MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_000117	CGTC	2	8	566160	566167	0 %	25 %	25 %	50 %	15605217
12502	NC_000117	CCA	2	6	566187	566192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_000117	A	6	6	566194	566199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_000117	A	6	6	566207	566212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_000117	ATT	2	6	566216	566221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_000117	A	6	6	566222	566227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_000117	ACAA	2	8	566233	566240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12508	NC_000117	ATT	2	6	566248	566253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_000117	AAT	2	6	566259	566264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_000117	ATTTT	2	10	566271	566280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_000117	AAAAAT	2	12	566291	566302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_000117	A	6	6	566317	566322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_000117	TTG	2	6	566386	566391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605218
12514	NC_000117	CCT	2	6	566427	566432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605218
12515	NC_000117	AAAG	2	8	566487	566494	75 %	0 %	25 %	0 %	15605218
12516	NC_000117	CTA	2	6	566535	566540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605218
12517	NC_000117	ATC	2	6	566592	566597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605218
12518	NC_000117	AAC	2	6	566740	566745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605219
12519	NC_000117	ACA	2	6	566774	566779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605219
12520	NC_000117	TTC	2	6	566781	566786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605219
12521	NC_000117	ATCA	2	8	566922	566929	50 %	25 %	0 %	25 %	15605219
12522	NC_000117	TCC	2	6	566955	566960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605219
12523	NC_000117	GAA	2	6	566985	566990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605219
12524	NC_000117	GTT	2	6	567182	567187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605219
12525	NC_000117	CGA	2	6	567203	567208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605219
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12528	NC_000117	GAG	2	6	567347	567352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605219
12529	NC_000117	T	6	6	567600	567605	0 %	100 %	0 %	0 %	15605219
12530	NC_000117	ACG	2	6	567615	567620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605219
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12533	NC_000117	TCA	2	6	567739	567744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605219
12534	NC_000117	TTTC	2	8	567902	567909	0 %	75 %	0 %	25 %	15605219
12535	NC_000117	TCT	2	6	567910	567915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605219
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12537	NC_000117	CT	3	6	568012	568017	0 %	50 %	0 %	50 %	15605219
12538	NC_000117	CGA	2	6	568065	568070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605220
12539	NC_000117	TTC	2	6	568073	568078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605220
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12541	NC_000117	T	6	6	568120	568125	0 %	100 %	0 %	0 %	15605220
12542	NC_000117	AGA	2	6	568133	568138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605220
12543	NC_000117	T	7	7	568183	568189	0 %	100 %	0 %	0 %	15605220
12544	NC_000117	ACA	2	6	568270	568275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605220
12545	NC_000117	CAA	2	6	568339	568344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605220
12546	NC_000117	AC	3	6	568349	568354	50 %	0 %	0 %	50 %	15605220
12547	NC_000117	TCT	2	6	568371	568376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605220
12548	NC_000117	CTA	2	6	568428	568433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605220
12549	NC_000117	T	6	6	568640	568645	0 %	100 %	0 %	0 %	15605221
12550	NC_000117	ACAG	2	8	568673	568680	50 %	0 %	25 %	25 %	15605221
12551	NC_000117	TTC	2	6	568732	568737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605221
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12554	NC_000117	TTAA	2	8	568838	568845	50 %	50 %	0 %	0 %	15605221
12555	NC_000117	GCA	2	6	568850	568855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605221
12556	NC_000117	CT	3	6	568939	568944	0 %	50 %	0 %	50 %	15605221
12557	NC_000117	TAA	2	6	568998	569003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605221
12558	NC_000117	CTG	2	6	569007	569012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605221
12559	NC_000117	CTG	2	6	569098	569103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605221
12560	NC_000117	GCT	3	9	569145	569153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605221
