MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_000117	ATT	2	6	543689	543694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605195
12003	NC_000117	CT	3	6	543718	543723	0 %	50 %	0 %	50 %	15605195
12004	NC_000117	CGAA	2	8	543732	543739	50 %	0 %	25 %	25 %	15605195
12005	NC_000117	GCTC	2	8	543780	543787	0 %	25 %	25 %	50 %	15605195
12006	NC_000117	TCCT	2	8	543851	543858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_000117	GGT	2	6	543904	543909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_000117	CTT	2	6	543948	543953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_000117	T	7	7	543959	543965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_000117	TCT	2	6	544009	544014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_000117	CCT	2	6	544031	544036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605196
12012	NC_000117	TCCC	2	8	544080	544087	0 %	25 %	0 %	75 %	15605196
12013	NC_000117	GAG	2	6	544094	544099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605196
12014	NC_000117	CAA	2	6	544151	544156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605196
12015	NC_000117	A	7	7	544217	544223	100 %	0 %	0 %	0 %	15605196
12016	NC_000117	CTC	2	6	544258	544263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605196
12017	NC_000117	CTA	2	6	544313	544318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605196
12018	NC_000117	CT	5	10	544348	544357	0 %	50 %	0 %	50 %	15605196
12019	NC_000117	T	6	6	544438	544443	0 %	100 %	0 %	0 %	15605196
12020	NC_000117	TGA	2	6	544500	544505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605196
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12043	NC_000117	AGA	2	6	545559	545564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605198
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12047	NC_000117	CTT	2	6	545756	545761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605198
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12051	NC_000117	GAAA	2	8	545862	545869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_000117	GCAA	2	8	545899	545906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12053	NC_000117	ACC	2	6	546029	546034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12055	NC_000117	GAA	2	6	546085	546090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532524896
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12057	NC_000117	A	6	6	546125	546130	100 %	0 %	0 %	0 %	532524896
12058	NC_000117	CTAT	2	8	546150	546157	25 %	50 %	0 %	25 %	532524896
12059	NC_000117	A	6	6	546165	546170	100 %	0 %	0 %	0 %	532524896
12060	NC_000117	GGA	2	6	546173	546178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532524896
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12101	NC_000117	T	7	7	548259	548265	0 %	100 %	0 %	0 %	15605201
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12103	NC_000117	TCCCTC	2	12	548318	548329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12104	NC_000117	CTA	2	6	548340	548345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12109	NC_000117	TGT	2	6	548523	548528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605202
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12125	NC_000117	CA	3	6	549460	549465	50 %	0 %	0 %	50 %	15605202
12126	NC_000117	GAG	2	6	549488	549493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605202
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12130	NC_000117	GAT	2	6	549592	549597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605202
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12364	NC_000117	CTTT	2	8	560017	560024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12368	NC_000117	A	9	9	560096	560104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12499	NC_000117	CTC	2	6	566084	566089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605217
12500	NC_000117	CTT	2	6	566153	566158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605217

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