MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_000922	CAAA	2	8	600296	600303	75 %	0 %	0 %	25 %	15618429
12502	NC_000922	TCT	2	6	600346	600351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618429
12503	NC_000922	TTA	2	6	600370	600375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618429
12504	NC_000922	AATTCG	2	12	600393	600404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15618429
12505	NC_000922	TGC	2	6	600424	600429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618429
12506	NC_000922	ATAA	2	8	600456	600463	75 %	25 %	0 %	0 %	15618429
12507	NC_000922	T	8	8	600566	600573	0 %	100 %	0 %	0 %	15618429
12508	NC_000922	TCT	2	6	600622	600627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618429
12509	NC_000922	TAAA	2	8	600705	600712	75 %	25 %	0 %	0 %	15618429
12510	NC_000922	AAG	2	6	600768	600773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618429
12511	NC_000922	TCA	2	6	600797	600802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618429
12512	NC_000922	AG	3	6	600832	600837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_000922	TCCA	2	8	601002	601009	25 %	25 %	0 %	50 %	15618430
12514	NC_000922	ACA	2	6	601022	601027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618430
12515	NC_000922	GA	3	6	601152	601157	50 %	0 %	50 %	0 %	15618430
12516	NC_000922	TGA	2	6	601163	601168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618430
12517	NC_000922	GAA	2	6	601173	601178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618430
12518	NC_000922	GAA	2	6	601218	601223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618430
12519	NC_000922	CA	3	6	601458	601463	50 %	0 %	0 %	50 %	15618430
12520	NC_000922	AAT	2	6	601492	601497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618430
12521	NC_000922	AAG	2	6	601515	601520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618430
12522	NC_000922	A	6	6	601535	601540	100 %	0 %	0 %	0 %	15618430
12523	NC_000922	AAG	2	6	601603	601608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618430
12524	NC_000922	TC	4	8	601807	601814	0 %	50 %	0 %	50 %	15618431
12525	NC_000922	TGA	2	6	601869	601874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618431
12526	NC_000922	GAG	2	6	601891	601896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618431
12527	NC_000922	AGT	2	6	601970	601975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618431
12528	NC_000922	GC	3	6	602156	602161	0 %	0 %	50 %	50 %	15618431
12529	NC_000922	TC	3	6	602228	602233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_000922	CTAA	2	8	602234	602241	50 %	25 %	0 %	25 %	15618432
12531	NC_000922	GCA	2	6	602282	602287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618432
12532	NC_000922	AAT	2	6	602406	602411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618432
12533	NC_000922	CTT	2	6	602420	602425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618432
12534	NC_000922	ATACCC	2	12	602437	602448	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15618432
12535	NC_000922	ATCA	2	8	602598	602605	50 %	25 %	0 %	25 %	15618432
12536	NC_000922	CAT	2	6	602607	602612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12537	NC_000922	TCC	2	6	602625	602630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618432
12538	NC_000922	TC	3	6	602661	602666	0 %	50 %	0 %	50 %	15618432
12539	NC_000922	CGA	2	6	602674	602679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618432
12540	NC_000922	ATT	2	6	602682	602687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618432
12541	NC_000922	TGA	2	6	602695	602700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618432
12542	NC_000922	AG	4	8	602721	602728	50 %	0 %	50 %	0 %	15618432
12543	NC_000922	CTTC	2	8	602729	602736	0 %	50 %	0 %	50 %	15618432
12544	NC_000922	AGC	2	6	602751	602756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618432
12545	NC_000922	CAT	2	6	602781	602786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12546	NC_000922	GTT	3	9	602872	602880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618432
12547	NC_000922	TCA	2	6	602914	602919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12548	NC_000922	GAA	2	6	603034	603039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618432
12549	NC_000922	CAT	2	6	603125	603130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12550	NC_000922	ACGT	2	8	603168	603175	25 %	25 %	25 %	25 %	15618432
12551	NC_000922	AAG	2	6	603227	603232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618432
12552	NC_000922	TTC	3	9	603258	603266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618432
12553	NC_000922	GCA	2	6	603397	603402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618432
12554	NC_000922	AC	3	6	603424	603429	50 %	0 %	0 %	50 %	15618432
12555	NC_000922	CTTC	2	8	603484	603491	0 %	50 %	0 %	50 %	15618432
12556	NC_000922	GAA	2	6	603541	603546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618432
12557	NC_000922	ATC	2	6	603562	603567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12558	NC_000922	TCA	2	6	603595	603600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618432
12559	NC_000922	TC	3	6	603606	603611	0 %	50 %	0 %	50 %	15618432
12560	NC_000922	GGAA	2	8	603618	603625	50 %	0 %	50 %	0 %	15618432
12561	NC_000922	GCT	2	6	603649	603654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618432
