MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_000922	T	6	6	1153834	1153839	0 %	100 %	0 %	0 %	15618909
24003	NC_000922	AG	3	6	1153852	1153857	50 %	0 %	50 %	0 %	15618909
24004	NC_000922	AAAAT	2	10	1153866	1153875	80 %	20 %	0 %	0 %	15618909
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24007	NC_000922	CT	3	6	1154075	1154080	0 %	50 %	0 %	50 %	15618910
24008	NC_000922	AGT	2	6	1154104	1154109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618911
24009	NC_000922	TCTTT	2	10	1154124	1154133	0 %	80 %	0 %	20 %	15618911
24010	NC_000922	T	6	6	1154131	1154136	0 %	100 %	0 %	0 %	15618911
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24013	NC_000922	AAG	2	6	1154303	1154308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618911
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24105	NC_000922	CCA	2	6	1157893	1157898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618916
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24122	NC_000922	TCT	2	6	1158572	1158577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618917
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24230	NC_000922	T	6	6	1163630	1163635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24231	NC_000922	AG	3	6	1163638	1163643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24232	NC_000922	CT	3	6	1163757	1163762	0 %	50 %	0 %	50 %	15618922
24233	NC_000922	GAT	2	6	1163842	1163847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618922
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24238	NC_000922	ATCT	2	8	1164034	1164041	25 %	50 %	0 %	25 %	15618922
24239	NC_000922	GAA	3	9	1164050	1164058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618922
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24241	NC_000922	CAT	2	6	1164200	1164205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618922
24242	NC_000922	GCT	2	6	1164219	1164224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618922
24243	NC_000922	GAG	2	6	1164260	1164265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618922
24244	NC_000922	T	6	6	1164278	1164283	0 %	100 %	0 %	0 %	15618922
24245	NC_000922	GTG	2	6	1164308	1164313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618922
24246	NC_000922	AATCAA	2	12	1164335	1164346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15618922
24247	NC_000922	AGTG	2	8	1164380	1164387	25 %	25 %	50 %	0 %	15618922
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24264	NC_000922	T	6	6	1165505	1165510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24265	NC_000922	T	6	6	1165515	1165520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24273	NC_000922	CTT	2	6	1165957	1165962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618923
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24357	NC_000922	TTTAT	2	10	1169479	1169488	20 %	80 %	0 %	0 %	15618925
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24362	NC_000922	ATC	2	6	1169845	1169850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618925
24363	NC_000922	AT	3	6	1169880	1169885	50 %	50 %	0 %	0 %	15618925
24364	NC_000922	GTT	2	6	1169928	1169933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618925
24365	NC_000922	TCT	3	9	1169986	1169994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618926
24366	NC_000922	AG	3	6	1170000	1170005	50 %	0 %	50 %	0 %	15618926
24367	NC_000922	ATT	2	6	1170047	1170052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618926
24368	NC_000922	T	7	7	1170051	1170057	0 %	100 %	0 %	0 %	15618926
24369	NC_000922	AAG	2	6	1170139	1170144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618926
24370	NC_000922	GA	3	6	1170157	1170162	50 %	0 %	50 %	0 %	15618926
24371	NC_000922	TC	3	6	1170265	1170270	0 %	50 %	0 %	50 %	15618926
24372	NC_000922	TGT	2	6	1170272	1170277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618926
24373	NC_000922	TTC	2	6	1170326	1170331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618926
24374	NC_000922	CT	3	6	1170348	1170353	0 %	50 %	0 %	50 %	15618926
24375	NC_000922	TC	3	6	1170398	1170403	0 %	50 %	0 %	50 %	15618926
24376	NC_000922	CTT	2	6	1170409	1170414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618926
24377	NC_000922	TTC	2	6	1170431	1170436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618926
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24380	NC_000922	GGAA	2	8	1170541	1170548	50 %	0 %	50 %	0 %	15618926
24381	NC_000922	GCT	2	6	1170568	1170573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618926
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24383	NC_000922	CTT	2	6	1170766	1170771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24384	NC_000922	CT	3	6	1170801	1170806	0 %	50 %	0 %	50 %	15618927
24385	NC_000922	AG	3	6	1170849	1170854	50 %	0 %	50 %	0 %	15618927
24386	NC_000922	AAG	2	6	1170879	1170884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618927
24387	NC_000922	CGC	2	6	1171049	1171054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15618927
