MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000117	ATA	2	6	588397	588402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605241
13002	NC_000117	AG	3	6	588414	588419	50 %	0 %	50 %	0 %	15605241
13003	NC_000117	AGG	2	6	588424	588429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605241
13004	NC_000117	ATT	2	6	588462	588467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605241
13005	NC_000117	CAT	2	6	588587	588592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605241
13006	NC_000117	TCC	2	6	588621	588626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605241
13007	NC_000117	T	6	6	588652	588657	0 %	100 %	0 %	0 %	15605241
13008	NC_000117	AGC	2	6	588660	588665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605241
13009	NC_000117	AAACT	2	10	588763	588772	60 %	20 %	0 %	20 %	15605241
13010	NC_000117	CCT	2	6	588778	588783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605241
13011	NC_000117	AAC	2	6	588786	588791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605241
13012	NC_000117	ACA	2	6	588795	588800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605241
13013	NC_000117	GAC	2	6	588807	588812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605241
13014	NC_000117	CT	3	6	588899	588904	0 %	50 %	0 %	50 %	15605242
13015	NC_000117	CTA	2	6	588925	588930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605242
13016	NC_000117	CTC	2	6	588949	588954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605242
13017	NC_000117	AAC	2	6	588962	588967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605242
13018	NC_000117	T	6	6	589035	589040	0 %	100 %	0 %	0 %	15605242
13019	NC_000117	CAT	2	6	589108	589113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605242
13020	NC_000117	TA	3	6	589234	589239	50 %	50 %	0 %	0 %	15605242
13021	NC_000117	T	6	6	589277	589282	0 %	100 %	0 %	0 %	15605243
13022	NC_000117	GCT	2	6	589293	589298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605243
13023	NC_000117	ACG	2	6	589310	589315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605243
13024	NC_000117	AACT	2	8	589400	589407	50 %	25 %	0 %	25 %	15605243
13025	NC_000117	TCTA	2	8	589643	589650	25 %	50 %	0 %	25 %	15605243
13026	NC_000117	AACA	2	8	589670	589677	75 %	0 %	0 %	25 %	15605243
13027	NC_000117	CTT	2	6	589705	589710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605243
13028	NC_000117	TCA	2	6	589758	589763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605243
13029	NC_000117	ACCAA	2	10	589855	589864	60 %	0 %	0 %	40 %	15605244
13030	NC_000117	CGC	2	6	589876	589881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605244
13031	NC_000117	GAG	2	6	589924	589929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605244
13032	NC_000117	TGC	2	6	589976	589981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605244
13033	NC_000117	CCT	2	6	589994	589999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605244
13034	NC_000117	AC	3	6	590011	590016	50 %	0 %	0 %	50 %	15605244
13035	NC_000117	TCT	2	6	590046	590051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605244
13036	NC_000117	TCT	2	6	590091	590096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605244
13037	NC_000117	TGC	2	6	590124	590129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605244
13038	NC_000117	CTT	2	6	590281	590286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605245
13039	NC_000117	ATTC	2	8	590359	590366	25 %	50 %	0 %	25 %	15605245
13040	NC_000117	ATC	2	6	590416	590421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605245
13041	NC_000117	CATA	2	8	590523	590530	50 %	25 %	0 %	25 %	15605245
13042	NC_000117	TTA	2	6	590706	590711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605245
13043	NC_000117	TCT	2	6	590715	590720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605245
13044	NC_000117	TCTT	2	8	590772	590779	0 %	75 %	0 %	25 %	15605245
13045	NC_000117	TA	3	6	590790	590795	50 %	50 %	0 %	0 %	15605245
13046	NC_000117	T	7	7	590797	590803	0 %	100 %	0 %	0 %	15605245
13047	NC_000117	TC	4	8	590825	590832	0 %	50 %	0 %	50 %	15605246
13048	NC_000117	GAA	2	6	590850	590855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605246
13049	NC_000117	TC	3	6	590893	590898	0 %	50 %	0 %	50 %	15605246
13050	NC_000117	ACGT	2	8	590942	590949	25 %	25 %	25 %	25 %	15605246
13051	NC_000117	GAG	2	6	590962	590967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605246
13052	NC_000117	T	6	6	591018	591023	0 %	100 %	0 %	0 %	15605246
13053	NC_000117	AAC	2	6	591064	591069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605246
13054	NC_000117	AGCA	2	8	591104	591111	50 %	0 %	25 %	25 %	15605246
13055	NC_000117	ATC	2	6	591266	591271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605247
13056	NC_000117	GAT	2	6	591272	591277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605247
13057	NC_000117	AAC	2	6	591359	591364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605247
13058	NC_000117	CTT	2	6	591371	591376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605247
13059	NC_000117	ATCAC	2	10	591417	591426	40 %	20 %	0 %	40 %	15605247
13060	NC_000117	CGA	2	6	591444	591449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605247
13061	NC_000117	TAT	2	6	591493	591498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605247
13062	NC_000117	ACT	2	6	591545	591550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605248
13063	NC_000117	CTT	2	6	591626	591631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605248
13064	NC_000117	ATA	2	6	591654	591659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605248
13065	NC_000117	ACC	2	6	591676	591681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605248
