MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000922	GTCT	2	8	261774	261781	0 %	50 %	25 %	25 %	15618145
5502	NC_000922	GAG	2	6	261786	261791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618145
5503	NC_000922	TTA	2	6	261967	261972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618145
5504	NC_000922	TCT	2	6	262013	262018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618145
5505	NC_000922	CTG	2	6	262036	262041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618145
5506	NC_000922	TTAG	2	8	262064	262071	25 %	50 %	25 %	0 %	15618145
5507	NC_000922	A	6	6	262091	262096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_000922	TTC	2	6	262162	262167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_000922	ATGA	2	8	262234	262241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_000922	CT	3	6	262271	262276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_000922	AAG	2	6	262283	262288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_000922	CA	3	6	262327	262332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_000922	TC	4	8	262404	262411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_000922	CTT	2	6	262640	262645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618146
5515	NC_000922	ATG	2	6	262679	262684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618146
5516	NC_000922	AAGA	2	8	262749	262756	75 %	0 %	25 %	0 %	15618146
5517	NC_000922	ATC	2	6	262826	262831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618146
5518	NC_000922	T	7	7	262854	262860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_000922	TTA	2	6	262910	262915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_000922	AGT	2	6	262974	262979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618147
5521	NC_000922	CAA	2	6	262999	263004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618147
5522	NC_000922	A	6	6	263003	263008	100 %	0 %	0 %	0 %	15618147
5523	NC_000922	CCT	2	6	263092	263097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618147
5524	NC_000922	TTC	2	6	263116	263121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618147
5525	NC_000922	CT	3	6	263123	263128	0 %	50 %	0 %	50 %	15618147
5526	NC_000922	CT	3	6	263175	263180	0 %	50 %	0 %	50 %	15618147
5527	NC_000922	CTTAGG	2	12	263246	263257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15618147
5528	NC_000922	ATT	2	6	263280	263285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618147
5529	NC_000922	AAC	2	6	263335	263340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618147
5530	NC_000922	A	8	8	263420	263427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_000922	TAT	2	6	263449	263454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618148
5532	NC_000922	T	7	7	263454	263460	0 %	100 %	0 %	0 %	15618148
5533	NC_000922	GAC	2	6	263619	263624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618148
5534	NC_000922	A	6	6	263660	263665	100 %	0 %	0 %	0 %	15618148
5535	NC_000922	AC	3	6	263677	263682	50 %	0 %	0 %	50 %	15618148
5536	NC_000922	ACC	2	6	263747	263752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_000922	TTA	2	6	263755	263760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_000922	ACA	2	6	263900	263905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618149
5539	NC_000922	GTTT	2	8	263982	263989	0 %	75 %	25 %	0 %	15618149
5540	NC_000922	TGC	2	6	264052	264057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618149
5541	NC_000922	TTA	2	6	264131	264136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618149
5542	NC_000922	AAG	2	6	264327	264332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618149
5543	NC_000922	AGC	2	6	264340	264345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618149
5544	NC_000922	TTC	2	6	264346	264351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618149
5545	NC_000922	CGA	2	6	264416	264421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618149
5546	NC_000922	A	7	7	264431	264437	100 %	0 %	0 %	0 %	15618149
5547	NC_000922	GGA	2	6	264445	264450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618149
5548	NC_000922	AAG	2	6	264498	264503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618149
5549	NC_000922	AGA	2	6	264520	264525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618149
5550	NC_000922	AAAG	2	8	264534	264541	75 %	0 %	25 %	0 %	15618149
5551	NC_000922	TGC	2	6	264736	264741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618150
5552	NC_000922	TAT	2	6	264916	264921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618150
5553	NC_000922	AG	3	6	264939	264944	50 %	0 %	50 %	0 %	15618150
5554	NC_000922	T	7	7	265018	265024	0 %	100 %	0 %	0 %	15618151
5555	NC_000922	CAA	2	6	265059	265064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618151
5556	NC_000922	AAAG	2	8	265095	265102	75 %	0 %	25 %	0 %	15618151
5557	NC_000922	TTG	2	6	265107	265112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618151
5558	NC_000922	TAGA	2	8	265175	265182	50 %	25 %	25 %	0 %	15618151
5559	NC_000922	AGGA	2	8	265207	265214	50 %	0 %	50 %	0 %	15618151
5560	NC_000922	TTGA	2	8	265223	265230	25 %	50 %	25 %	0 %	15618151
5561	NC_000922	AGTG	2	8	265267	265274	25 %	25 %	50 %	0 %	15618151
5562	NC_000922	ACAG	2	8	265278	265285	50 %	0 %	25 %	25 %	15618151
5563	NC_000922	TAG	2	6	265295	265300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618151
5564	NC_000922	A	6	6	265338	265343	100 %	0 %	0 %	0 %	15618151
5565	NC_000922	ATC	2	6	265412	265417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618151
5566	NC_000922	AGT	2	6	265498	265503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618152
5567	NC_000922	TCC	2	6	265535	265540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618152
