MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000922	CTT	2	6	23334	23339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_000922	ACG	2	6	23361	23366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_000922	AGG	2	6	23400	23405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_000922	TGC	2	6	23439	23444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_000922	ACT	2	6	23474	23479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_000922	GGA	2	6	23509	23514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_000922	CT	3	6	23516	23521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_000922	TC	3	6	23546	23551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_000922	ACA	2	6	23665	23670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_000922	GTA	2	6	23966	23971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_000922	ACA	2	6	23986	23991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_000922	TCGATT	2	12	24249	24260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_000922	T	7	7	24294	24300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_000922	A	7	7	24319	24325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000922	TTA	2	6	24437	24442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_000922	CT	3	6	24465	24470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_000922	TGC	2	6	24490	24495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_000922	CAC	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_000922	AAAC	2	8	24632	24639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_000922	GTT	2	6	24654	24659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_000922	CTT	2	6	24685	24690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_000922	ATT	2	6	24722	24727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_000922	GTT	3	9	24746	24754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_000922	CAG	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_000922	TCG	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_000922	CAA	2	6	24998	25003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_000922	ACA	2	6	25071	25076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_000922	ACA	2	6	25082	25087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_000922	AGG	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_000922	CTG	2	6	25104	25109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_000922	ATTG	2	8	25184	25191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_000922	CAG	2	6	25266	25271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_000922	A	6	6	25298	25303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_000922	GAG	3	9	25323	25331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_000922	AAC	2	6	25343	25348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_000922	AGG	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_000922	GA	3	6	25401	25406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_000922	TAC	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_000922	CT	3	6	25598	25603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_000922	GA	3	6	25662	25667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_000922	AGA	2	6	25675	25680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_000922	TGC	2	6	25735	25740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_000922	ATGG	2	8	25817	25824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_000922	ACT	2	6	25829	25834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_000922	GCA	2	6	25928	25933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_000922	TAT	2	6	25988	25993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_000922	CAT	2	6	25997	26002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_000922	CAG	2	6	26015	26020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_000922	ACT	2	6	26060	26065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_000922	TAC	2	6	26095	26100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_000922	AAT	2	6	26129	26134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000922	CGA	2	6	26144	26149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_000922	CAAAAA	2	12	26158	26169	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
554	NC_000922	CAA	2	6	26317	26322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_000922	AGG	3	9	26414	26422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_000922	TTC	2	6	26424	26429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_000922	ATG	2	6	26698	26703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_000922	GGA	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_000922	GAT	2	6	26795	26800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_000922	TC	3	6	26930	26935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_000922	CTT	2	6	27045	27050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_000922	ATC	2	6	27064	27069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_000922	TCAG	2	8	27097	27104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_000922	TTC	2	6	27125	27130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_000922	GCTAT	2	10	27136	27145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_000922	GGA	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_000922	CT	3	6	27241	27246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_000922	TATTT	2	10	27262	27271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_000922	GTT	2	6	27289	27294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_000922	TGT	2	6	27328	27333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_000922	T	6	6	27369	27374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_000922	GAA	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_000922	TCTAG	2	10	27429	27438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
574	NC_000922	T	6	6	27445	27450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_000922	AATAT	2	10	27514	27523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_000922	TGT	2	6	27541	27546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_000922	CCACT	2	10	27595	27604	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
578	NC_000922	TGC	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_000922	CTAC	2	8	27682	27689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_000922	TC	3	6	27690	27695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_000922	TA	3	6	27711	27716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_000922	GGT	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_000922	CTG	2	6	27763	27768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_000922	TAC	2	6	27923	27928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_000922	TGG	2	6	28016	28021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_000922	A	6	6	28095	28100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_000922	AGG	2	6	28187	28192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_000922	TGC	2	6	28271	28276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_000922	CTT	2	6	28327	28332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_000922	TGG	2	6	28364	28369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_000922	AGG	2	6	28448	28453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_000922	TC	3	6	28470	28475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_000922	CT	3	6	28501	28506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_000922	TAA	2	6	28511	28516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_000922	AGG	2	6	28541	28546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_000922	AGG	2	6	28565	28570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_000922	AGG	2	6	28592	28597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_000922	ACA	2	6	28629	28634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_000922	TGC	2	6	28700	28705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_000922	CTAT	2	8	28720	28727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_000922	ACC	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_000922	GA	4	8	28831	28838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_000922	CAG	2	6	28846	28851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_000922	TAG	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_000922	CA	3	6	28943	28948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_000922	CTT	2	6	28977	28982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_000922	AGA	2	6	29015	29020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_000922	TCA	2	6	29026	29031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_000922	CAG	2	6	29092	29097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_000922	GGGA	2	8	29219	29226	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_000922	TTG	2	6	29434	29439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_000922	TAG	2	6	29471	29476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_000922	GTA	2	6	29667	29672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_000922	CTC	2	6	29762	29767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_000922	GTC	2	6	29787	29792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_000922	AAT	2	6	29826	29831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_000922	ATG	2	6	29884	29889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_000922	TAC	3	9	29919	29927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_000922	T	6	6	29939	29944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_000922	TAC	2	6	29952	29957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_000922	AGG	2	6	30014	30019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_000922	GA	3	6	30084	30089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_000922	TC	3	6	30215	30220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_000922	AG	3	6	30385	30390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_000922	TTG	2	6	30424	30429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_000922	TC	3	6	30436	30441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_000922	T	7	7	30481	30487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_000922	AGA	2	6	30492	30497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_000922	AGG	2	6	30569	30574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_000922	T	6	6	30612	30617	0 %	100 %	0 %	0 %	15617944
631	NC_000922	AAG	3	9	30634	30642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617944
632	NC_000922	ATC	2	6	30718	30723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617944
633	NC_000922	GCCA	2	8	30758	30765	25 %	0 %	25 %	50 %	15617944
634	NC_000922	AAT	2	6	30811	30816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617944
635	NC_000922	AG	4	8	30843	30850	50 %	0 %	50 %	0 %	15617944
636	NC_000922	TTTC	2	8	31053	31060	0 %	75 %	0 %	25 %	15617944
637	NC_000922	AACG	2	8	31299	31306	50 %	0 %	25 %	25 %	15617944
638	NC_000922	ATA	2	6	31312	31317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617944
639	NC_000922	GAG	2	6	31396	31401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
640	NC_000922	GGA	2	6	31446	31451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
641	NC_000922	GC	3	6	31494	31499	0 %	0 %	50 %	50 %	15617944
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