MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000922	TCC	2	6	214319	214324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618098
4502	NC_000922	TAT	2	6	214403	214408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618098
4503	NC_000922	AT	3	6	214414	214419	50 %	50 %	0 %	0 %	15618098
4504	NC_000922	TAT	2	6	214508	214513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618098
4505	NC_000922	TTG	2	6	214534	214539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618098
4506	NC_000922	T	7	7	214546	214552	0 %	100 %	0 %	0 %	15618098
4507	NC_000922	CT	3	6	214620	214625	0 %	50 %	0 %	50 %	15618098
4508	NC_000922	GAA	2	6	214632	214637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618098
4509	NC_000922	AGA	3	9	214640	214648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618098
4510	NC_000922	CAG	2	6	214764	214769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_000922	TTA	2	6	214880	214885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_000922	TG	3	6	214913	214918	0 %	50 %	50 %	0 %	15618099
4513	NC_000922	TAC	2	6	214927	214932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618099
4514	NC_000922	TGA	2	6	214975	214980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618099
4515	NC_000922	TTTA	2	8	215115	215122	25 %	75 %	0 %	0 %	15618099
4516	NC_000922	ATAG	2	8	215129	215136	50 %	25 %	25 %	0 %	15618099
4517	NC_000922	GCT	2	6	215192	215197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618099
4518	NC_000922	TAT	2	6	215200	215205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618099
4519	NC_000922	CTT	2	6	215215	215220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618099
4520	NC_000922	GAT	3	9	215274	215282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618099
4521	NC_000922	GAA	2	6	215304	215309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618100
4522	NC_000922	CA	3	6	215390	215395	50 %	0 %	0 %	50 %	15618100
4523	NC_000922	TA	3	6	215416	215421	50 %	50 %	0 %	0 %	15618100
4524	NC_000922	GAT	2	6	215466	215471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618100
4525	NC_000922	A	6	6	215491	215496	100 %	0 %	0 %	0 %	15618100
4526	NC_000922	CGTT	2	8	215530	215537	0 %	50 %	25 %	25 %	15618100
4527	NC_000922	GAG	2	6	215622	215627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618100
4528	NC_000922	AGAA	2	8	215632	215639	75 %	0 %	25 %	0 %	15618100
4529	NC_000922	A	6	6	215638	215643	100 %	0 %	0 %	0 %	15618100
4530	NC_000922	GCA	2	6	215661	215666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618100
4531	NC_000922	TTA	2	6	215673	215678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618100
4532	NC_000922	TTC	2	6	215714	215719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618100
4533	NC_000922	ATC	2	6	215732	215737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618100
4534	NC_000922	TGG	2	6	215756	215761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618100
4535	NC_000922	AGA	2	6	215920	215925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618100
4536	NC_000922	AG	3	6	215960	215965	50 %	0 %	50 %	0 %	15618100
4537	NC_000922	AGA	2	6	215978	215983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618100
4538	NC_000922	ATTCA	2	10	216014	216023	40 %	40 %	0 %	20 %	15618100
4539	NC_000922	AGC	2	6	216047	216052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618100
4540	NC_000922	TA	3	6	216081	216086	50 %	50 %	0 %	0 %	15618100
4541	NC_000922	ATT	2	6	216088	216093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618100
4542	NC_000922	CT	3	6	216148	216153	0 %	50 %	0 %	50 %	15618100
4543	NC_000922	TGA	2	6	216170	216175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618100
4544	NC_000922	CAA	2	6	216186	216191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618100
4545	NC_000922	ATA	2	6	216202	216207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618100
4546	NC_000922	AT	3	6	216212	216217	50 %	50 %	0 %	0 %	15618100
4547	NC_000922	ATG	2	6	216271	216276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618100
4548	NC_000922	CTT	2	6	216596	216601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_000922	GAG	2	6	216613	216618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618101
4550	NC_000922	GAA	2	6	216732	216737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618101
4551	NC_000922	AGCA	2	8	216790	216797	50 %	0 %	25 %	25 %	15618101
4552	NC_000922	TCT	3	9	216912	216920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618101
4553	NC_000922	CGT	2	6	216948	216953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618101
4554	NC_000922	T	6	6	217026	217031	0 %	100 %	0 %	0 %	15618101
4555	NC_000922	GCT	2	6	217116	217121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618101
4556	NC_000922	TC	3	6	217197	217202	0 %	50 %	0 %	50 %	15618101
4557	NC_000922	TCA	2	6	217221	217226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618101
4558	NC_000922	TTC	2	6	217340	217345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618101
4559	NC_000922	AGG	2	6	217390	217395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618101
4560	NC_000922	CT	3	6	217502	217507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_000922	CAA	2	6	217532	217537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_000922	AT	3	6	217628	217633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_000922	A	6	6	217635	217640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_000922	ACCC	2	8	217651	217658	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4565	NC_000922	GA	3	6	217752	217757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_000922	TTCTCT	2	12	217807	217818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618102
4567	NC_000922	GTT	2	6	217854	217859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618102
4568	NC_000922	GTT	2	6	217937	217942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618102
4569	NC_000922	TCC	2	6	217960	217965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618102
4570	NC_000922	GA	3	6	217974	217979	50 %	0 %	50 %	0 %	15618102
4571	NC_000922	TTTG	2	8	217994	218001	0 %	75 %	25 %	0 %	15618102
4572	NC_000922	AGGTT	2	10	218078	218087	20 %	40 %	40 %	0 %	15618103
4573	NC_000922	GA	3	6	218111	218116	50 %	0 %	50 %	0 %	15618103