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12562	NC_000117	AAT	2	6	569286	569291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605221
12563	NC_000117	A	6	6	569300	569305	100 %	0 %	0 %	0 %	15605221
12564	NC_000117	T	6	6	569317	569322	0 %	100 %	0 %	0 %	15605221
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12572	NC_000117	C	6	6	569949	569954	0 %	0 %	0 %	100 %	15605221
12573	NC_000117	A	7	7	569964	569970	100 %	0 %	0 %	0 %	15605221
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12575	NC_000117	CACT	2	8	570033	570040	25 %	25 %	0 %	50 %	15605221
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12597	NC_000117	T	6	6	571216	571221	0 %	100 %	0 %	0 %	15605221
12598	NC_000117	TTG	2	6	571265	571270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605222
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12606	NC_000117	AATA	2	8	571481	571488	75 %	25 %	0 %	0 %	15605222
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12624	NC_000117	TTC	2	6	572229	572234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605222
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12878	NC_000117	TTC	2	6	582408	582413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605233
12879	NC_000117	AATC	2	8	582426	582433	50 %	25 %	0 %	25 %	15605233
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12881	NC_000117	AGA	2	6	582486	582491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605233
12882	NC_000117	ATC	2	6	582526	582531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605233
12883	NC_000117	CGA	2	6	582574	582579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605233
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12885	NC_000117	TC	3	6	582630	582635	0 %	50 %	0 %	50 %	15605233
12886	NC_000117	CTT	2	6	582701	582706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605233
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12890	NC_000117	TC	3	6	582917	582922	0 %	50 %	0 %	50 %	15605233
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12893	NC_000117	TTTA	2	8	583065	583072	25 %	75 %	0 %	0 %	15605234
12894	NC_000117	GTAC	2	8	583083	583090	25 %	25 %	25 %	25 %	15605234
12895	NC_000117	TAA	2	6	583093	583098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605234
12896	NC_000117	ATCG	2	8	583158	583165	25 %	25 %	25 %	25 %	15605234
12897	NC_000117	AGA	2	6	583225	583230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605234
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12899	NC_000117	GTA	2	6	583249	583254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605234
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12902	NC_000117	TGC	2	6	583279	583284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605234
12903	NC_000117	CGT	2	6	583315	583320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605234
12904	NC_000117	CTA	2	6	583347	583352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605234
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12906	NC_000117	ATA	2	6	583457	583462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605234
12907	NC_000117	CTC	2	6	583473	583478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605234
12908	NC_000117	CCT	2	6	583481	583486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605234
12909	NC_000117	TGT	2	6	583546	583551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605234
12910	NC_000117	CTT	2	6	583560	583565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605234
12911	NC_000117	TGG	2	6	583614	583619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605234
12912	NC_000117	ATG	2	6	583637	583642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605234
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12914	NC_000117	CT	3	6	583725	583730	0 %	50 %	0 %	50 %	15605234
12915	NC_000117	CAT	2	6	583758	583763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605234
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12917	NC_000117	CGA	3	9	583791	583799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605234
12918	NC_000117	CTTT	2	8	583861	583868	0 %	75 %	0 %	25 %	15605234
12919	NC_000117	CATC	2	8	583883	583890	25 %	25 %	0 %	50 %	15605234
12920	NC_000117	GAG	2	6	583905	583910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605234
12921	NC_000117	GT	3	6	583921	583926	0 %	50 %	50 %	0 %	15605234
12922	NC_000117	TAAA	2	8	583938	583945	75 %	25 %	0 %	0 %	15605234
12923	NC_000117	GAA	2	6	584202	584207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605235
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12928	NC_000117	T	6	6	584598	584603	0 %	100 %	0 %	0 %	15605236
12929	NC_000117	ATTTC	2	10	584658	584667	20 %	60 %	0 %	20 %	15605236
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12931	NC_000117	CTT	2	6	584698	584703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605236
