MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000922	GATTG	2	10	239946	239955	20 %	40 %	40 %	0 %	15618122
5002	NC_000922	TC	3	6	239999	240004	0 %	50 %	0 %	50 %	15618122
5003	NC_000922	CAC	2	6	240038	240043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618122
5004	NC_000922	CTT	2	6	240045	240050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
5005	NC_000922	ATCT	2	8	240125	240132	25 %	50 %	0 %	25 %	15618122
5006	NC_000922	AAG	2	6	240154	240159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
5007	NC_000922	AGA	2	6	240218	240223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
5008	NC_000922	ACAA	2	8	240227	240234	75 %	0 %	0 %	25 %	15618122
5009	NC_000922	AAG	2	6	240253	240258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
5010	NC_000922	TCC	2	6	240327	240332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618122
5011	NC_000922	AAAATC	2	12	240381	240392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15618122
5012	NC_000922	CGT	2	6	240426	240431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618122
5013	NC_000922	TTC	2	6	240441	240446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
5014	NC_000922	AGG	2	6	240455	240460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618122
5015	NC_000922	CTAT	2	8	240495	240502	25 %	50 %	0 %	25 %	15618122
5016	NC_000922	CA	3	6	240524	240529	50 %	0 %	0 %	50 %	15618122
5017	NC_000922	ATA	2	6	240615	240620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618122
5018	NC_000922	GAA	3	9	240621	240629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
5019	NC_000922	AT	3	6	240659	240664	50 %	50 %	0 %	0 %	15618122
5020	NC_000922	TCT	2	6	240704	240709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
5021	NC_000922	CA	3	6	240714	240719	50 %	0 %	0 %	50 %	15618122
5022	NC_000922	TTTAA	2	10	240808	240817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_000922	ACT	2	6	240862	240867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_000922	A	7	7	240892	240898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_000922	CTTC	2	8	240925	240932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_000922	T	6	6	240941	240946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_000922	TC	3	6	241036	241041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_000922	CATA	2	8	241049	241056	50 %	25 %	0 %	25 %	15618123
5029	NC_000922	A	6	6	241056	241061	100 %	0 %	0 %	0 %	15618123
5030	NC_000922	CT	3	6	241220	241225	0 %	50 %	0 %	50 %	15618123
5031	NC_000922	CAA	2	6	241228	241233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618123
5032	NC_000922	AC	3	6	241235	241240	50 %	0 %	0 %	50 %	15618123
5033	NC_000922	CTCCA	2	10	241246	241255	20 %	20 %	0 %	60 %	15618123
5034	NC_000922	CAT	2	6	241311	241316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
5035	NC_000922	TC	3	6	241365	241370	0 %	50 %	0 %	50 %	15618123
5036	NC_000922	AGG	2	6	241374	241379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618123
5037	NC_000922	G	6	6	241378	241383	0 %	0 %	100 %	0 %	15618123
5038	NC_000922	AGC	2	6	241401	241406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618123
5039	NC_000922	A	9	9	241410	241418	100 %	0 %	0 %	0 %	15618123
5040	NC_000922	CTT	2	6	241522	241527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618123
5041	NC_000922	ATACT	2	10	241556	241565	40 %	40 %	0 %	20 %	15618123
5042	NC_000922	TCA	2	6	241601	241606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
5043	NC_000922	GCA	2	6	241633	241638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618123
5044	NC_000922	CTA	2	6	241657	241662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
5045	NC_000922	ACT	2	6	241756	241761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
5046	NC_000922	TCT	2	6	241796	241801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618123
5047	NC_000922	GTA	2	6	241832	241837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618123
5048	NC_000922	AAC	2	6	241841	241846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618123
5049	NC_000922	TTAT	2	8	241891	241898	25 %	75 %	0 %	0 %	15618123
5050	NC_000922	CT	3	6	241900	241905	0 %	50 %	0 %	50 %	15618123
5051	NC_000922	GGAAA	2	10	241963	241972	60 %	0 %	40 %	0 %	15618123
5052	NC_000922	A	9	9	241970	241978	100 %	0 %	0 %	0 %	15618123
5053	NC_000922	A	7	7	241997	242003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_000922	CCT	2	6	242124	242129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618124
5055	NC_000922	TC	3	6	242183	242188	0 %	50 %	0 %	50 %	15618124
5056	NC_000922	CGA	2	6	242279	242284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618124
5057	NC_000922	TG	5	10	242301	242310	0 %	50 %	50 %	0 %	15618124
5058	NC_000922	A	7	7	242347	242353	100 %	0 %	0 %	0 %	15618124
5059	NC_000922	ATG	2	6	242365	242370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618124
5060	NC_000922	CAT	2	6	242409	242414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618124
5061	NC_000922	TTC	2	6	242417	242422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618124
5062	NC_000922	GGAT	2	8	242479	242486	25 %	25 %	50 %	0 %	15618124
5063	NC_000922	CATG	2	8	242559	242566	25 %	25 %	25 %	25 %	15618124
5064	NC_000922	TCT	2	6	242595	242600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618124
5065	NC_000922	CAT	2	6	242619	242624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618124
5066	NC_000922	CTAT	2	8	242654	242661	25 %	50 %	0 %	25 %	15618124
5067	NC_000922	CCT	2	6	242701	242706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618124
5068	NC_000922	CAAG	2	8	242707	242714	50 %	0 %	25 %	25 %	15618124
5069	NC_000922	TAC	2	6	242755	242760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618124
5070	NC_000922	CT	3	6	242781	242786	0 %	50 %	0 %	50 %	15618124
5071	NC_000922	CT	3	6	242800	242805	0 %	50 %	0 %	50 %	15618124
5072	NC_000922	ACT	2	6	242871	242876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618124
5073	NC_000922	GA	3	6	242982	242987	50 %	0 %	50 %	0 %	15618125
5074	NC_000922	TCC	2	6	243030	243035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618125
5075	NC_000922	TATTT	2	10	243064	243073	20 %	80 %	0 %	0 %	15618125
5076	NC_000922	AGATAT	2	12	243076	243087	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15618125
5077	NC_000922	TAC	2	6	243144	243149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618125
