MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 38885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002163	GGT	2	6	553778	553783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218562247
13002	NC_002163	TTGG	2	8	553788	553795	0 %	50 %	50 %	0 %	218562247
13003	NC_002163	ATCA	2	8	553800	553807	50 %	25 %	0 %	25 %	218562247
13004	NC_002163	TGC	2	6	553831	553836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218562247
13005	NC_002163	TAC	2	6	553861	553866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218562247
13006	NC_002163	TCAAA	2	10	553930	553939	60 %	20 %	0 %	20 %	218562247
13007	NC_002163	TGA	2	6	553942	553947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562247
13008	NC_002163	GAA	2	6	553982	553987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562247
13009	NC_002163	A	6	6	553991	553996	100 %	0 %	0 %	0 %	218562247
13010	NC_002163	ATCA	2	8	554000	554007	50 %	25 %	0 %	25 %	218562247
13011	NC_002163	ATAA	2	8	554046	554053	75 %	25 %	0 %	0 %	218562247
13012	NC_002163	TAA	2	6	554103	554108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562248
13013	NC_002163	CTG	2	6	554147	554152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218562248
13014	NC_002163	TGT	2	6	554157	554162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218562248
13015	NC_002163	A	7	7	554199	554205	100 %	0 %	0 %	0 %	218562248
13016	NC_002163	TTA	2	6	554219	554224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562248
13017	NC_002163	TGG	2	6	554238	554243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218562248
13018	NC_002163	AC	3	6	554355	554360	50 %	0 %	0 %	50 %	218562248
13019	NC_002163	TGC	2	6	554367	554372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218562248
13020	NC_002163	A	7	7	554425	554431	100 %	0 %	0 %	0 %	218562248
13021	NC_002163	TTTA	2	8	554445	554452	25 %	75 %	0 %	0 %	218562248
13022	NC_002163	GAA	2	6	554476	554481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13023	NC_002163	AGA	2	6	554487	554492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13024	NC_002163	GAA	2	6	554578	554583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13025	NC_002163	ATA	2	6	554594	554599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562248
13026	NC_002163	AGA	2	6	554634	554639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13027	NC_002163	GCA	2	6	554692	554697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218562248
13028	NC_002163	A	6	6	554760	554765	100 %	0 %	0 %	0 %	218562248
13029	NC_002163	GCGGTA	2	12	554834	554845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218562248
13030	NC_002163	TGA	2	6	554997	555002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562248
13031	NC_002163	A	6	6	555013	555018	100 %	0 %	0 %	0 %	218562248
13032	NC_002163	AAG	2	6	555042	555047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13033	NC_002163	GAA	2	6	555052	555057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562248
13034	NC_002163	TAAAA	2	10	555180	555189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_002163	ATT	2	6	555293	555298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562249
13036	NC_002163	TTA	2	6	555378	555383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562249
13037	NC_002163	T	8	8	555396	555403	0 %	100 %	0 %	0 %	218562249
13038	NC_002163	AAC	2	6	555456	555461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218562249
13039	NC_002163	TGA	2	6	555550	555555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13040	NC_002163	AT	3	6	555568	555573	50 %	50 %	0 %	0 %	218562249
13041	NC_002163	ATG	2	6	555626	555631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13042	NC_002163	AGTGG	2	10	555728	555737	20 %	20 %	60 %	0 %	218562249
13043	NC_002163	TGG	2	6	555782	555787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218562249
13044	NC_002163	T	6	6	555791	555796	0 %	100 %	0 %	0 %	218562249
13045	NC_002163	A	7	7	555840	555846	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13046	NC_002163	T	7	7	555860	555866	0 %	100 %	0 %	0 %	218562249
13047	NC_002163	AGA	2	6	555874	555879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13048	NC_002163	A	6	6	555921	555926	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13049	NC_002163	ATG	2	6	555954	555959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13050	NC_002163	T	7	7	555961	555967	0 %	100 %	0 %	0 %	218562249
13051	NC_002163	AGA	2	6	556027	556032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13052	NC_002163	AGT	2	6	556049	556054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13053	NC_002163	CAAA	2	8	556063	556070	75 %	0 %	0 %	25 %	218562249
13054	NC_002163	TCAA	2	8	556155	556162	50 %	25 %	0 %	25 %	218562249
13055	NC_002163	GCTT	2	8	556206	556213	0 %	50 %	25 %	25 %	218562249
13056	NC_002163	AGT	2	6	556220	556225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13057	NC_002163	TCA	2	6	556234	556239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218562249
13058	NC_002163	A	6	6	556269	556274	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13059	NC_002163	AAGC	2	8	556353	556360	50 %	0 %	25 %	25 %	218562249