12932	NC_000117	GAA	2	6	584841	584846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605236
12933	NC_000117	TTTC	2	8	584859	584866	0 %	75 %	0 %	25 %	15605236
12934	NC_000117	TTCTC	2	10	584895	584904	0 %	60 %	0 %	40 %	15605236
12935	NC_000117	T	6	6	584910	584915	0 %	100 %	0 %	0 %	15605236
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12943	NC_000117	CTTC	2	8	585270	585277	0 %	50 %	0 %	50 %	15605236
12944	NC_000117	CCA	2	6	585281	585286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605236
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12947	NC_000117	CAA	2	6	585567	585572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605236
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12952	NC_000117	CAG	2	6	585803	585808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12953	NC_000117	CTT	2	6	585848	585853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605237
12954	NC_000117	AGC	2	6	585870	585875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12955	NC_000117	AGC	2	6	585879	585884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12956	NC_000117	GCA	2	6	585904	585909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12957	NC_000117	CAG	2	6	585950	585955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12958	NC_000117	CAG	2	6	585977	585982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
12959	NC_000117	TAT	2	6	586004	586009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605237
12960	NC_000117	T	6	6	586048	586053	0 %	100 %	0 %	0 %	15605237
12961	NC_000117	T	8	8	586074	586081	0 %	100 %	0 %	0 %	15605237
12962	NC_000117	CT	3	6	586105	586110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12963	NC_000117	ATT	3	9	586118	586126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605238
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12965	NC_000117	TTTGTT	2	12	586174	586185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15605238
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12967	NC_000117	ACG	2	6	586272	586277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605238
12968	NC_000117	CAA	2	6	586292	586297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605238
12969	NC_000117	AT	3	6	586426	586431	50 %	50 %	0 %	0 %	15605238
12970	NC_000117	ATG	2	6	586477	586482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605238
12971	NC_000117	TCTT	2	8	586568	586575	0 %	75 %	0 %	25 %	15605239
12972	NC_000117	ACA	2	6	586736	586741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
12973	NC_000117	GGTT	2	8	586801	586808	0 %	50 %	50 %	0 %	15605239
12974	NC_000117	TTC	2	6	586844	586849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605239
12975	NC_000117	ATA	2	6	586910	586915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605239
12976	NC_000117	A	6	6	586926	586931	100 %	0 %	0 %	0 %	15605239
12977	NC_000117	AAG	2	6	586983	586988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605239
12978	NC_000117	GAAA	2	8	586997	587004	75 %	0 %	25 %	0 %	15605239
12979	NC_000117	CCT	2	6	587099	587104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605239
12980	NC_000117	CT	3	6	587110	587115	0 %	50 %	0 %	50 %	15605239
12981	NC_000117	AAT	2	6	587122	587127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605239
12982	NC_000117	AAT	2	6	587167	587172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605239
12983	NC_000117	GGAA	2	8	587293	587300	50 %	0 %	50 %	0 %	15605239
12984	NC_000117	AAATA	2	10	587423	587432	80 %	20 %	0 %	0 %	15605239
12985	NC_000117	ACA	2	6	587460	587465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
12986	NC_000117	AAC	2	6	587488	587493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
12987	NC_000117	ATTC	2	8	587497	587504	25 %	50 %	0 %	25 %	15605239
12988	NC_000117	GAC	2	6	587638	587643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605239
12989	NC_000117	AAG	2	6	587644	587649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605239
12990	NC_000117	AAC	2	6	587680	587685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
12991	NC_000117	A	6	6	587727	587732	100 %	0 %	0 %	0 %	15605239
12992	NC_000117	GCAA	2	8	587846	587853	50 %	0 %	25 %	25 %	15605239
12993	NC_000117	T	6	6	587871	587876	0 %	100 %	0 %	0 %	15605239
12994	NC_000117	GCA	2	6	587988	587993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605240
12995	NC_000117	TC	3	6	588052	588057	0 %	50 %	0 %	50 %	15605240
12996	NC_000117	TCTT	2	8	588071	588078	0 %	75 %	0 %	25 %	15605240
12997	NC_000117	GTTGT	2	10	588130	588139	0 %	60 %	40 %	0 %	15605240
12998	NC_000117	TTC	2	6	588143	588148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605240
12999	NC_000117	AGA	2	6	588299	588304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605240
13000	NC_000117	TTC	2	6	588328	588333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605240

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