527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835760
5534	NC_002491	GTTT	2	8	263604	263611	0 %	75 %	25 %	0 %	15835760
5535	NC_002491	TGC	2	6	263674	263679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835760
5536	NC_002491	TTA	2	6	263753	263758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835760
5537	NC_002491	AAG	2	6	263949	263954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835760
5538	NC_002491	AGC	2	6	263962	263967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835760
5539	NC_002491	TTC	2	6	263968	263973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835760
5540	NC_002491	CGA	2	6	264038	264043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835760
5541	NC_002491	A	7	7	264053	264059	100 %	0 %	0 %	0 %	15835760
5542	NC_002491	GGA	2	6	264067	264072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835760
5543	NC_002491	AAG	2	6	264120	264125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835760
5544	NC_002491	AGA	2	6	264142	264147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835760
5545	NC_002491	AAAG	2	8	264156	264163	75 %	0 %	25 %	0 %	15835760
5546	NC_002491	TGC	2	6	264358	264363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835761
5547	NC_002491	TAT	2	6	264538	264543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835761
5548	NC_002491	AG	3	6	264561	264566	50 %	0 %	50 %	0 %	15835761
5549	NC_002491	T	7	7	264640	264646	0 %	100 %	0 %	0 %	15835762
5550	NC_002491	CAA	2	6	264681	264686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835762
5551	NC_002491	AAAG	2	8	264717	264724	75 %	0 %	25 %	0 %	15835762
5552	NC_002491	TTG	2	6	264729	264734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835762
5553	NC_002491	TAGA	2	8	264797	264804	50 %	25 %	25 %	0 %	15835762
5554	NC_002491	AGGA	2	8	264829	264836	50 %	0 %	50 %	0 %	15835762
5555	NC_002491	TTGA	2	8	264845	264852	25 %	50 %	25 %	0 %	15835762
5556	NC_002491	AGTG	2	8	264889	264896	25 %	25 %	50 %	0 %	15835762
5557	NC_002491	ACAG	2	8	264900	264907	50 %	0 %	25 %	25 %	15835762
5558	NC_002491	TAG	2	6	264917	264922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835762
5559	NC_002491	A	6	6	264960	264965	100 %	0 %	0 %	0 %	15835762
5560	NC_002491	ATC	2	6	265034	265039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835762
5561	NC_002491	AGT	2	6	265120	265125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835763
5562	NC_002491	TCC	2	6	265157	265162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835763
5563	NC_002491	ATT	2	6	265184	265189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835763
5564	NC_002491	CTT	2	6	265190	265195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835763
5565	NC_002491	ATTT	2	8	265265	265272	25 %	75 %	0 %	0 %	15835763
5566	NC_002491	TGA	2	6	265398	265403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835763
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5568	NC_002491	CTT	2	6	265499	265504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835763
5569	NC_002491	AGT	2	6	265523	265528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835763
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5572	NC_002491	T	6	6	265658	265663	0 %	100 %	0 %	0 %	15835763
5573	NC_002491	A	6	6	265691	265696	100 %	0 %	0 %	0 %	15835763
5574	NC_002491	A	6	6	265774	265779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_002491	T	6	6	265802	265807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_002491	TTTAAG	2	12	265833	265844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_002491	TTA	2	6	265917	265922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_002491	A	6	6	265926	265931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_002491	T	6	6	265997	266002	0 %	100 %	0 %	0 %	15835764
5580	NC_002491	TCC	2	6	266014	266019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835764
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5584	NC_002491	TTCTC	2	10	266150	266159	0 %	60 %	0 %	40 %	15835764
5585	NC_002491	CTA	2	6	266221	266226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835764
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5589	NC_002491	CTT	2	6	266456	266461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835764
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5591	NC_002491	TC	4	8	266507	266514	0 %	50 %	0 %	50 %	15835764
5592	NC_002491	CA	3	6	266538	266543	50 %	0 %	0 %	50 %	15835764
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5598	NC_002491	GTT	2	6	266968	266973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835764
5599	NC_002491	TAT	2	6	266978	266983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835764
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5602	NC_002491	ATC	2	6	267114	267119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835764
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5611	NC_002491	AG	3	6	267458	267463	50 %	0 %	50 %	0 %	15835765
5612	NC_002491	TTA	2	6	267475	267480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835765
5613	NC_002491	TTTTC	2	10	267485	267494	0 %	80 %	0 %	20 %	15835765
5614	NC_002491	TGG	2	6	267568	267573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835765
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