12562	NC_000922	CAA	2	6	603717	603722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618432
12563	NC_000922	ACC	2	6	603727	603732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618432
12564	NC_000922	ACC	2	6	603736	603741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618432
12565	NC_000922	AG	3	6	603823	603828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_000922	A	6	6	603844	603849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_000922	AGCCT	2	10	603852	603861	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12568	NC_000922	TCAA	2	8	603877	603884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12569	NC_000922	AAG	2	6	603894	603899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_000922	GAAAAA	2	12	603908	603919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_000922	AT	3	6	603929	603934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_000922	CCTT	2	8	603963	603970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_000922	A	6	6	604012	604017	100 %	0 %	0 %	0 %	15618433
12574	NC_000922	ATT	2	6	604039	604044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618433
12575	NC_000922	CT	3	6	604057	604062	0 %	50 %	0 %	50 %	15618433
12576	NC_000922	TTCC	2	8	604107	604114	0 %	50 %	0 %	50 %	15618433
12577	NC_000922	CTTCT	2	10	604177	604186	0 %	60 %	0 %	40 %	15618433
12578	NC_000922	ACCT	2	8	604212	604219	25 %	25 %	0 %	50 %	15618433
12579	NC_000922	CCA	2	6	604234	604239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618433
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12581	NC_000922	TC	3	6	604250	604255	0 %	50 %	0 %	50 %	15618433
12582	NC_000922	GTA	2	6	604278	604283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618433
12583	NC_000922	CTC	2	6	604361	604366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618433
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12585	NC_000922	A	8	8	604455	604462	100 %	0 %	0 %	0 %	15618433
12586	NC_000922	A	7	7	604479	604485	100 %	0 %	0 %	0 %	15618433
12587	NC_000922	A	6	6	604546	604551	100 %	0 %	0 %	0 %	15618433
12588	NC_000922	AAGG	2	8	604564	604571	50 %	0 %	50 %	0 %	15618433
12589	NC_000922	A	6	6	604660	604665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_000922	ACT	2	6	604672	604677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_000922	A	7	7	604698	604704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_000922	CTT	2	6	604727	604732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618434
12593	NC_000922	CT	3	6	604764	604769	0 %	50 %	0 %	50 %	15618434
12594	NC_000922	ACC	2	6	604861	604866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618434
12595	NC_000922	ACGC	2	8	604961	604968	25 %	0 %	25 %	50 %	15618434
12596	NC_000922	GTC	2	6	604990	604995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618434
12597	NC_000922	A	8	8	605091	605098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_000922	A	6	6	605181	605186	100 %	0 %	0 %	0 %	15618435
12599	NC_000922	CTT	2	6	605227	605232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618435
12600	NC_000922	TGG	2	6	605248	605253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618435
12601	NC_000922	CTT	2	6	605336	605341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618435
12602	NC_000922	ACC	2	6	605347	605352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618435
12603	NC_000922	TCT	2	6	605370	605375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618435
12604	NC_000922	A	7	7	605431	605437	100 %	0 %	0 %	0 %	15618435
12605	NC_000922	AAT	2	6	605472	605477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618435
12606	NC_000922	A	7	7	605566	605572	100 %	0 %	0 %	0 %	15618435
12607	NC_000922	ATC	2	6	605586	605591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618435
12608	NC_000922	ACA	2	6	605623	605628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618435
12609	NC_000922	CT	3	6	605640	605645	0 %	50 %	0 %	50 %	15618435
12610	NC_000922	GCAA	2	8	605692	605699	50 %	0 %	25 %	25 %	15618435
12611	NC_000922	AGT	2	6	605753	605758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618435
12612	NC_000922	AGAAA	2	10	605813	605822	80 %	0 %	20 %	0 %	15618435
12613	NC_000922	TTC	2	6	605827	605832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618435
12614	NC_000922	AGC	2	6	605933	605938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618435
12615	NC_000922	GCA	2	6	605952	605957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618435
12616	NC_000922	CT	3	6	605971	605976	0 %	50 %	0 %	50 %	15618435
12617	NC_000922	AGA	2	6	606002	606007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618435
12618	NC_000922	TTC	2	6	606010	606015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618435
12619	NC_000922	AAG	2	6	606019	606024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618435
12620	NC_000922	GAG	2	6	606174	606179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618435
12621	NC_000922	CAA	2	6	606198	606203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_000922	TATTTT	2	12	606249	606260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_000922	T	6	6	606257	606262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_000922	A	7	7	606397	606403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_000922	TTC	2	6	606444	606449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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