MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_000117	GAA	2	6	318643	318648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605007
7002	NC_000117	A	6	6	318647	318652	100 %	0 %	0 %	0 %	15605007
7003	NC_000117	A	6	6	318753	318758	100 %	0 %	0 %	0 %	15605007
7004	NC_000117	GAA	2	6	318819	318824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605007
7005	NC_000117	GATG	2	8	318839	318846	25 %	25 %	50 %	0 %	15605007
7006	NC_000117	TTAT	2	8	318873	318880	25 %	75 %	0 %	0 %	15605007
7007	NC_000117	TGA	2	6	318881	318886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
7008	NC_000117	TTG	2	6	318898	318903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605007
7009	NC_000117	GCT	2	6	318912	318917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605007
7010	NC_000117	GAG	2	6	318964	318969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605007
7011	NC_000117	A	6	6	319051	319056	100 %	0 %	0 %	0 %	15605007
7012	NC_000117	GTT	2	6	319059	319064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605007
7013	NC_000117	CCT	2	6	319068	319073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605007
7014	NC_000117	A	6	6	319113	319118	100 %	0 %	0 %	0 %	15605007
7015	NC_000117	TCA	2	6	319141	319146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605007
7016	NC_000117	TGA	2	6	319148	319153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
7017	NC_000117	TGC	2	6	319163	319168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605007
7018	NC_000117	CT	3	6	319176	319181	0 %	50 %	0 %	50 %	15605007
7019	NC_000117	TTC	2	6	319204	319209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605007
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7021	NC_000117	GCT	2	6	319362	319367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605007
7022	NC_000117	TGA	2	6	319376	319381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
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7026	NC_000117	TGA	2	6	319460	319465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
7027	NC_000117	AGT	2	6	319481	319486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
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7029	NC_000117	CGT	2	6	319620	319625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605007
7030	NC_000117	TCCT	2	8	319665	319672	0 %	50 %	0 %	50 %	15605007
7031	NC_000117	GCA	2	6	319712	319717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605007
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7035	NC_000117	CGC	2	6	319869	319874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605007
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7037	NC_000117	TGA	2	6	319895	319900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605007
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7040	NC_000117	TTA	2	6	320095	320100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605007
7041	NC_000117	TGC	2	6	320114	320119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605007
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7071	NC_000117	CAA	2	6	321570	321575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605008
7072	NC_000117	CAT	2	6	321644	321649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_000117	A	7	7	321656	321662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_000117	A	7	7	321670	321676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_000117	GCC	2	6	321689	321694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_000117	TCAAT	2	10	321725	321734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7079	NC_000117	A	7	7	321768	321774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_000117	TCA	2	6	321840	321845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605009
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7094	NC_000117	TA	3	6	322541	322546	50 %	50 %	0 %	0 %	15605009
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7099	NC_000117	A	6	6	322751	322756	100 %	0 %	0 %	0 %	15605009
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7108	NC_000117	TAAA	2	8	323099	323106	75 %	25 %	0 %	0 %	15605009
7109	NC_000117	ACG	2	6	323127	323132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605009
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7119	NC_000117	AAAAAG	2	12	323533	323544	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_000117	CCT	4	12	323617	323628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605010
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7123	NC_000117	AC	3	6	323718	323723	50 %	0 %	0 %	50 %	15605010
7124	NC_000117	AAG	2	6	323759	323764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605010
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7126	NC_000117	TGA	2	6	323803	323808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605010
7127	NC_000117	TAT	2	6	323834	323839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605010
7128	NC_000117	TTGG	2	8	323890	323897	0 %	50 %	50 %	0 %	15605010
7129	NC_000117	TCA	2	6	323926	323931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605010
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7141	NC_000117	GCT	2	6	324416	324421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605010
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7149	NC_000117	T	7	7	324782	324788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7373	NC_000117	CA	3	6	334390	334395	50 %	0 %	0 %	50 %	15605022
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