MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_000922	T	6	6	550950	550955	0 %	100 %	0 %	0 %	15618385
11503	NC_000922	CCA	2	6	551272	551277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618385
11504	NC_000922	AAG	2	6	551304	551309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618385
11505	NC_000922	ACA	4	12	551350	551361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618385
11506	NC_000922	AAC	2	6	551379	551384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618385
11507	NC_000922	GA	3	6	551479	551484	50 %	0 %	50 %	0 %	15618385
11508	NC_000922	AAG	2	6	551499	551504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618385
11509	NC_000922	AGACAA	2	12	551526	551537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15618385
11510	NC_000922	TAA	2	6	551585	551590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_000922	ATT	2	6	551612	551617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_000922	CAA	2	6	551652	551657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_000922	A	6	6	551686	551691	100 %	0 %	0 %	0 %	15618386
11514	NC_000922	AGG	2	6	551718	551723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618386
11515	NC_000922	TCCCT	2	10	551784	551793	0 %	40 %	0 %	60 %	15618386
11516	NC_000922	TCA	3	9	551809	551817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618386
11517	NC_000922	AGGA	2	8	551867	551874	50 %	0 %	50 %	0 %	15618386
11518	NC_000922	ATG	2	6	551892	551897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618386
11519	NC_000922	GAA	2	6	551914	551919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618386
11520	NC_000922	TGC	2	6	551924	551929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618386
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11522	NC_000922	TGA	2	6	552085	552090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618386
11523	NC_000922	CCCA	2	8	552150	552157	25 %	0 %	0 %	75 %	15618386
11524	NC_000922	ACC	2	6	552274	552279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618386
11525	NC_000922	GA	3	6	552289	552294	50 %	0 %	50 %	0 %	15618386
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11527	NC_000922	GAC	2	6	552722	552727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618386
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11529	NC_000922	ATA	2	6	552862	552867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618386
11530	NC_000922	ATA	2	6	552942	552947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618386
11531	NC_000922	ATTC	2	8	552971	552978	25 %	50 %	0 %	25 %	15618386
11532	NC_000922	GAA	2	6	552998	553003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618386
11533	NC_000922	TAGC	2	8	553036	553043	25 %	25 %	25 %	25 %	15618386
11534	NC_000922	CCT	2	6	553082	553087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618386
11535	NC_000922	TCCA	2	8	553156	553163	25 %	25 %	0 %	50 %	15618386
11536	NC_000922	GAT	2	6	553166	553171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618386
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11538	NC_000922	CT	3	6	553412	553417	0 %	50 %	0 %	50 %	15618386
11539	NC_000922	A	6	6	553525	553530	100 %	0 %	0 %	0 %	15618386
11540	NC_000922	AGG	2	6	553551	553556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618386
11541	NC_000922	TGA	2	6	553591	553596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618386
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11543	NC_000922	GTG	2	6	553671	553676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618386
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11545	NC_000922	GTC	2	6	553790	553795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618386
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11547	NC_000922	CTAT	2	8	553851	553858	25 %	50 %	0 %	25 %	15618387
11548	NC_000922	AAAG	2	8	553916	553923	75 %	0 %	25 %	0 %	15618387
11549	NC_000922	AG	3	6	553936	553941	50 %	0 %	50 %	0 %	15618387
11550	NC_000922	GC	3	6	553966	553971	0 %	0 %	50 %	50 %	15618387
11551	NC_000922	GAA	2	6	553982	553987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618387
11552	NC_000922	AGG	2	6	554122	554127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618387
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11554	NC_000922	CTA	2	6	554145	554150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618387
11555	NC_000922	GA	3	6	554201	554206	50 %	0 %	50 %	0 %	15618387
11556	NC_000922	C	6	6	554222	554227	0 %	0 %	0 %	100 %	15618387
11557	NC_000922	GGA	2	6	554247	554252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618387
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11559	NC_000922	GAA	2	6	554283	554288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618387
11560	NC_000922	CGT	2	6	554398	554403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618387
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11562	NC_000922	GAA	2	6	554460	554465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618387
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11565	NC_000922	ATA	2	6	554605	554610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618387
11566	NC_000922	C	6	6	554638	554643	0 %	0 %	0 %	100 %	15618387
11567	NC_000922	GAA	2	6	554726	554731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618387
11568	NC_000922	TATC	2	8	554835	554842	25 %	50 %	0 %	25 %	15618387
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11572	NC_000922	CAA	2	6	554990	554995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618388
