MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_000922	CTG	3	9	1035741	1035749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618812
21502	NC_000922	GGA	2	6	1035839	1035844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618812
21503	NC_000922	CTA	2	6	1035968	1035973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618812
21504	NC_000922	TACC	2	8	1036006	1036013	25 %	25 %	0 %	50 %	15618812
21505	NC_000922	GAG	2	6	1036055	1036060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618812
21506	NC_000922	CAT	2	6	1036140	1036145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618812
21507	NC_000922	TGC	2	6	1036156	1036161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618812
21508	NC_000922	ATT	2	6	1036184	1036189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618812
21509	NC_000922	CCTT	2	8	1036252	1036259	0 %	50 %	0 %	50 %	15618812
21510	NC_000922	T	7	7	1036258	1036264	0 %	100 %	0 %	0 %	15618812
21511	NC_000922	AGG	2	6	1036270	1036275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618812
21512	NC_000922	CT	3	6	1036279	1036284	0 %	50 %	0 %	50 %	15618812
21513	NC_000922	TG	3	6	1036296	1036301	0 %	50 %	50 %	0 %	15618812
21514	NC_000922	GTT	2	6	1036309	1036314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618812
21515	NC_000922	ATG	2	6	1036326	1036331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618812
21516	NC_000922	AGG	2	6	1036361	1036366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618812
21517	NC_000922	AGG	2	6	1036370	1036375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618812
21518	NC_000922	CT	3	6	1036390	1036395	0 %	50 %	0 %	50 %	15618812
21519	NC_000922	TAC	2	6	1036435	1036440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618813
21520	NC_000922	CTT	2	6	1036465	1036470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618813
21521	NC_000922	CT	3	6	1036637	1036642	0 %	50 %	0 %	50 %	15618813
21522	NC_000922	AGA	2	6	1036796	1036801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618813
21523	NC_000922	CTTC	2	8	1036805	1036812	0 %	50 %	0 %	50 %	15618813
21524	NC_000922	ATG	2	6	1036842	1036847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618813
21525	NC_000922	TGT	2	6	1036880	1036885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618813
21526	NC_000922	CAT	2	6	1036974	1036979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618813
21527	NC_000922	CTG	2	6	1037042	1037047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618813
21528	NC_000922	TG	3	6	1037046	1037051	0 %	50 %	50 %	0 %	15618813
21529	NC_000922	CTTG	2	8	1037081	1037088	0 %	50 %	25 %	25 %	15618813
21530	NC_000922	TCA	2	6	1037101	1037106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618813
21531	NC_000922	AGA	2	6	1037129	1037134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618813
21532	NC_000922	TAG	2	6	1037275	1037280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618813
21533	NC_000922	AAC	2	6	1037320	1037325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618813
21534	NC_000922	GCG	2	6	1037337	1037342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15618813
21535	NC_000922	CAA	2	6	1037359	1037364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618813
21536	NC_000922	CATT	2	8	1037377	1037384	25 %	50 %	0 %	25 %	15618813
21537	NC_000922	CTC	2	6	1037419	1037424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618814
21538	NC_000922	TATCGG	2	12	1037435	1037446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15618814
21539	NC_000922	TCC	2	6	1037580	1037585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618814
21540	NC_000922	ATG	2	6	1037596	1037601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618814
21541	NC_000922	CGT	2	6	1037603	1037608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618814
21542	NC_000922	ATC	2	6	1037666	1037671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618814
21543	NC_000922	TCT	2	6	1037675	1037680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618814
21544	NC_000922	AGAGC	2	10	1037685	1037694	40 %	0 %	40 %	20 %	15618814
21545	NC_000922	CCT	2	6	1037806	1037811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618814
21546	NC_000922	GGA	2	6	1037820	1037825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618814
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21548	NC_000922	AGT	2	6	1037927	1037932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618814
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21550	NC_000922	ACA	2	6	1038215	1038220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618814
21551	NC_000922	GCA	3	9	1038234	1038242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618814
21552	NC_000922	CAT	2	6	1038281	1038286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618814
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21554	NC_000922	AGAA	2	8	1038329	1038336	75 %	0 %	25 %	0 %	15618814
21555	NC_000922	A	6	6	1038335	1038340	100 %	0 %	0 %	0 %	15618814
21556	NC_000922	CTTT	2	8	1038353	1038360	0 %	75 %	0 %	25 %	15618814
21557	NC_000922	AGA	2	6	1038365	1038370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618814
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21559	NC_000922	TC	3	6	1038469	1038474	0 %	50 %	0 %	50 %	15618814
