MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_000117	CT	3	6	521164	521169	0 %	50 %	0 %	50 %	15605175
11502	NC_000117	AAG	2	6	521211	521216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605175
11503	NC_000117	CT	3	6	521257	521262	0 %	50 %	0 %	50 %	15605175
11504	NC_000117	GAG	2	6	521349	521354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605175
11505	NC_000117	CTT	2	6	521426	521431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
11506	NC_000117	AGA	2	6	521491	521496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605175
11507	NC_000117	CTG	2	6	521502	521507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605175
11508	NC_000117	TCA	2	6	521594	521599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605175
11509	NC_000117	TAA	2	6	521629	521634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605175
11510	NC_000117	CCT	2	6	521675	521680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605175
11511	NC_000117	TCT	2	6	521862	521867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
11512	NC_000117	TAC	2	6	521878	521883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605175
11513	NC_000117	TGT	2	6	522068	522073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605175
11514	NC_000117	AGC	2	6	522079	522084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605175
11515	NC_000117	TTC	2	6	522085	522090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
11516	NC_000117	GCC	2	6	522362	522367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605175
11517	NC_000117	AACT	2	8	522487	522494	50 %	25 %	0 %	25 %	15605175
11518	NC_000117	AGC	2	6	522505	522510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605175
11519	NC_000117	AAC	2	6	522533	522538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605175
11520	NC_000117	GA	3	6	522576	522581	50 %	0 %	50 %	0 %	15605175
11521	NC_000117	CAA	2	6	522594	522599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605175
11522	NC_000117	AAG	2	6	522660	522665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605175
11523	NC_000117	CTC	2	6	522676	522681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605175
11524	NC_000117	CTTC	2	8	522687	522694	0 %	50 %	0 %	50 %	15605175
11525	NC_000117	TGT	2	6	522704	522709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605175
11526	NC_000117	ATAA	2	8	522908	522915	75 %	25 %	0 %	0 %	15605175
11527	NC_000117	TTG	2	6	522918	522923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605175
11528	NC_000117	AAAG	2	8	522977	522984	75 %	0 %	25 %	0 %	15605175
11529	NC_000117	AAG	2	6	522999	523004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605175
11530	NC_000117	AAC	2	6	523027	523032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605175
11531	NC_000117	TC	3	6	523035	523040	0 %	50 %	0 %	50 %	15605175
11532	NC_000117	ACA	2	6	523061	523066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605175
11533	NC_000117	AATA	2	8	523120	523127	75 %	25 %	0 %	0 %	15605175
11534	NC_000117	TCT	2	6	523136	523141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
11535	NC_000117	TGC	2	6	523184	523189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605175
11536	NC_000117	CAAAGC	2	12	523366	523377	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15605175
11537	NC_000117	AAT	3	9	523387	523395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605175
11538	NC_000117	AGC	2	6	523484	523489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_000117	GAAG	2	8	523492	523499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_000117	AT	3	6	523518	523523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_000117	AAAG	2	8	523531	523538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_000117	T	6	6	523579	523584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_000117	TTGGA	2	10	523602	523611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_000117	T	6	6	523625	523630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_000117	ACA	2	6	523633	523638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_000117	AACC	2	8	523666	523673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_000117	A	7	7	523737	523743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_000117	T	6	6	523759	523764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_000117	A	7	7	523810	523816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_000117	AGA	2	6	523863	523868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605176
11551	NC_000117	AAAG	2	8	523876	523883	75 %	0 %	25 %	0 %	15605176
11552	NC_000117	CAA	2	6	523932	523937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605176
11553	NC_000117	GAACT	2	10	524089	524098	40 %	20 %	20 %	20 %	15605176
11554	NC_000117	TTG	2	6	524120	524125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605176
11555	NC_000117	ACTC	2	8	524157	524164	25 %	25 %	0 %	50 %	15605176
11556	NC_000117	TCA	2	6	524193	524198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_000117	A	7	7	524203	524209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_000117	CTAA	2	8	524224	524231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_000117	AAT	2	6	524248	524253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_000117	ACTT	2	8	524258	524265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_000117	GCT	2	6	524349	524354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_000117	CAAAA	2	10	524368	524377	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11563	NC_000117	AGA	2	6	524426	524431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_000117	ATA	2	6	524460	524465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_000117	CTA	2	6	524534	524539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_000117	CTTTAG	2	12	524644	524655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15605177