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11574	NC_000922	TCA	2	6	555023	555028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618388
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11580	NC_000922	GTA	2	6	555247	555252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618388
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11589	NC_000922	TAA	2	6	555689	555694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618388
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11591	NC_000922	T	6	6	555761	555766	0 %	100 %	0 %	0 %	15618388
11592	NC_000922	A	6	6	555825	555830	100 %	0 %	0 %	0 %	15618388
11593	NC_000922	AAC	2	6	555851	555856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618388
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11596	NC_000922	GAC	2	6	555911	555916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618388
11597	NC_000922	CAG	2	6	555926	555931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618388
11598	NC_000922	AGA	2	6	556194	556199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_000922	CAA	2	6	556329	556334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618389
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11601	NC_000922	TCT	2	6	556343	556348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618389
11602	NC_000922	AAG	2	6	556471	556476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618389
11603	NC_000922	TCCCC	2	10	556485	556494	0 %	20 %	0 %	80 %	15618389
11604	NC_000922	GA	3	6	556524	556529	50 %	0 %	50 %	0 %	15618389
11605	NC_000922	GTC	2	6	556637	556642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618389
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11607	NC_000922	ACA	2	6	556679	556684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618389
11608	NC_000922	AGA	2	6	556688	556693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618389
11609	NC_000922	GCT	2	6	556709	556714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618389
11610	NC_000922	TGC	2	6	556732	556737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618389
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11612	NC_000922	CCT	2	6	556799	556804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618389
11613	NC_000922	CAG	2	6	556869	556874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618389
11614	NC_000922	CAAAG	2	10	556924	556933	60 %	0 %	20 %	20 %	15618389
11615	NC_000922	TCG	2	6	556945	556950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618389
11616	NC_000922	TTTAC	2	10	556955	556964	20 %	60 %	0 %	20 %	15618389
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11618	NC_000922	CAAGGC	2	12	557247	557258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618389
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11623	NC_000922	CAT	2	6	557639	557644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618390
11624	NC_000922	TAA	2	6	557705	557710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618390
11625	NC_000922	CTT	2	6	557750	557755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618390
11626	NC_000922	CAT	2	6	557864	557869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618390
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11634	NC_000922	TACCA	2	10	558420	558429	40 %	20 %	0 %	40 %	15618390
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11636	NC_000922	AAT	2	6	558460	558465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11637	NC_000922	AGTC	2	8	558467	558474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11639	NC_000922	TATC	2	8	558559	558566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11640	NC_000922	GAC	2	6	558757	558762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618391
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11642	NC_000922	CCA	2	6	558966	558971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618391
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11648	NC_000922	TGC	2	6	559483	559488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618392
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11654	NC_000922	GA	4	8	559971	559978	50 %	0 %	50 %	0 %	15618392
11655	NC_000922	ATCG	2	8	560011	560018	25 %	25 %	25 %	25 %	15618392
11656	NC_000922	CTTT	2	8	560032	560039	0 %	75 %	0 %	25 %	15618392
11657	NC_000922	CT	3	6	560045	560050	0 %	50 %	0 %	50 %	15618392
11658	NC_000922	A	6	6	560074	560079	100 %	0 %	0 %	0 %	15618392
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11662	NC_000922	AGA	2	6	560150	560155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618392
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11686	NC_000922	A	7	7	561711	561717	100 %	0 %	0 %	0 %	15618393
11687	NC_000922	A	7	7	561788	561794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11688	NC_000922	AAT	2	6	561829	561834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11689	NC_000922	A	6	6	561842	561847	100 %	0 %	0 %	0 %	15618394
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11732	NC_000922	CAT	2	6	563578	563583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618394
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11744	NC_000922	T	6	6	564367	564372	0 %	100 %	0 %	0 %	15618394
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11746	NC_000922	A	7	7	564411	564417	100 %	0 %	0 %	0 %	15618394
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12000	NC_000922	TGG	2	6	576562	576567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618406

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