MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_000117	TTA	2	6	860998	861003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_000117	AGC	2	6	861083	861088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605474
19003	NC_000117	TG	3	6	861131	861136	0 %	50 %	50 %	0 %	15605474
19004	NC_000117	CTTTTT	2	12	861204	861215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15605474
19005	NC_000117	GAC	2	6	861226	861231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605474
19006	NC_000117	GAG	2	6	861319	861324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605474
19007	NC_000117	A	6	6	861377	861382	100 %	0 %	0 %	0 %	15605474
19008	NC_000117	TTA	2	6	861409	861414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_000117	T	7	7	861654	861660	0 %	100 %	0 %	0 %	15605475
19010	NC_000117	GAG	2	6	861711	861716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605475
19011	NC_000117	GAAG	2	8	861740	861747	50 %	0 %	50 %	0 %	15605475
19012	NC_000117	AAT	2	6	861865	861870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605475
19013	NC_000117	T	8	8	861870	861877	0 %	100 %	0 %	0 %	15605475
19014	NC_000117	AG	3	6	861930	861935	50 %	0 %	50 %	0 %	15605475
19015	NC_000117	TCT	2	6	861938	861943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605475
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19017	NC_000117	CTT	2	6	862016	862021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605475
19018	NC_000117	TTG	2	6	862063	862068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605475
19019	NC_000117	TTC	2	6	862138	862143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605475
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19021	NC_000117	TTG	2	6	862186	862191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605475
19022	NC_000117	TTC	2	6	862225	862230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605475
19023	NC_000117	AAT	2	6	862249	862254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605475
19024	NC_000117	TTTA	2	8	862309	862316	25 %	75 %	0 %	0 %	15605475
19025	NC_000117	TGG	2	6	862318	862323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605475
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19033	NC_000117	TGGGA	2	10	862556	862565	20 %	20 %	60 %	0 %	15605475
19034	NC_000117	AAAT	2	8	862576	862583	75 %	25 %	0 %	0 %	15605475
19035	NC_000117	GAG	2	6	862632	862637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605475
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19037	NC_000117	TCC	2	6	862722	862727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19038	NC_000117	AGG	2	6	862730	862735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_000117	A	8	8	862793	862800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_000117	A	6	6	862857	862862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_000117	ATT	2	6	862879	862884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605476
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19045	NC_000117	TAG	2	6	862963	862968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605476
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19052	NC_000117	T	7	7	863065	863071	0 %	100 %	0 %	0 %	15605476
19053	NC_000117	T	6	6	863083	863088	0 %	100 %	0 %	0 %	15605476
19054	NC_000117	TGC	2	6	863162	863167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605476
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19057	NC_000117	GTCA	2	8	863222	863229	25 %	25 %	25 %	25 %	15605476
19058	NC_000117	T	8	8	863230	863237	0 %	100 %	0 %	0 %	15605476
19059	NC_000117	A	6	6	863259	863264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_000117	GTT	3	9	863274	863282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_000117	T	7	7	863291	863297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_000117	GTTT	2	8	863317	863324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_000117	AGC	2	6	863372	863377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19065	NC_000117	TGC	2	6	863462	863467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19068	NC_000117	TTC	2	6	863555	863560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19072	NC_000117	T	6	6	863644	863649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19096	NC_000117	GA	3	6	864888	864893	50 %	0 %	50 %	0 %	15605477
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