MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_000117	CA	3	6	476217	476222	50 %	0 %	0 %	50 %	15605138
10502	NC_000117	CGG	2	6	476242	476247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605138
10503	NC_000117	GCA	2	6	476265	476270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10504	NC_000117	TCT	2	6	476337	476342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10505	NC_000117	AGC	2	6	476366	476371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10506	NC_000117	TAA	2	6	476399	476404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605138
10507	NC_000117	A	6	6	476508	476513	100 %	0 %	0 %	0 %	15605138
10508	NC_000117	CTG	2	6	476582	476587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10509	NC_000117	TTG	2	6	476641	476646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605138
10510	NC_000117	AAG	2	6	476650	476655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605138
10511	NC_000117	AAC	2	6	476718	476723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605138
10512	NC_000117	CTC	2	6	476732	476737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605138
10513	NC_000117	CAA	2	6	476752	476757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605138
10514	NC_000117	CTG	2	6	476770	476775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10515	NC_000117	GCT	3	9	476778	476786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10516	NC_000117	AGC	2	6	476795	476800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10517	NC_000117	GCA	2	6	476802	476807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
10518	NC_000117	CAT	2	6	476815	476820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605138
10519	NC_000117	GTA	2	6	476847	476852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605138
10520	NC_000117	GGA	2	6	476853	476858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605138
10521	NC_000117	CTAT	2	8	476860	476867	25 %	50 %	0 %	25 %	15605138
10522	NC_000117	TC	3	6	476884	476889	0 %	50 %	0 %	50 %	15605138
10523	NC_000117	TCCC	2	8	476939	476946	0 %	25 %	0 %	75 %	15605138
10524	NC_000117	ATC	2	6	476948	476953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605138
10525	NC_000117	AGG	2	6	476966	476971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605138
10526	NC_000117	CCT	2	6	477022	477027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605138
10527	NC_000117	ACA	2	6	477069	477074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605138
10528	NC_000117	GAG	2	6	477088	477093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605138
10529	NC_000117	CTT	2	6	477172	477177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10530	NC_000117	GGA	2	6	477219	477224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605138
10531	NC_000117	TC	3	6	477259	477264	0 %	50 %	0 %	50 %	15605138
10532	NC_000117	A	6	6	477364	477369	100 %	0 %	0 %	0 %	15605138
10533	NC_000117	GAAA	2	8	477399	477406	75 %	0 %	25 %	0 %	15605138
10534	NC_000117	TAA	2	6	477413	477418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605138
10535	NC_000117	AAT	2	6	477459	477464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605138
10536	NC_000117	TCAA	2	8	477472	477479	50 %	25 %	0 %	25 %	15605138
10537	NC_000117	ATG	2	6	477493	477498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605138
10538	NC_000117	AAATAC	2	12	477608	477619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15605138
10539	NC_000117	CTT	2	6	477693	477698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10540	NC_000117	CTT	2	6	477700	477705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10541	NC_000117	CAA	2	6	477725	477730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605138
10542	NC_000117	GTA	2	6	477775	477780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605138
10543	NC_000117	CT	4	8	477798	477805	0 %	50 %	0 %	50 %	15605138
10544	NC_000117	TG	3	6	477843	477848	0 %	50 %	50 %	0 %	15605138
10545	NC_000117	A	7	7	477861	477867	100 %	0 %	0 %	0 %	15605138
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10550	NC_000117	ATTA	2	8	478076	478083	50 %	50 %	0 %	0 %	15605138
10551	NC_000117	CTC	2	6	478174	478179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605138
10552	NC_000117	TCT	2	6	478192	478197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10553	NC_000117	CTC	2	6	478198	478203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605138
10554	NC_000117	GGA	2	6	478242	478247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605138
10555	NC_000117	CAG	2	6	478256	478261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
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10557	NC_000117	GCA	2	6	478293	478298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605138
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10565	NC_000117	CTC	2	6	478777	478782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605138
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10569	NC_000117	A	7	7	478902	478908	100 %	0 %	0 %	0 %	15605138
10570	NC_000117	TTCCT	2	10	479011	479020	0 %	60 %	0 %	40 %	15605138
10571	NC_000117	ACA	3	9	479061	479069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605138
10572	NC_000117	GAAA	2	8	479088	479095	75 %	0 %	25 %	0 %	15605138
10573	NC_000117	TTC	2	6	479171	479176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
10574	NC_000117	GAT	2	6	479265	479270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605138
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10577	NC_000117	CTGT	2	8	479395	479402	0 %	50 %	25 %	25 %	15605138
10578	NC_000117	CT	3	6	479515	479520	0 %	50 %	0 %	50 %	15605138
10579	NC_000117	ACTAT	2	10	479527	479536	40 %	40 %	0 %	20 %	15605138
10580	NC_000117	TCT	2	6	479590	479595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605138
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10582	NC_000117	T	9	9	479707	479715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_000117	GCT	2	6	479945	479950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605139
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10595	NC_000117	ACTA	2	8	480127	480134	50 %	25 %	0 %	25 %	15605139
10596	NC_000117	CT	5	10	480151	480160	0 %	50 %	0 %	50 %	15605139
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10603	NC_000117	GGT	3	9	480410	480418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605139
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10605	NC_000117	TGC	2	6	480481	480486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605139
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10609	NC_000117	CGA	2	6	480682	480687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605139
10610	NC_000117	GGT	3	9	480701	480709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605139
10611	NC_000117	GGA	3	9	480872	480880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605139
10612	NC_000117	ACT	2	6	480932	480937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605139
10613	NC_000117	GGT	3	9	480989	480997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605139
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10618	NC_000117	AGT	2	6	481165	481170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605139
10619	NC_000117	AAAT	2	8	481182	481189	75 %	25 %	0 %	0 %	15605139
10620	NC_000117	ATCA	2	8	481325	481332	50 %	25 %	0 %	25 %	15605139
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10995	NC_000117	GGA	2	6	498219	498224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605155
10996	NC_000117	TTG	2	6	498301	498306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605155
10997	NC_000117	GAAA	2	8	498359	498366	75 %	0 %	25 %	0 %	15605155
10998	NC_000117	ACT	2	6	498446	498451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605155
10999	NC_000117	CTT	2	6	498526	498531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156
11000	NC_000117	TTC	2	6	498551	498556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605156

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