4574	NC_000922	AGG	2	6	218148	218153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618103
4575	NC_000922	TCTT	2	8	218168	218175	0 %	75 %	0 %	25 %	15618103
4576	NC_000922	AAG	2	6	218210	218215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618103
4577	NC_000922	TGA	2	6	218216	218221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618103
4578	NC_000922	TAC	2	6	218224	218229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618103
4579	NC_000922	GTTGT	2	10	218263	218272	0 %	60 %	40 %	0 %	15618103
4580	NC_000922	CATTTA	2	12	218343	218354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15618103
4581	NC_000922	T	7	7	218365	218371	0 %	100 %	0 %	0 %	15618103
4582	NC_000922	CTT	2	6	218450	218455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618104
4583	NC_000922	TCT	2	6	218482	218487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618104
4584	NC_000922	CAA	2	6	218558	218563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618104
4585	NC_000922	T	6	6	218686	218691	0 %	100 %	0 %	0 %	15618104
4586	NC_000922	AAT	2	6	218750	218755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618104
4587	NC_000922	TAA	2	6	218775	218780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618104
4588	NC_000922	CTAG	2	8	218997	219004	25 %	25 %	25 %	25 %	15618105
4589	NC_000922	TGT	2	6	219011	219016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618105
4590	NC_000922	TCCCC	2	10	219018	219027	0 %	20 %	0 %	80 %	15618105
4591	NC_000922	ATG	2	6	219083	219088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618105
4592	NC_000922	AAT	2	6	219100	219105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618105
4593	NC_000922	TAT	2	6	219106	219111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618105
4594	NC_000922	T	6	6	219128	219133	0 %	100 %	0 %	0 %	15618105
4595	NC_000922	A	7	7	219134	219140	100 %	0 %	0 %	0 %	15618105
4596	NC_000922	TAA	2	6	219141	219146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618105
4597	NC_000922	TTA	2	6	219176	219181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_000922	CAA	2	6	219196	219201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_000922	TAA	2	6	219207	219212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_000922	ATC	2	6	219221	219226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_000922	TA	3	6	219245	219250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_000922	AAT	2	6	219253	219258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_000922	ATT	2	6	219326	219331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618106
4604	NC_000922	A	7	7	219343	219349	100 %	0 %	0 %	0 %	15618106
4605	NC_000922	TGG	2	6	219431	219436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618106
4606	NC_000922	CAC	2	6	219456	219461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618106
4607	NC_000922	ATAGCT	2	12	219494	219505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15618106
4608	NC_000922	TCT	2	6	219506	219511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618106
4609	NC_000922	ATA	2	6	219553	219558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618106
4610	NC_000922	AGG	2	6	219559	219564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618106
4611	NC_000922	AGG	2	6	219616	219621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618106
4612	NC_000922	ATA	2	6	219625	219630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618106
4613	NC_000922	ATT	2	6	219658	219663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618106
4614	NC_000922	GAT	2	6	219694	219699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618106
4615	NC_000922	CTT	2	6	219792	219797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618106
4616	NC_000922	T	6	6	219850	219855	0 %	100 %	0 %	0 %	15618106
4617	NC_000922	TAA	2	6	219865	219870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618106
4618	NC_000922	CTT	2	6	219905	219910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618106
4619	NC_000922	TCAA	2	8	219980	219987	50 %	25 %	0 %	25 %	15618106
4620	NC_000922	TTA	2	6	220118	220123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618106
4621	NC_000922	CGGCTT	2	12	220128	220139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618106
4622	NC_000922	TAA	2	6	220227	220232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618106
4623	NC_000922	T	6	6	220248	220253	0 %	100 %	0 %	0 %	15618106
4624	NC_000922	AAT	2	6	220285	220290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618106
4625	NC_000922	GCA	2	6	220343	220348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618106
4626	NC_000922	CAT	2	6	220360	220365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618106
4627	NC_000922	TGC	2	6	220528	220533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618106
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4733	NC_000922	T	6	6	225447	225452	0 %	100 %	0 %	0 %	15618112
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4747	NC_000922	AAG	2	6	226174	226179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618112
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4753	NC_000922	GCCT	2	8	226741	226748	0 %	25 %	25 %	50 %	15618113
4754	NC_000922	TACC	2	8	226795	226802	25 %	25 %	0 %	50 %	15618113
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4863	NC_000922	AT	3	6	232416	232421	50 %	50 %	0 %	0 %	15618116
4864	NC_000922	AATA	2	8	232434	232441	75 %	25 %	0 %	0 %	15618116
4865	NC_000922	CA	3	6	232572	232577	50 %	0 %	0 %	50 %	15618116
4866	NC_000922	AAC	2	6	232600	232605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618116
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4872	NC_000922	AG	3	6	232870	232875	50 %	0 %	50 %	0 %	15618117
4873	NC_000922	AG	3	6	232890	232895	50 %	0 %	50 %	0 %	15618117
4874	NC_000922	TCT	2	6	232916	232921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618117
4875	NC_000922	CAC	2	6	232949	232954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618117
4876	NC_000922	GAC	2	6	233005	233010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618117
4877	NC_000922	TCC	2	6	233053	233058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618117
4878	NC_000922	T	9	9	233115	233123	0 %	100 %	0 %	0 %	15618117
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