13060	NC_002163	AAG	2	6	556386	556391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13061	NC_002163	GAA	3	9	556397	556405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13062	NC_002163	A	6	6	556404	556409	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13063	NC_002163	ATG	2	6	556430	556435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13064	NC_002163	A	6	6	556445	556450	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13065	NC_002163	TGA	2	6	556465	556470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13066	NC_002163	ATG	2	6	556484	556489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13067	NC_002163	CAAA	2	8	556534	556541	75 %	0 %	0 %	25 %	218562249
13068	NC_002163	AGA	2	6	556543	556548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13069	NC_002163	GAA	2	6	556568	556573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562249
13070	NC_002163	ATG	2	6	556617	556622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562249
13071	NC_002163	A	6	6	556627	556632	100 %	0 %	0 %	0 %	218562249
13072	NC_002163	AAAT	2	8	556645	556652	75 %	25 %	0 %	0 %	218562249
13073	NC_002163	AGA	2	6	556668	556673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562250
13074	NC_002163	TGTT	2	8	556718	556725	0 %	75 %	25 %	0 %	218562250
13075	NC_002163	TTG	2	6	556748	556753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218562250
13076	NC_002163	AGA	2	6	556836	556841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562250
13077	NC_002163	AAG	2	6	556853	556858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562250
13078	NC_002163	ATA	2	6	556994	556999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562250
13079	NC_002163	A	6	6	557038	557043	100 %	0 %	0 %	0 %	218562250
13080	NC_002163	AAG	2	6	557066	557071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562250
13081	NC_002163	ATA	3	9	557153	557161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562250
13082	NC_002163	CTG	2	6	557198	557203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218562250
13083	NC_002163	A	6	6	557235	557240	100 %	0 %	0 %	0 %	218562250
13084	NC_002163	AGGCAA	2	12	557243	557254	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218562250
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13086	NC_002163	ATT	2	6	557332	557337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562250
13087	NC_002163	A	6	6	557390	557395	100 %	0 %	0 %	0 %	218562250
13088	NC_002163	TGA	2	6	557408	557413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562250
13089	NC_002163	GATAAG	2	12	557512	557523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218562250
13090	NC_002163	GTC	2	6	557525	557530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218562250
13091	NC_002163	A	6	6	557622	557627	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13092	NC_002163	GAT	2	6	557663	557668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562251
13093	NC_002163	TTA	2	6	557669	557674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562251
13094	NC_002163	AATC	2	8	557738	557745	50 %	25 %	0 %	25 %	218562251
13095	NC_002163	GGA	2	6	557759	557764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218562251
13096	NC_002163	GGC	2	6	557782	557787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218562251
13097	NC_002163	A	6	6	557838	557843	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13098	NC_002163	AAT	2	6	557861	557866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562251
13099	NC_002163	GCTTTA	2	12	557882	557893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218562251
13100	NC_002163	CTTTGT	2	12	557949	557960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218562251
13101	NC_002163	A	6	6	557963	557968	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13102	NC_002163	GAT	2	6	557969	557974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562251
13103	NC_002163	CAAAGT	2	12	558050	558061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218562251
13104	NC_002163	T	7	7	558081	558087	0 %	100 %	0 %	0 %	218562251
13105	NC_002163	T	6	6	558115	558120	0 %	100 %	0 %	0 %	218562251
13106	NC_002163	A	6	6	558182	558187	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13107	NC_002163	A	6	6	558248	558253	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13108	NC_002163	TAAAGT	2	12	558303	558314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218562251
13109	NC_002163	TTG	2	6	558332	558337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218562251
13110	NC_002163	A	6	6	558380	558385	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13111	NC_002163	TA	3	6	558395	558400	50 %	50 %	0 %	0 %	218562251
13112	NC_002163	AG	3	6	558436	558441	50 %	0 %	50 %	0 %	218562251
13113	NC_002163	A	6	6	558452	558457	100 %	0 %	0 %	0 %	218562251
13114	NC_002163	AAT	2	6	558491	558496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562252
13115	NC_002163	TA	3	6	558506	558511	50 %	50 %	0 %	0 %	218562252
13116	NC_002163	ATA	2	6	558518	558523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562252
13117	NC_002163	A	7	7	558622	558628	100 %	0 %	0 %	0 %	218562252
13118	NC_002163	ACAA	2	8	558639	558646	75 %	0 %	0 %	25 %	218562252
13119	NC_002163	T	6	6	558684	558689	0 %	100 %	0 %	0 %	218562252
13120	NC_002163	TGA	2	6	558694	558699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562252
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13122	NC_002163	TAA	3	9	558823	558831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562252
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13233	NC_002163	ATGC	2	8	563514	563521	25 %	25 %	25 %	25 %	218562256
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13245	NC_002163	TCC	2	6	564110	564115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218562256
