MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000117	CTT	2	6	498570	498575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11002	NC_000117	CGT	3	9	498576	498584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605156
11003	NC_000117	CTC	2	6	498586	498591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605156
11004	NC_000117	GAA	2	6	498595	498600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605156
11005	NC_000117	TC	3	6	498609	498614	0 %	50 %	0 %	50 %	15605156
11006	NC_000117	CTC	3	9	498708	498716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605156
11007	NC_000117	TTC	3	9	498733	498741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11008	NC_000117	GAA	2	6	498770	498775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605156
11009	NC_000117	CGT	2	6	498806	498811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605156
11010	NC_000117	GTC	2	6	498851	498856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605156
11011	NC_000117	AGG	2	6	498883	498888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605156
11012	NC_000117	AAG	2	6	498952	498957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605156
11013	NC_000117	GTT	2	6	499014	499019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605156
11014	NC_000117	TCT	2	6	499046	499051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11015	NC_000117	AAACTG	2	12	499060	499071	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605156
11016	NC_000117	ATT	2	6	499072	499077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605156
11017	NC_000117	ATG	2	6	499091	499096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605156
11018	NC_000117	T	6	6	499239	499244	0 %	100 %	0 %	0 %	15605156
11019	NC_000117	TCT	2	6	499266	499271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11020	NC_000117	TTC	2	6	499321	499326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11021	NC_000117	TC	4	8	499415	499422	0 %	50 %	0 %	50 %	15605156
11022	NC_000117	TCA	2	6	499424	499429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605156
11023	NC_000117	TAA	2	6	499465	499470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605156
11024	NC_000117	GTC	2	6	499496	499501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605156
11025	NC_000117	CT	4	8	499540	499547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_000117	ACC	2	6	499593	499598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605157
11027	NC_000117	A	6	6	499662	499667	100 %	0 %	0 %	0 %	15605157
11028	NC_000117	CTA	2	6	499682	499687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605157
11029	NC_000117	AC	3	6	499693	499698	50 %	0 %	0 %	50 %	15605157
11030	NC_000117	ATC	2	6	499825	499830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605157
11031	NC_000117	CTT	2	6	499831	499836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605157
11032	NC_000117	AAGA	2	8	499892	499899	75 %	0 %	25 %	0 %	15605157
11033	NC_000117	CTTA	2	8	499921	499928	25 %	50 %	0 %	25 %	15605157
11034	NC_000117	A	6	6	499972	499977	100 %	0 %	0 %	0 %	15605157
11035	NC_000117	T	6	6	500026	500031	0 %	100 %	0 %	0 %	15605157
11036	NC_000117	AGA	2	6	500236	500241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605157
11037	NC_000117	AGAGA	2	10	500375	500384	60 %	0 %	40 %	0 %	15605157
11038	NC_000117	TCGA	2	8	500438	500445	25 %	25 %	25 %	25 %	15605158
11039	NC_000117	AAT	2	6	500498	500503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605158
11040	NC_000117	TCC	2	6	500570	500575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605158
11041	NC_000117	GC	3	6	500600	500605	0 %	0 %	50 %	50 %	15605158
11042	NC_000117	CA	3	6	500638	500643	50 %	0 %	0 %	50 %	15605158
11043	NC_000117	TGC	2	6	500666	500671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605158
11044	NC_000117	AAC	2	6	500681	500686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605158
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11046	NC_000117	ACG	2	6	500870	500875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605158
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11049	NC_000117	CAT	2	6	500918	500923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605158
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11051	NC_000117	ATA	2	6	501119	501124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605159
11052	NC_000117	CTT	2	6	501132	501137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605159
11053	NC_000117	TCT	2	6	501272	501277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605159
11054	NC_000117	AAT	2	6	501313	501318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605159
11055	NC_000117	CTT	2	6	501441	501446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605159
11056	NC_000117	AGC	2	6	501463	501468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605159
11057	NC_000117	GCC	2	6	501487	501492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605159
11058	NC_000117	CAT	2	6	501493	501498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605159
11059	NC_000117	T	6	6	501535	501540	0 %	100 %	0 %	0 %	15605159
11060	NC_000117	CGT	3	9	501583	501591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605159
11061	NC_000117	TCT	2	6	501623	501628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605159
11062	NC_000117	AC	3	6	501636	501641	50 %	0 %	0 %	50 %	15605159
11063	NC_000117	TCT	2	6	501698	501703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605159
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11065	NC_000117	AAT	2	6	501815	501820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605159
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11067	NC_000117	TAA	2	6	502060	502065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605159