13066	NC_000117	AAC	3	9	591720	591728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605248
13067	NC_000117	T	6	6	591731	591736	0 %	100 %	0 %	0 %	15605248
13068	NC_000117	TGA	2	6	591744	591749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605248
13069	NC_000117	ACT	2	6	591751	591756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605248
13070	NC_000117	T	7	7	591812	591818	0 %	100 %	0 %	0 %	15605249
13071	NC_000117	TGA	2	6	591869	591874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605249
13072	NC_000117	AGC	2	6	591898	591903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605249
13073	NC_000117	CGCA	2	8	591907	591914	25 %	0 %	25 %	50 %	15605249
13074	NC_000117	AG	3	6	591921	591926	50 %	0 %	50 %	0 %	15605249
13075	NC_000117	T	6	6	591928	591933	0 %	100 %	0 %	0 %	15605249
13076	NC_000117	TC	3	6	591972	591977	0 %	50 %	0 %	50 %	15605249
13077	NC_000117	TAA	2	6	591988	591993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605249
13078	NC_000117	T	6	6	591998	592003	0 %	100 %	0 %	0 %	15605249
13079	NC_000117	GCA	2	6	592062	592067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605250
13080	NC_000117	TCT	2	6	592092	592097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605250
13081	NC_000117	ACA	2	6	592140	592145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605250
13082	NC_000117	CAG	2	6	592192	592197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605250
13083	NC_000117	T	6	6	592199	592204	0 %	100 %	0 %	0 %	15605250
13084	NC_000117	GGC	2	6	592294	592299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605250
13085	NC_000117	ATCC	2	8	592305	592312	25 %	25 %	0 %	50 %	15605250
13086	NC_000117	CAA	2	6	592348	592353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605250
13087	NC_000117	CTG	2	6	592391	592396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605250
13088	NC_000117	ATA	2	6	592428	592433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605250
13089	NC_000117	CA	3	6	592437	592442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_000117	GCA	2	6	592466	592471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605251
13091	NC_000117	AGC	2	6	592480	592485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605251
13092	NC_000117	CTT	2	6	592513	592518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605251
13093	NC_000117	AGT	2	6	592561	592566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605251
13094	NC_000117	CCGA	2	8	592641	592648	25 %	0 %	25 %	50 %	15605251
13095	NC_000117	GAAA	2	8	592747	592754	75 %	0 %	25 %	0 %	15605251
13096	NC_000117	CGA	2	6	592788	592793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605251
13097	NC_000117	TTC	2	6	592898	592903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605251
13098	NC_000117	AAC	2	6	592966	592971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605251
13099	NC_000117	GCA	2	6	592979	592984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605251
13100	NC_000117	AAG	2	6	592992	592997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605251
13101	NC_000117	TCT	2	6	593001	593006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605251
13102	NC_000117	ATT	2	6	593059	593064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605251
13103	NC_000117	CT	3	6	593154	593159	0 %	50 %	0 %	50 %	15605252
13104	NC_000117	CAA	2	6	593163	593168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605252
13105	NC_000117	T	6	6	593338	593343	0 %	100 %	0 %	0 %	15605252
13106	NC_000117	CAA	2	6	593394	593399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605252
13107	NC_000117	TCA	2	6	593412	593417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605252
13108	NC_000117	GTAT	2	8	593454	593461	25 %	50 %	25 %	0 %	15605252
13109	NC_000117	T	6	6	593506	593511	0 %	100 %	0 %	0 %	15605253
13110	NC_000117	TTG	2	6	593535	593540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605253
13111	NC_000117	GA	3	6	593541	593546	50 %	0 %	50 %	0 %	15605253
13112	NC_000117	ACG	2	6	593656	593661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605253
13113	NC_000117	TCT	2	6	593685	593690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605253
13114	NC_000117	TGA	2	6	593726	593731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605253
13115	NC_000117	CAA	2	6	593733	593738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605253
13116	NC_000117	TTA	2	6	593800	593805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605254
13117	NC_000117	CAC	2	6	593888	593893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605254
13118	NC_000117	CGA	2	6	593959	593964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605254
13119	NC_000117	AC	3	6	593983	593988	50 %	0 %	0 %	50 %	15605254
13120	NC_000117	TTCA	2	8	594036	594043	25 %	50 %	0 %	25 %	15605254
13121	NC_000117	GAT	2	6	594099	594104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605254
13122	NC_000117	GCA	2	6	594207	594212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605254
13123	NC_000117	CTTC	2	8	594229	594236	0 %	50 %	0 %	50 %	15605254
13124	NC_000117	TTA	2	6	594382	594387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605254
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13129	NC_000117	CTT	2	6	594517	594522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605254
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13134	NC_000117	CTTC	2	8	594638	594645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13180	NC_000117	A	6	6	596768	596773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13210	NC_000117	TACA	2	8	597701	597708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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