5078	NC_000922	CCAT	2	8	243173	243180	25 %	25 %	0 %	50 %	15618125
5079	NC_000922	ACA	2	6	243214	243219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618125
5080	NC_000922	TAA	2	6	243247	243252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618125
5081	NC_000922	GTG	2	6	243327	243332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618125
5082	NC_000922	ACA	2	6	243404	243409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618125
5083	NC_000922	TTC	2	6	243447	243452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618125
5084	NC_000922	CAA	2	6	243461	243466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618125
5085	NC_000922	CTT	2	6	243485	243490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618125
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5087	NC_000922	TAT	2	6	243538	243543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618125
5088	NC_000922	CT	3	6	243590	243595	0 %	50 %	0 %	50 %	15618125
5089	NC_000922	CTC	2	6	243620	243625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618125
5090	NC_000922	A	7	7	243650	243656	100 %	0 %	0 %	0 %	15618125
5091	NC_000922	GGT	2	6	243707	243712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618125
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5093	NC_000922	GAAA	2	8	243761	243768	75 %	0 %	25 %	0 %	15618126
5094	NC_000922	ATT	2	6	243997	244002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618126
5095	NC_000922	ATC	2	6	244018	244023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618126
5096	NC_000922	GGA	2	6	244126	244131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618126
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5098	NC_000922	TGA	2	6	244191	244196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618126
5099	NC_000922	CTC	2	6	244203	244208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618126
5100	NC_000922	A	7	7	244257	244263	100 %	0 %	0 %	0 %	15618126
5101	NC_000922	TAT	2	6	244312	244317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618126
5102	NC_000922	A	6	6	244376	244381	100 %	0 %	0 %	0 %	15618126
5103	NC_000922	TCT	2	6	244416	244421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618126
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5105	NC_000922	TC	3	6	244553	244558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_000922	ATG	2	6	244581	244586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_000922	A	7	7	244591	244597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_000922	T	6	6	244625	244630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_000922	CCT	2	6	244691	244696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_000922	A	7	7	244723	244729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_000922	ATT	2	6	244753	244758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_000922	CAA	2	6	244828	244833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_000922	TCCCCC	2	12	244970	244981	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
5114	NC_000922	A	7	7	244982	244988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_000922	ATACCT	2	12	245012	245023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_000922	TC	3	6	245024	245029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_000922	TCA	2	6	245117	245122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_000922	ACCA	2	8	245124	245131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_000922	ATTAG	2	10	245134	245143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_000922	A	7	7	245149	245155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_000922	CTA	2	6	245171	245176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_000922	CT	3	6	245197	245202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_000922	CTG	2	6	245209	245214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_000922	ACGAAG	2	12	245303	245314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5125	NC_000922	CTT	2	6	245317	245322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_000922	CTT	2	6	245373	245378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_000922	TTA	2	6	245402	245407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_000922	AATCT	2	10	245501	245510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5129	NC_000922	AGA	2	6	245547	245552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_000922	ATT	2	6	245559	245564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_000922	A	6	6	245617	245622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_000922	AAC	2	6	245669	245674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_000922	TCA	2	6	245745	245750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_000922	TAATCC	2	12	245882	245893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5243	NC_000922	T	6	6	250899	250904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_000922	TTA	2	6	250923	250928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_000922	AG	3	6	250984	250989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_000922	ATT	2	6	250996	251001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_000922	AAC	2	6	251018	251023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_000922	TC	3	6	251078	251083	0 %	50 %	0 %	50 %	15618133
5249	NC_000922	CT	3	6	251192	251197	0 %	50 %	0 %	50 %	15618133
5250	NC_000922	TC	3	6	251237	251242	0 %	50 %	0 %	50 %	15618133
5251	NC_000922	ATA	2	6	251275	251280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618133
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5253	NC_000922	GAA	2	6	251310	251315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_000922	CAAC	2	8	251330	251337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5255	NC_000922	TA	3	6	251346	251351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_000922	TAA	2	6	251388	251393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5385	NC_000922	CA	3	6	256875	256880	50 %	0 %	0 %	50 %	15618139
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5497	NC_000922	TA	3	6	261585	261590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_000922	ATTTT	2	10	261594	261603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_000922	ATTAG	2	10	261611	261620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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