MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_000117	TAG	2	6	409679	409684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605081
9003	NC_000117	TCA	2	6	409741	409746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605081
9004	NC_000117	ACT	2	6	409758	409763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605081
9005	NC_000117	ACA	2	6	409803	409808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605081
9006	NC_000117	CTT	2	6	409863	409868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605082
9007	NC_000117	TCA	2	6	409874	409879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605082
9008	NC_000117	TCT	2	6	409883	409888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605082
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9010	NC_000117	TAT	2	6	410011	410016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605082
9011	NC_000117	TCTCT	2	10	410100	410109	0 %	60 %	0 %	40 %	15605082
9012	NC_000117	AGA	2	6	410209	410214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605082
9013	NC_000117	AGA	2	6	410263	410268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605082
9014	NC_000117	TC	3	6	410286	410291	0 %	50 %	0 %	50 %	15605082
9015	NC_000117	CAC	2	6	410292	410297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605082
9016	NC_000117	TC	3	6	410298	410303	0 %	50 %	0 %	50 %	15605082
9017	NC_000117	TA	3	6	410318	410323	50 %	50 %	0 %	0 %	15605082
9018	NC_000117	ATC	2	6	410325	410330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605082
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9022	NC_000117	ATC	2	6	410636	410641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605083
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9025	NC_000117	GAA	2	6	410788	410793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605083
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9028	NC_000117	ATA	2	6	411155	411160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_000117	T	6	6	411241	411246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_000117	ATGC	2	8	411248	411255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9031	NC_000117	CT	4	8	411285	411292	0 %	50 %	0 %	50 %	15605084
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9037	NC_000117	A	6	6	411421	411426	100 %	0 %	0 %	0 %	15605084
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9039	NC_000117	CACT	2	8	411499	411506	25 %	25 %	0 %	50 %	15605084
9040	NC_000117	CT	3	6	411517	411522	0 %	50 %	0 %	50 %	15605084
9041	NC_000117	A	6	6	411601	411606	100 %	0 %	0 %	0 %	15605084
9042	NC_000117	T	8	8	411632	411639	0 %	100 %	0 %	0 %	15605084
9043	NC_000117	AAT	2	6	411640	411645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605084
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9045	NC_000117	CT	3	6	411751	411756	0 %	50 %	0 %	50 %	15605084
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9050	NC_000117	TAA	2	6	411969	411974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_000117	AGA	2	6	411997	412002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_000117	TTA	2	6	412036	412041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_000117	TGA	2	6	412047	412052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9060	NC_000117	AAAC	2	8	412744	412751	75 %	0 %	0 %	25 %	15605085
9061	NC_000117	TAC	2	6	412801	412806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605085
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9110	NC_000117	GGCTCT	2	12	415468	415479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605088
9111	NC_000117	CT	3	6	415489	415494	0 %	50 %	0 %	50 %	15605088
9112	NC_000117	CAT	2	6	415586	415591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605088
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