MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_000117	GGATGG	2	12	611563	611574	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15605273
13502	NC_000117	AG	4	8	611616	611623	50 %	0 %	50 %	0 %	15605273
13503	NC_000117	TGG	2	6	611629	611634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605273
13504	NC_000117	ATA	2	6	611654	611659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605273
13505	NC_000117	GGCGC	2	10	611714	611723	0 %	0 %	60 %	40 %	15605273
13506	NC_000117	ATT	2	6	611740	611745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605273
13507	NC_000117	ATCG	2	8	611770	611777	25 %	25 %	25 %	25 %	15605273
13508	NC_000117	AGA	2	6	611832	611837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605273
13509	NC_000117	GAA	2	6	611854	611859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605273
13510	NC_000117	AG	3	6	611893	611898	50 %	0 %	50 %	0 %	15605273
13511	NC_000117	CT	3	6	611899	611904	0 %	50 %	0 %	50 %	15605273
13512	NC_000117	TTAC	2	8	611921	611928	25 %	50 %	0 %	25 %	15605273
13513	NC_000117	TAA	2	6	611937	611942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605273
13514	NC_000117	CCT	2	6	611966	611971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605273
13515	NC_000117	TTTA	2	8	611974	611981	25 %	75 %	0 %	0 %	15605273
13516	NC_000117	CT	3	6	612014	612019	0 %	50 %	0 %	50 %	15605273
13517	NC_000117	ATT	2	6	612038	612043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605273
13518	NC_000117	TTTG	2	8	612072	612079	0 %	75 %	25 %	0 %	15605273
13519	NC_000117	ATT	2	6	612090	612095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605273
13520	NC_000117	GGCT	2	8	612112	612119	0 %	25 %	50 %	25 %	15605273
13521	NC_000117	TCT	2	6	612164	612169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605273
13522	NC_000117	ATT	2	6	612177	612182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605273
13523	NC_000117	TGG	2	6	612226	612231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605273
13524	NC_000117	T	6	6	612261	612266	0 %	100 %	0 %	0 %	15605273
13525	NC_000117	ATG	2	6	612283	612288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605273
13526	NC_000117	ATTGG	2	10	612289	612298	20 %	40 %	40 %	0 %	15605273
13527	NC_000117	A	6	6	612319	612324	100 %	0 %	0 %	0 %	15605273
13528	NC_000117	AGC	2	6	612372	612377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605273
13529	NC_000117	TTG	2	6	612434	612439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605273
13530	NC_000117	TCAA	2	8	612599	612606	50 %	25 %	0 %	25 %	15605274
13531	NC_000117	TTG	2	6	612612	612617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605274
13532	NC_000117	CGCT	2	8	612645	612652	0 %	25 %	25 %	50 %	15605274
13533	NC_000117	TTTG	2	8	612670	612677	0 %	75 %	25 %	0 %	15605274
13534	NC_000117	ATC	2	6	612725	612730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605274
13535	NC_000117	A	9	9	612770	612778	100 %	0 %	0 %	0 %	15605274
13536	NC_000117	CTT	2	6	612812	612817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605274
13537	NC_000117	GAA	2	6	612827	612832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13538	NC_000117	TTTG	2	8	612846	612853	0 %	75 %	25 %	0 %	15605274
13539	NC_000117	CTCTC	2	10	612854	612863	0 %	40 %	0 %	60 %	15605274
13540	NC_000117	ATAG	2	8	612899	612906	50 %	25 %	25 %	0 %	15605274
13541	NC_000117	GAA	2	6	612992	612997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13542	NC_000117	AAG	2	6	613038	613043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13543	NC_000117	AGA	2	6	613078	613083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13544	NC_000117	GAA	2	6	613100	613105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13545	NC_000117	AAAAC	2	10	613114	613123	80 %	0 %	0 %	20 %	15605274
13546	NC_000117	AAC	2	6	613143	613148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605274
13547	NC_000117	GCTC	2	8	613243	613250	0 %	25 %	25 %	50 %	15605274
13548	NC_000117	AG	3	6	613277	613282	50 %	0 %	50 %	0 %	15605274
13549	NC_000117	TAG	2	6	613342	613347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605274
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13551	NC_000117	GCA	2	6	613391	613396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605274
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13553	NC_000117	A	8	8	613500	613507	100 %	0 %	0 %	0 %	15605274
13554	NC_000117	AGA	2	6	613519	613524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
13555	NC_000117	CTT	2	6	613549	613554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605274
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13558	NC_000117	TAT	3	9	613681	613689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605274
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13563	NC_000117	AG	3	6	613922	613927	50 %	0 %	50 %	0 %	15605274
13564	NC_000117	TTA	2	6	613932	613937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605274
13565	NC_000117	ATT	2	6	613979	613984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605274
13566	NC_000117	TGTA	2	8	614139	614146	25 %	50 %	25 %	0 %	15605274
13567	NC_000117	A	6	6	614183	614188	100 %	0 %	0 %	0 %	15605274
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13570	NC_000117	CA	3	6	614392	614397	50 %	0 %	0 %	50 %	15605274
13571	NC_000117	A	7	7	614408	614414	100 %	0 %	0 %	0 %	15605274
13572	NC_000117	TC	3	6	614466	614471	0 %	50 %	0 %	50 %	15605274
13573	NC_000117	TTC	2	6	614472	614477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605274
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13579	NC_000117	TAA	2	6	614923	614928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605274
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13599	NC_000117	GAA	2	6	615785	615790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605274
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13601	NC_000117	CGA	2	6	615904	615909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605274
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13603	NC_000117	AAAG	2	8	615988	615995	75 %	0 %	25 %	0 %	15605274
13604	NC_000117	AG	3	6	616004	616009	50 %	0 %	50 %	0 %	15605274
13605	NC_000117	TC	3	6	616011	616016	0 %	50 %	0 %	50 %	15605274
13606	NC_000117	TAAA	2	8	616038	616045	75 %	25 %	0 %	0 %	15605274
13607	NC_000117	TTAT	2	8	616061	616068	25 %	75 %	0 %	0 %	15605274
13608	NC_000117	CT	4	8	616109	616116	0 %	50 %	0 %	50 %	15605274
13609	NC_000117	TC	3	6	616152	616157	0 %	50 %	0 %	50 %	15605274
13610	NC_000117	T	6	6	616168	616173	0 %	100 %	0 %	0 %	15605274
13611	NC_000117	GAT	2	6	616181	616186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605274
13612	NC_000117	TCTCT	2	10	616188	616197	0 %	60 %	0 %	40 %	15605274
13613	NC_000117	CTC	2	6	616274	616279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13614	NC_000117	A	6	6	616371	616376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_000117	CT	3	6	616385	616390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_000117	AG	3	6	616427	616432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_000117	A	6	6	616440	616445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_000117	GGAA	2	8	616455	616462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_000117	A	7	7	616467	616473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13621	NC_000117	TA	3	6	616582	616587	50 %	50 %	0 %	0 %	15605275
13622	NC_000117	TGAAT	2	10	616727	616736	40 %	40 %	20 %	0 %	15605275
13623	NC_000117	GCT	2	6	616765	616770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605275
13624	NC_000117	TCT	3	9	616813	616821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605275
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