24388	NC_000922	CT	3	6	1171082	1171087	0 %	50 %	0 %	50 %	15618927
24389	NC_000922	TTC	2	6	1171088	1171093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
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24391	NC_000922	TGT	2	6	1171290	1171295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618927
24392	NC_000922	CTT	3	9	1171333	1171341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24393	NC_000922	CTT	2	6	1171363	1171368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24394	NC_000922	TTC	2	6	1171388	1171393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24395	NC_000922	TTG	2	6	1171400	1171405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618927
24396	NC_000922	TG	4	8	1171494	1171501	0 %	50 %	50 %	0 %	15618927
24397	NC_000922	TGC	2	6	1171567	1171572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618927
24398	NC_000922	GCTT	2	8	1171616	1171623	0 %	50 %	25 %	25 %	15618927
24399	NC_000922	TTG	2	6	1171625	1171630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618927
24400	NC_000922	GACA	2	8	1171652	1171659	50 %	0 %	25 %	25 %	15618927
24401	NC_000922	GTT	2	6	1171731	1171736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618927
24402	NC_000922	TGC	2	6	1171776	1171781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618927
24403	NC_000922	AAGCT	2	10	1171801	1171810	40 %	20 %	20 %	20 %	15618927
24404	NC_000922	CTG	2	6	1171814	1171819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618927
24405	NC_000922	T	6	6	1171872	1171877	0 %	100 %	0 %	0 %	15618927
24406	NC_000922	CTT	2	6	1171891	1171896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24407	NC_000922	GCA	2	6	1172031	1172036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618927
24408	NC_000922	ACA	2	6	1172037	1172042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618927
24409	NC_000922	CTT	2	6	1172044	1172049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618927
24410	NC_000922	AGG	3	9	1172090	1172098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618927
24411	NC_000922	ATA	2	6	1172127	1172132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618927
24412	NC_000922	TCT	2	6	1172135	1172140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24413	NC_000922	TCAAT	2	10	1172287	1172296	40 %	40 %	0 %	20 %	15618928
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24415	NC_000922	GA	3	6	1172469	1172474	50 %	0 %	50 %	0 %	15618928
24416	NC_000922	GAC	2	6	1172492	1172497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618928
24417	NC_000922	TTC	2	6	1172531	1172536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618928
24418	NC_000922	T	6	6	1172538	1172543	0 %	100 %	0 %	0 %	15618928
24419	NC_000922	A	7	7	1172621	1172627	100 %	0 %	0 %	0 %	15618928
24420	NC_000922	CAA	2	6	1172665	1172670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618928
24421	NC_000922	AAAC	2	8	1172686	1172693	75 %	0 %	0 %	25 %	15618928
24422	NC_000922	TTTC	2	8	1172746	1172753	0 %	75 %	0 %	25 %	15618928
24423	NC_000922	GAA	2	6	1172847	1172852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618928
24424	NC_000922	GGA	3	9	1172913	1172921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618928
24425	NC_000922	TGC	2	6	1172939	1172944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618928
24426	NC_000922	CTATT	2	10	1172950	1172959	20 %	60 %	0 %	20 %	15618928
24427	NC_000922	TTG	2	6	1172975	1172980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618928
24428	NC_000922	ATCCTG	2	12	1173011	1173022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15618928
24429	NC_000922	T	7	7	1173070	1173076	0 %	100 %	0 %	0 %	15618928
24430	NC_000922	CTG	2	6	1173086	1173091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618928
24431	NC_000922	CTCTT	2	10	1173113	1173122	0 %	60 %	0 %	40 %	15618928
24432	NC_000922	GGA	2	6	1173130	1173135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618928
24433	NC_000922	AAC	2	6	1173189	1173194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618928
24434	NC_000922	TGT	3	9	1173201	1173209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618928
24435	NC_000922	CTT	2	6	1173241	1173246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618928
24436	NC_000922	T	7	7	1173348	1173354	0 %	100 %	0 %	0 %	15618928
24437	NC_000922	A	6	6	1173358	1173363	100 %	0 %	0 %	0 %	15618928
24438	NC_000922	TGT	2	6	1173397	1173402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618928
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24440	NC_000922	AAT	2	6	1173458	1173463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618928
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24442	NC_000922	AGG	2	6	1173485	1173490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618928
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24444	NC_000922	TTGA	2	8	1173635	1173642	25 %	50 %	25 %	0 %	15618928
