MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_000117	A	6	6	678188	678193	100 %	0 %	0 %	0 %	15605328
15003	NC_000117	A	6	6	678210	678215	100 %	0 %	0 %	0 %	15605328
15004	NC_000117	CAAA	2	8	678265	678272	75 %	0 %	0 %	25 %	15605328
15005	NC_000117	CGC	2	6	678283	678288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605328
15006	NC_000117	A	6	6	678306	678311	100 %	0 %	0 %	0 %	15605328
15007	NC_000117	A	6	6	678324	678329	100 %	0 %	0 %	0 %	15605328
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15013	NC_000117	TGA	2	6	678690	678695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605328
15014	NC_000117	TTCTC	2	10	678718	678727	0 %	60 %	0 %	40 %	15605329
15015	NC_000117	TCT	2	6	678739	678744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605329
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15017	NC_000117	TCA	2	6	678827	678832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605329
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15019	NC_000117	A	7	7	678985	678991	100 %	0 %	0 %	0 %	15605329
15020	NC_000117	A	6	6	679008	679013	100 %	0 %	0 %	0 %	15605329
15021	NC_000117	TC	3	6	679017	679022	0 %	50 %	0 %	50 %	15605329
15022	NC_000117	CT	3	6	679028	679033	0 %	50 %	0 %	50 %	15605329
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15030	NC_000117	TC	3	6	679395	679400	0 %	50 %	0 %	50 %	15605329
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15034	NC_000117	TC	3	6	679617	679622	0 %	50 %	0 %	50 %	15605329
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15097	NC_000117	AGAA	2	8	682202	682209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_000117	ACC	2	6	682240	682245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15099	NC_000117	A	6	6	682289	682294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_000117	AGG	2	6	682304	682309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_000117	A	6	6	682356	682361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_000117	TTC	2	6	682401	682406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605334
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15110	NC_000117	CACC	2	8	682759	682766	25 %	0 %	0 %	75 %	15605334
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15113	NC_000117	GCA	2	6	682855	682860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605334
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15120	NC_000117	CACAG	2	10	683172	683181	40 %	0 %	20 %	40 %	15605334
15121	NC_000117	CT	3	6	683194	683199	0 %	50 %	0 %	50 %	15605334
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15278	NC_000117	TAA	2	6	690427	690432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605341
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15298	NC_000117	ACAA	2	8	691292	691299	75 %	0 %	0 %	25 %	15605342
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15307	NC_000117	AT	3	6	691625	691630	50 %	50 %	0 %	0 %	15605342
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15323	NC_000117	A	7	7	692202	692208	100 %	0 %	0 %	0 %	15605343
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15334	NC_000117	GATA	2	8	692852	692859	50 %	25 %	25 %	0 %	15605344
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15338	NC_000117	CCGCT	2	10	692888	692897	0 %	20 %	20 %	60 %	15605344
15339	NC_000117	TTGC	2	8	692971	692978	0 %	50 %	25 %	25 %	15605344
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15348	NC_000117	ATCAAT	2	12	693338	693349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15605344
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15355	NC_000117	CT	3	6	693655	693660	0 %	50 %	0 %	50 %	15605345
15356	NC_000117	GGA	2	6	693701	693706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605345
15357	NC_000117	TACT	2	8	693714	693721	25 %	50 %	0 %	25 %	15605345
15358	NC_000117	T	6	6	693765	693770	0 %	100 %	0 %	0 %	15605345
15359	NC_000117	ATT	2	6	693811	693816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605345
15360	NC_000117	CTT	2	6	693825	693830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605345
15361	NC_000117	AC	3	6	693856	693861	50 %	0 %	0 %	50 %	15605345
15362	NC_000117	CTT	2	6	693900	693905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605345
15363	NC_000117	A	8	8	693907	693914	100 %	0 %	0 %	0 %	15605345
15364	NC_000117	ACA	3	9	694011	694019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605345
15365	NC_000117	GCA	2	6	694030	694035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15366	NC_000117	T	6	6	694074	694079	0 %	100 %	0 %	0 %	15605346
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15368	NC_000117	GAC	2	6	694221	694226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605346
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15370	NC_000117	CAAAA	2	10	694252	694261	80 %	0 %	0 %	20 %	15605346
15371	NC_000117	CTT	2	6	694290	694295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605346
15372	NC_000117	CAG	2	6	694347	694352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605346
15373	NC_000117	CCA	2	6	694385	694390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605346
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