13246	NC_002163	ATG	2	6	564124	564129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562256
13247	NC_002163	GAA	2	6	564177	564182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218562256
13248	NC_002163	TCT	2	6	564195	564200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218562256
13249	NC_002163	T	6	6	564230	564235	0 %	100 %	0 %	0 %	218562256
13250	NC_002163	TTG	2	6	564265	564270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218562256
13251	NC_002163	ATC	2	6	564289	564294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218562256
13252	NC_002163	CAT	2	6	564303	564308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218562256
13253	NC_002163	GAT	2	6	564327	564332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562256
13254	NC_002163	GTGAT	2	10	564358	564367	20 %	40 %	40 %	0 %	218562256
13255	NC_002163	A	6	6	564415	564420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_002163	A	6	6	564426	564431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_002163	TTA	2	6	564469	564474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562257
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13259	NC_002163	TTATT	2	10	564530	564539	20 %	80 %	0 %	0 %	218562257
13260	NC_002163	T	8	8	564538	564545	0 %	100 %	0 %	0 %	218562257
13261	NC_002163	AAT	2	6	564546	564551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562257
13262	NC_002163	A	6	6	564556	564561	100 %	0 %	0 %	0 %	218562257
13263	NC_002163	A	6	6	564577	564582	100 %	0 %	0 %	0 %	218562257
13264	NC_002163	A	8	8	564586	564593	100 %	0 %	0 %	0 %	218562257
13265	NC_002163	AT	3	6	564595	564600	50 %	50 %	0 %	0 %	218562257
13266	NC_002163	GATAAA	2	12	564738	564749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218562257
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13269	NC_002163	A	6	6	564813	564818	100 %	0 %	0 %	0 %	218562257
13270	NC_002163	AG	3	6	564852	564857	50 %	0 %	50 %	0 %	218562257
13271	NC_002163	A	7	7	564907	564913	100 %	0 %	0 %	0 %	218562257
13272	NC_002163	ATT	2	6	564916	564921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562257
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13275	NC_002163	TGT	2	6	565037	565042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218562257
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13278	NC_002163	AGTG	2	8	565265	565272	25 %	25 %	50 %	0 %	218562257
13279	NC_002163	CAAGCT	2	12	565282	565293	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218562257
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13282	NC_002163	TATT	2	8	565334	565341	25 %	75 %	0 %	0 %	218562257
13283	NC_002163	GAT	2	6	565371	565376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218562257
13284	NC_002163	T	6	6	565376	565381	0 %	100 %	0 %	0 %	218562257
13285	NC_002163	TAT	2	6	565479	565484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562257
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13287	NC_002163	ATGAAG	2	12	565576	565587	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218562257
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13297	NC_002163	AAGA	2	8	565980	565987	75 %	0 %	25 %	0 %	218562258
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13299	NC_002163	GCA	2	6	566068	566073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218562258
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13361	NC_002163	T	6	6	569107	569112	0 %	100 %	0 %	0 %	218562260
13362	NC_002163	CTT	2	6	569113	569118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218562260
13363	NC_002163	A	7	7	569150	569156	100 %	0 %	0 %	0 %	218562260
13364	NC_002163	TGG	2	6	569201	569206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218562260
13365	NC_002163	T	7	7	569261	569267	0 %	100 %	0 %	0 %	218562260
13366	NC_002163	CAT	2	6	569311	569316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218562260
13367	NC_002163	AAT	2	6	569333	569338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562260
13368	NC_002163	AGTTCT	2	12	569355	569366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218562260
13369	NC_002163	T	7	7	569366	569372	0 %	100 %	0 %	0 %	218562260
13370	NC_002163	CTT	2	6	569377	569382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218562260
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13372	NC_002163	ATTG	2	8	569417	569424	25 %	50 %	25 %	0 %	218562260
13373	NC_002163	ATT	2	6	569444	569449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562260
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13376	NC_002163	AGTTCT	2	12	569523	569534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218562260
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13380	NC_002163	TAT	2	6	569711	569716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218562260
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13384	NC_002163	GCC	2	6	569895	569900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218562260
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13386	NC_002163	T	8	8	569951	569958	0 %	100 %	0 %	0 %	218562260
13387	NC_002163	T	7	7	569975	569981	0 %	100 %	0 %	0 %	218562260
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13450	NC_002163	AAAATT	2	12	572392	572403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218562262
13451	NC_002163	AATA	2	8	572441	572448	75 %	25 %	0 %	0 %	218562262
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13453	NC_002163	ATA	2	6	572526	572531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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