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11069	NC_000117	GTAA	2	8	502217	502224	50 %	25 %	25 %	0 %	15605159
11070	NC_000117	AGA	2	6	502252	502257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605159
11071	NC_000117	GAT	2	6	502350	502355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605159
11072	NC_000117	ATG	2	6	502359	502364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605159
11073	NC_000117	AATCT	2	10	502528	502537	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11074	NC_000117	TGA	2	6	502540	502545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_000117	ATTT	2	8	502575	502582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_000117	TAACTA	2	12	502583	502594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11077	NC_000117	AAGAAA	2	12	502596	502607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_000117	AAG	2	6	502716	502721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_000117	CTA	2	6	502726	502731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_000117	A	6	6	502734	502739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_000117	CTTCT	2	10	502741	502750	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11082	NC_000117	A	8	8	502755	502762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_000117	ATCC	2	8	502829	502836	25 %	25 %	0 %	50 %	15605160
11084	NC_000117	CTG	2	6	502853	502858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605160
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11087	NC_000117	CTT	2	6	503057	503062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605160
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11090	NC_000117	CTC	2	6	503160	503165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605160
11091	NC_000117	CTCG	2	8	503188	503195	0 %	25 %	25 %	50 %	15605160
11092	NC_000117	CT	3	6	503208	503213	0 %	50 %	0 %	50 %	15605160
11093	NC_000117	TCC	2	6	503233	503238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605160
11094	NC_000117	TTC	2	6	503291	503296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605160
11095	NC_000117	TAT	2	6	503307	503312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605160
11096	NC_000117	TCGT	2	8	503330	503337	0 %	50 %	25 %	25 %	15605160
11097	NC_000117	GA	3	6	503390	503395	50 %	0 %	50 %	0 %	15605160
11098	NC_000117	GCA	2	6	503401	503406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605160
11099	NC_000117	CTC	2	6	503429	503434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605160
11100	NC_000117	T	6	6	503447	503452	0 %	100 %	0 %	0 %	15605160
11101	NC_000117	TATT	2	8	503491	503498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_000117	AAG	2	6	503516	503521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_000117	CTT	3	9	503594	503602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605161
11104	NC_000117	TTC	2	6	503606	503611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605161
11105	NC_000117	AT	3	6	503626	503631	50 %	50 %	0 %	0 %	15605161
11106	NC_000117	ATT	2	6	503704	503709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605161
11107	NC_000117	TGT	2	6	503751	503756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605161
11108	NC_000117	GGA	2	6	503809	503814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605161
11109	NC_000117	TCTA	2	8	503861	503868	25 %	50 %	0 %	25 %	15605161
11110	NC_000117	AAG	2	6	503870	503875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605161
11111	NC_000117	TTC	2	6	503990	503995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605161
11112	NC_000117	TAT	2	6	504093	504098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605161
11113	NC_000117	TCT	2	6	504137	504142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605162
11114	NC_000117	T	7	7	504215	504221	0 %	100 %	0 %	0 %	15605162
11115	NC_000117	CAAA	2	8	504226	504233	75 %	0 %	0 %	25 %	15605162
11116	NC_000117	AAAG	2	8	504234	504241	75 %	0 %	25 %	0 %	15605162
11117	NC_000117	CTT	2	6	504242	504247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605162
11118	NC_000117	CTT	2	6	504257	504262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605162
11119	NC_000117	TTG	2	6	504276	504281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605162
11120	NC_000117	AGAAT	2	10	504419	504428	60 %	20 %	20 %	0 %	15605162
11121	NC_000117	TGT	2	6	504460	504465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605162
11122	NC_000117	A	6	6	504607	504612	100 %	0 %	0 %	0 %	15605162
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11250	NC_000117	GA	3	6	510470	510475	50 %	0 %	50 %	0 %	15605167
11251	NC_000117	GGA	2	6	510481	510486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605167
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11262	NC_000117	A	7	7	511114	511120	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
11263	NC_000117	CAAA	2	8	511121	511128	75 %	0 %	0 %	25 %	15605167
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11272	NC_000117	ATC	2	6	511310	511315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11341	NC_000117	ATA	2	6	514235	514240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11342	NC_000117	ACAA	2	8	514273	514280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11343	NC_000117	AATA	2	8	514296	514303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11347	NC_000117	ACTA	2	8	514345	514352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11348	NC_000117	TA	3	6	514351	514356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11385	NC_000117	ATGAA	2	10	516161	516170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11386	NC_000117	AG	3	6	516249	516254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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