21560	NC_000922	AGA	2	6	1038479	1038484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618814
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21562	NC_000922	TGA	2	6	1038521	1038526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618814
21563	NC_000922	AG	3	6	1038567	1038572	50 %	0 %	50 %	0 %	15618814
21564	NC_000922	TCT	2	6	1038612	1038617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618814
21565	NC_000922	TTG	2	6	1038626	1038631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618814
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21567	NC_000922	A	6	6	1038756	1038761	100 %	0 %	0 %	0 %	15618814
21568	NC_000922	AT	3	6	1038839	1038844	50 %	50 %	0 %	0 %	15618814
21569	NC_000922	ATG	2	6	1038859	1038864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618814
21570	NC_000922	TCA	2	6	1038874	1038879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618814
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21572	NC_000922	TGTT	2	8	1038993	1039000	0 %	75 %	25 %	0 %	15618814
21573	NC_000922	T	6	6	1039047	1039052	0 %	100 %	0 %	0 %	15618814
21574	NC_000922	AGC	2	6	1039094	1039099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618814
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21577	NC_000922	GGA	2	6	1039361	1039366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618814
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21584	NC_000922	ATA	2	6	1039835	1039840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618814
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21586	NC_000922	TTA	2	6	1039859	1039864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_000922	TGG	2	6	1039916	1039921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618815
21588	NC_000922	TAC	2	6	1039923	1039928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618815
21589	NC_000922	ATG	2	6	1039939	1039944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618815
21590	NC_000922	CTT	3	9	1039953	1039961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618815
21591	NC_000922	TTC	2	6	1039963	1039968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618815
21592	NC_000922	TCG	2	6	1039982	1039987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618815
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21596	NC_000922	CTTT	2	8	1040127	1040134	0 %	75 %	0 %	25 %	15618815
21597	NC_000922	T	6	6	1040132	1040137	0 %	100 %	0 %	0 %	15618815
21598	NC_000922	CTT	2	6	1040192	1040197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618815
21599	NC_000922	AAT	2	6	1040200	1040205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618815
21600	NC_000922	CTG	2	6	1040220	1040225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618815
21601	NC_000922	AT	3	6	1040318	1040323	50 %	50 %	0 %	0 %	15618815
21602	NC_000922	AAATT	2	10	1040348	1040357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_000922	AGAA	2	8	1040365	1040372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21604	NC_000922	A	7	7	1040371	1040377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21605	NC_000922	GAA	2	6	1040404	1040409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21606	NC_000922	GATA	2	8	1040412	1040419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21607	NC_000922	GATTT	2	10	1040602	1040611	20 %	60 %	20 %	0 %	15618816
21608	NC_000922	ATG	2	6	1040616	1040621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618816
21609	NC_000922	TTC	2	6	1040622	1040627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618816
21610	NC_000922	CA	3	6	1040685	1040690	50 %	0 %	0 %	50 %	15618816
21611	NC_000922	GAGC	2	8	1040728	1040735	25 %	0 %	50 %	25 %	15618816
21612	NC_000922	TCC	2	6	1040740	1040745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618816
21613	NC_000922	TAAGAA	2	12	1040759	1040770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15618816
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21616	NC_000922	T	7	7	1040854	1040860	0 %	100 %	0 %	0 %	15618817
21617	NC_000922	AG	3	6	1040927	1040932	50 %	0 %	50 %	0 %	15618817
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21979	NC_000922	AGG	2	6	1056234	1056239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618833
21980	NC_000922	GTTT	2	8	1056247	1056254	0 %	75 %	25 %	0 %	15618833
21981	NC_000922	TTC	2	6	1056270	1056275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618833
21982	NC_000922	TTC	2	6	1056298	1056303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618833
21983	NC_000922	TGTCGC	2	12	1056383	1056394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618833
21984	NC_000922	GC	3	6	1056432	1056437	0 %	0 %	50 %	50 %	15618833
21985	NC_000922	AAT	2	6	1056442	1056447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618833
21986	NC_000922	AAG	2	6	1056483	1056488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618833
21987	NC_000922	TTG	2	6	1056521	1056526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618833
21988	NC_000922	AGAT	2	8	1056532	1056539	50 %	25 %	25 %	0 %	15618833
21989	NC_000922	A	6	6	1056608	1056613	100 %	0 %	0 %	0 %	15618833
21990	NC_000922	AGG	2	6	1056676	1056681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618833
21991	NC_000922	TCT	2	6	1056682	1056687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618833
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