11567	NC_000117	TCCC	2	8	524697	524704	0 %	25 %	0 %	75 %	15605177
11568	NC_000117	CAT	3	9	524717	524725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605177
11569	NC_000117	TCG	2	6	524735	524740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605177
11570	NC_000117	TTG	2	6	524821	524826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605177
11571	NC_000117	ATT	2	6	524915	524920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605177
11572	NC_000117	GCA	2	6	524944	524949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605177
11573	NC_000117	CT	3	6	524952	524957	0 %	50 %	0 %	50 %	15605177
11574	NC_000117	ACA	2	6	525028	525033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605177
11575	NC_000117	CCT	2	6	525043	525048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605177
11576	NC_000117	ATTA	2	8	525090	525097	50 %	50 %	0 %	0 %	15605177
11577	NC_000117	A	7	7	525156	525162	100 %	0 %	0 %	0 %	15605177
11578	NC_000117	CAA	2	6	525372	525377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605177
11579	NC_000117	TAAA	2	8	525395	525402	75 %	25 %	0 %	0 %	15605177
11580	NC_000117	GTC	2	6	525461	525466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605178
11581	NC_000117	TTC	2	6	525474	525479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11582	NC_000117	TTC	2	6	525495	525500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11583	NC_000117	CTT	2	6	525542	525547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11584	NC_000117	TCC	2	6	525548	525553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605178
11585	NC_000117	TTTC	2	8	525612	525619	0 %	75 %	0 %	25 %	15605178
11586	NC_000117	TTCT	2	8	525722	525729	0 %	75 %	0 %	25 %	15605178
11587	NC_000117	CTT	2	6	525730	525735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11588	NC_000117	GTT	2	6	525805	525810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605178
11589	NC_000117	TCC	2	6	525846	525851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605178
11590	NC_000117	TGG	2	6	525899	525904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605178
11591	NC_000117	ACA	2	6	525923	525928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605178
11592	NC_000117	CTT	2	6	525952	525957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11593	NC_000117	A	6	6	525974	525979	100 %	0 %	0 %	0 %	15605178
11594	NC_000117	AGT	2	6	526012	526017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605178
11595	NC_000117	ATCT	2	8	526042	526049	25 %	50 %	0 %	25 %	15605178
11596	NC_000117	CTT	2	6	526058	526063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11597	NC_000117	CAG	2	6	526207	526212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605178
11598	NC_000117	GGA	2	6	526229	526234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605178
11599	NC_000117	CTT	2	6	526259	526264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605178
11600	NC_000117	TCC	2	6	526287	526292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605178
11601	NC_000117	GAT	2	6	526320	526325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605178
11602	NC_000117	CAGGAA	2	12	526346	526357	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15605179
11603	NC_000117	AAG	2	6	526463	526468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605179
11604	NC_000117	AGA	2	6	526476	526481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605179
11605	NC_000117	CCT	2	6	526495	526500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605179
11606	NC_000117	TTTC	2	8	526502	526509	0 %	75 %	0 %	25 %	15605179
11607	NC_000117	AAG	2	6	526580	526585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605179
11608	NC_000117	TCT	2	6	526733	526738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605179
11609	NC_000117	ACG	2	6	526767	526772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605179
11610	NC_000117	CCTC	2	8	526782	526789	0 %	25 %	0 %	75 %	15605179
11611	NC_000117	CAA	2	6	526849	526854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605179
11612	NC_000117	AG	3	6	526855	526860	50 %	0 %	50 %	0 %	15605179
11613	NC_000117	AGA	2	6	527022	527027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605180
11614	NC_000117	AAGC	2	8	527044	527051	50 %	0 %	25 %	25 %	15605180
11615	NC_000117	TAT	2	6	527072	527077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605180
11616	NC_000117	CAT	2	6	527108	527113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605180
11617	NC_000117	AGCT	2	8	527146	527153	25 %	25 %	25 %	25 %	15605180
11618	NC_000117	ATTC	2	8	527173	527180	25 %	50 %	0 %	25 %	15605180
11619	NC_000117	TGC	2	6	527237	527242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605180
11620	NC_000117	GCT	2	6	527253	527258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605180
11621	NC_000117	GGAG	2	8	527277	527284	25 %	0 %	75 %	0 %	15605180
11622	NC_000117	TCA	2	6	527287	527292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605180
11623	NC_000117	TCA	2	6	527330	527335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605180
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11625	NC_000117	A	6	6	527520	527525	100 %	0 %	0 %	0 %	15605180
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11995	NC_000117	CCCT	2	8	543446	543453	0 %	25 %	0 %	75 %	15605195
11996	NC_000117	CTA	2	6	543531	543536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605195
11997	NC_000117	TCCC	2	8	543563	543570	0 %	25 %	0 %	75 %	15605195
11998	NC_000117	AGA	2	6	543585	543590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605195
11999	NC_000117	TCC	2	6	543593	543598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605195
12000	NC_000117	TAC	2	6	543610	543615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605195

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