24445	NC_000922	GAA	2	6	1173643	1173648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618928
24446	NC_000922	CTTG	2	8	1173654	1173661	0 %	50 %	25 %	25 %	15618928
24447	NC_000922	ATT	2	6	1173694	1173699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618929
24448	NC_000922	TCT	2	6	1173723	1173728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618929
24449	NC_000922	TTGTG	2	10	1173750	1173759	0 %	60 %	40 %	0 %	15618929
24450	NC_000922	CTT	2	6	1173793	1173798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618929
24451	NC_000922	AG	3	6	1173921	1173926	50 %	0 %	50 %	0 %	15618929
24452	NC_000922	GAA	2	6	1173965	1173970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618929
24453	NC_000922	TA	3	6	1174039	1174044	50 %	50 %	0 %	0 %	15618929
24454	NC_000922	GGA	2	6	1174061	1174066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618929
24455	NC_000922	GGTA	2	8	1174084	1174091	25 %	25 %	50 %	0 %	15618929
24456	NC_000922	ATC	2	6	1174142	1174147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618929
24457	NC_000922	T	6	6	1174183	1174188	0 %	100 %	0 %	0 %	15618929
24458	NC_000922	AAT	2	6	1174195	1174200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618929
24459	NC_000922	GC	3	6	1174276	1174281	0 %	0 %	50 %	50 %	15618930
24460	NC_000922	TGA	2	6	1174283	1174288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618930
24461	NC_000922	GTCC	2	8	1174321	1174328	0 %	25 %	25 %	50 %	15618930
24462	NC_000922	T	6	6	1174392	1174397	0 %	100 %	0 %	0 %	15618930
24463	NC_000922	CAAT	2	8	1174490	1174497	50 %	25 %	0 %	25 %	15618930
24464	NC_000922	TCTT	2	8	1174499	1174506	0 %	75 %	0 %	25 %	15618930
24465	NC_000922	ATT	2	6	1174510	1174515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618930
24466	NC_000922	GT	3	6	1174539	1174544	0 %	50 %	50 %	0 %	15618930
24467	NC_000922	CAT	2	6	1174548	1174553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618930
24468	NC_000922	GTT	2	6	1174560	1174565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618930
24469	NC_000922	GCTTCG	2	12	1174589	1174600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24470	NC_000922	CTT	2	6	1174753	1174758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618930
24471	NC_000922	T	6	6	1174774	1174779	0 %	100 %	0 %	0 %	15618930
24472	NC_000922	CAG	2	6	1174791	1174796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24473	NC_000922	TCT	2	6	1174887	1174892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618930
24474	NC_000922	TCT	2	6	1174913	1174918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618930
24475	NC_000922	TGC	2	6	1174940	1174945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24476	NC_000922	TTG	2	6	1174951	1174956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618930
24477	NC_000922	GTC	2	6	1175000	1175005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24478	NC_000922	GA	3	6	1175046	1175051	50 %	0 %	50 %	0 %	15618930
24479	NC_000922	GCTT	2	8	1175056	1175063	0 %	50 %	25 %	25 %	15618930
24480	NC_000922	TGT	2	6	1175066	1175071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618930
24481	NC_000922	TTCT	2	8	1175082	1175089	0 %	75 %	0 %	25 %	15618930
24482	NC_000922	CAG	2	6	1175196	1175201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24483	NC_000922	TGT	2	6	1175228	1175233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618930
24484	NC_000922	GA	3	6	1175270	1175275	50 %	0 %	50 %	0 %	15618930
24485	NC_000922	CTG	2	6	1175288	1175293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618930
24486	NC_000922	GAGG	2	8	1175301	1175308	25 %	0 %	75 %	0 %	15618930
24487	NC_000922	CAA	2	6	1175391	1175396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618930
24488	NC_000922	AGG	2	6	1175422	1175427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618930
24489	NC_000922	TGA	2	6	1175441	1175446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618930
24490	NC_000922	TTG	2	6	1175473	1175478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618930
24491	NC_000922	AGCTA	2	10	1175503	1175512	40 %	20 %	20 %	20 %	15618930
24492	NC_000922	AGA	2	6	1175527	1175532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618930
24493	NC_000922	CTTC	2	8	1175534	1175541	0 %	50 %	0 %	50 %	15618930
24494	NC_000922	TCT	2	6	1175618	1175623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618930
24495	NC_000922	A	8	8	1175696	1175703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24496	NC_000922	CAT	2	6	1175720	1175725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24497	NC_000922	A	6	6	1175801	1175806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24498	NC_000922	GGT	2	6	1175868	1175873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24499	NC_000922	GTA	2	6	1175989	1175994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24500	NC_000922	T	6	6	1176016	1176021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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