5568	NC_000922	ATT	2	6	265562	265567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618152
5569	NC_000922	CTT	2	6	265568	265573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618152
5570	NC_000922	ATTT	2	8	265643	265650	25 %	75 %	0 %	0 %	15618152
5571	NC_000922	TGA	2	6	265776	265781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618152
5572	NC_000922	TC	3	6	265855	265860	0 %	50 %	0 %	50 %	15618152
5573	NC_000922	CTT	2	6	265877	265882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618152
5574	NC_000922	AGT	2	6	265901	265906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618152
5575	NC_000922	AAG	2	6	265927	265932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618152
5576	NC_000922	CTC	2	6	265934	265939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618152
5577	NC_000922	T	6	6	266036	266041	0 %	100 %	0 %	0 %	15618152
5578	NC_000922	A	6	6	266069	266074	100 %	0 %	0 %	0 %	15618152
5579	NC_000922	A	6	6	266152	266157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_000922	T	6	6	266180	266185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_000922	TTTAAG	2	12	266211	266222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_000922	TTA	2	6	266295	266300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_000922	A	6	6	266304	266309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_000922	T	6	6	266375	266380	0 %	100 %	0 %	0 %	15618153
5585	NC_000922	TCC	2	6	266392	266397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618153
5586	NC_000922	CTT	2	6	266415	266420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618153
5587	NC_000922	TCT	2	6	266464	266469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618153
5588	NC_000922	GTT	2	6	266485	266490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618153
5589	NC_000922	TTCTC	2	10	266528	266537	0 %	60 %	0 %	40 %	15618153
5590	NC_000922	CTA	2	6	266599	266604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618153
5591	NC_000922	GT	3	6	266649	266654	0 %	50 %	50 %	0 %	15618153
5592	NC_000922	AGG	2	6	266729	266734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618153
5593	NC_000922	AGTC	2	8	266820	266827	25 %	25 %	25 %	25 %	15618153
5594	NC_000922	CTT	2	6	266834	266839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618153
5595	NC_000922	CT	3	6	266870	266875	0 %	50 %	0 %	50 %	15618153
5596	NC_000922	TC	4	8	266885	266892	0 %	50 %	0 %	50 %	15618153
5597	NC_000922	CA	3	6	266916	266921	50 %	0 %	0 %	50 %	15618153
5598	NC_000922	ATT	2	6	266967	266972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618153
5599	NC_000922	ATC	2	6	266988	266993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618153
5600	NC_000922	AC	3	6	267167	267172	50 %	0 %	0 %	50 %	15618153
5601	NC_000922	GAA	2	6	267183	267188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618153
5602	NC_000922	AT	3	6	267340	267345	50 %	50 %	0 %	0 %	15618153
5603	NC_000922	GTT	2	6	267346	267351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618153
5604	NC_000922	TAT	2	6	267356	267361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618153
5605	NC_000922	TCT	2	6	267421	267426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618153
5606	NC_000922	TC	3	6	267442	267447	0 %	50 %	0 %	50 %	15618153
5607	NC_000922	ATC	2	6	267492	267497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618153
5608	NC_000922	ATT	2	6	267516	267521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618153
5609	NC_000922	CTAT	2	8	267522	267529	25 %	50 %	0 %	25 %	15618153
5610	NC_000922	GAA	2	6	267541	267546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618153
5611	NC_000922	T	6	6	267616	267621	0 %	100 %	0 %	0 %	15618154
5612	NC_000922	CTT	2	6	267623	267628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618154
5613	NC_000922	TCA	2	6	267718	267723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618154
5614	NC_000922	T	6	6	267748	267753	0 %	100 %	0 %	0 %	15618154
5615	NC_000922	AGA	2	6	267786	267791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618154
5616	NC_000922	AG	3	6	267836	267841	50 %	0 %	50 %	0 %	15618154
5617	NC_000922	TTA	2	6	267853	267858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618154
5618	NC_000922	TTTTC	2	10	267863	267872	0 %	80 %	0 %	20 %	15618154
5619	NC_000922	TGG	2	6	267946	267951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618154
5620	NC_000922	AAG	2	6	267981	267986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618154
5621	NC_000922	GAA	2	6	268019	268024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618154
5622	NC_000922	CAT	2	6	268028	268033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618154
5623	NC_000922	AAAAC	2	10	268081	268090	80 %	0 %	0 %	20 %	15618154
5624	NC_000922	TGC	3	9	268113	268121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618154
5625	NC_000922	TCC	2	6	268186	268191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618154
5626	NC_000922	AGTA	2	8	268194	268201	50 %	25 %	25 %	0 %	15618154
5627	NC_000922	AGA	2	6	268218	268223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618154
5628	NC_000922	GTG	2	6	268228	268233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618154
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5989	NC_000922	TTA	2	6	284679	284684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618173
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5991	NC_000922	AATAAG	2	12	284729	284740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15618173
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5999	NC_000922	TTC	2	6	285167	285172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618173
6000	NC_000922	ATG	2	6	285176	285181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618173

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