MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_000117	TCA	2	6	700215	700220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605350
15503	NC_000117	CCA	2	6	700264	700269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605350
15504	NC_000117	TCC	2	6	700365	700370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605350
15505	NC_000117	CT	3	6	700488	700493	0 %	50 %	0 %	50 %	15605350
15506	NC_000117	ACG	2	6	700495	700500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605350
15507	NC_000117	AAG	2	6	700512	700517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605350
15508	NC_000117	TTGC	2	8	700588	700595	0 %	50 %	25 %	25 %	15605350
15509	NC_000117	ACC	2	6	700608	700613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605350
15510	NC_000117	TG	3	6	700686	700691	0 %	50 %	50 %	0 %	15605350
15511	NC_000117	TAC	2	6	700696	700701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605350
15512	NC_000117	TCC	2	6	700707	700712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605350
15513	NC_000117	CTT	2	6	700771	700776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605350
15514	NC_000117	ATT	2	6	700811	700816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605350
15515	NC_000117	TCCA	2	8	700824	700831	25 %	25 %	0 %	50 %	15605350
15516	NC_000117	TGCT	2	8	700948	700955	0 %	50 %	25 %	25 %	15605350
15517	NC_000117	CTTC	2	8	700972	700979	0 %	50 %	0 %	50 %	15605350
15518	NC_000117	ATA	2	6	701006	701011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605350
15519	NC_000117	CTT	2	6	701095	701100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605350
15520	NC_000117	TTCT	2	8	701117	701124	0 %	75 %	0 %	25 %	15605350
15521	NC_000117	CAG	2	6	701149	701154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605350
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15523	NC_000117	GGTA	2	8	701215	701222	25 %	25 %	50 %	0 %	15605350
15524	NC_000117	CGA	2	6	701240	701245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605350
15525	NC_000117	TCT	2	6	701283	701288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605350
15526	NC_000117	TAC	2	6	701362	701367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605350
15527	NC_000117	ATA	2	6	701373	701378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605350
15528	NC_000117	CTG	2	6	701380	701385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605350
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15530	NC_000117	CTT	2	6	701409	701414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605350
15531	NC_000117	C	6	6	701416	701421	0 %	0 %	0 %	100 %	15605350
15532	NC_000117	TCC	2	6	701426	701431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605350
15533	NC_000117	CTC	2	6	701534	701539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605350
15534	NC_000117	TGGC	2	8	701548	701555	0 %	25 %	50 %	25 %	15605350
15535	NC_000117	TAAA	2	8	701602	701609	75 %	25 %	0 %	0 %	15605350
15536	NC_000117	AGT	2	6	701624	701629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605350
15537	NC_000117	AAG	2	6	701650	701655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605350
15538	NC_000117	AAAAC	2	10	701661	701670	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15539	NC_000117	A	6	6	701702	701707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_000117	T	7	7	701709	701715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_000117	TGTT	2	8	701719	701726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_000117	TAA	2	6	701794	701799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605351
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15545	NC_000117	A	6	6	701898	701903	100 %	0 %	0 %	0 %	15605351
15546	NC_000117	ATG	2	6	701958	701963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605351
15547	NC_000117	AGTT	2	8	701982	701989	25 %	50 %	25 %	0 %	15605351
15548	NC_000117	TCT	2	6	701999	702004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605351
15549	NC_000117	TTGG	2	8	702119	702126	0 %	50 %	50 %	0 %	15605351
15550	NC_000117	TC	3	6	702130	702135	0 %	50 %	0 %	50 %	15605351
15551	NC_000117	CAA	2	6	702179	702184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605351
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15553	NC_000117	ATTT	2	8	702219	702226	25 %	75 %	0 %	0 %	15605351
15554	NC_000117	ACT	2	6	702236	702241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605351
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15557	NC_000117	CAAT	2	8	702370	702377	50 %	25 %	0 %	25 %	15605351
15558	NC_000117	GAT	2	6	702514	702519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605351
15559	NC_000117	ATCT	2	8	702594	702601	25 %	50 %	0 %	25 %	15605351
15560	NC_000117	ATC	2	6	702608	702613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605351
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15562	NC_000117	TC	4	8	702620	702627	0 %	50 %	0 %	50 %	15605351
15563	NC_000117	TATC	2	8	702687	702694	25 %	50 %	0 %	25 %	15605351
15564	NC_000117	TA	3	6	702728	702733	50 %	50 %	0 %	0 %	15605351
15565	NC_000117	CT	3	6	702748	702753	0 %	50 %	0 %	50 %	15605351
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15569	NC_000117	GC	3	6	702871	702876	0 %	0 %	50 %	50 %	15605351
15570	NC_000117	AACT	2	8	702897	702904	50 %	25 %	0 %	25 %	15605351
15571	NC_000117	TGA	2	6	702946	702951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605351
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15582	NC_000117	GATT	2	8	703531	703538	25 %	50 %	25 %	0 %	15605351
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15598	NC_000117	CTGG	2	8	704279	704286	0 %	25 %	50 %	25 %	15605351
15599	NC_000117	AGC	2	6	704299	704304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15601	NC_000117	ATT	2	6	704341	704346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_000117	AAAT	2	8	704382	704389	75 %	25 %	0 %	0 %	15605352
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15608	NC_000117	GCT	2	6	704844	704849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605352
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15612	NC_000117	AGACG	2	10	705069	705078	40 %	0 %	40 %	20 %	15605352
15613	NC_000117	TCAA	2	8	705120	705127	50 %	25 %	0 %	25 %	15605352
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16000	NC_000117	CAA	2	6	722170	722175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605365

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