MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1051L

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187143	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187143	CAA	2	6	78	83	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187143	ATT	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187143	A	8	8	216	223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187143	TTA	2	6	315	320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187143	TCTT	2	8	350	357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187143	TA	3	6	367	372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187143	TA	3	6	391	396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187143	TAA	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187143	AAAT	2	8	521	528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187143	CTCTT	2	10	557	566	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NT_187143	TAT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187143	AGG	2	6	624	629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187143	TAAG	2	8	1804	1811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187143	TA	3	6	1906	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187143	ATAA	2	8	1940	1947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187143	TAAT	2	8	1990	1997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187143	TAA	3	9	2052	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187143	TTTTA	2	10	2062	2071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187143	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187143	ATA	2	6	2109	2114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187143	GAA	3	9	2134	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187143	AAT	3	9	2150	2158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187143	TTTA	2	8	2162	2169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187143	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187143	AGAA	2	8	2211	2218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187143	AAT	2	6	2239	2244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187143	GTA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187143	T	6	6	2260	2265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187143	CAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187143	A	6	6	2326	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187143	TAA	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187143	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187143	AG	3	6	2418	2423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187143	ATA	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187143	GATAA	2	10	2486	2495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187143	TGA	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187143	TGC	2	6	2560	2565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187143	TAA	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187143	TAG	2	6	2631	2636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187143	GAT	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187143	TAA	2	6	2755	2760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187143	CTGATG	2	12	2772	2783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NT_187143	AAAG	2	8	2785	2792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187143	CAG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187143	GCT	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187143	AAT	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187143	AGG	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187143	GGT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187143	CTG	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187143	AGC	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187143	AAG	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187143	TGA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187143	CTA	3	9	3192	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187143	T	7	7	3209	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187143	CTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187143	GTT	2	6	3290	3295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187143	TAG	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187143	AGT	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187143	AAC	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187143	CCT	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NT_187143	TGC	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187143	CTC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NT_187143	T	7	7	3679	3685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187143	TGA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187143	T	7	7	3779	3785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187143	TAG	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187143	CTT	2	6	3809	3814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187143	ATT	2	6	3897	3902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187143	ATAA	2	8	3919	3926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187143	ATT	3	9	3931	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187143	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187143	TTA	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187143	GTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187143	ATC	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187143	GCT	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187143	GCA	2	6	4237	4242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187143	ACC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NT_187143	CCT	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187143	ATT	2	6	4335	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187143	CCA	2	6	4351	4356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_187143	CTG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187143	CTTT	2	8	4478	4485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NT_187143	GCATCA	2	12	4486	4497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187143	ATT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187143	ATC	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187143	CTA	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187143	TTA	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187143	CAG	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187143	TCA	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187143	TAT	2	6	4773	4778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187143	TAT	2	6	4790	4795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187143	TC	3	6	4846	4851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NT_187143	CAA	2	6	4862	4867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187143	TTA	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187143	T	6	6	4939	4944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187143	ATG	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187143	A	6	6	5005	5010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187143	TAC	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187143	TAT	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187143	CT	3	6	5047	5052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NT_187143	CCA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NT_187143	ATAA	2	8	5100	5107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187143	ATT	3	9	5112	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187143	TTC	3	9	5128	5136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187143	ATT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187143	TAT	2	6	5156	5161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187143	A	6	6	5162	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187143	AAATA	2	10	5196	5205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187143	TTA	3	9	5210	5218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187143	ATTA	2	8	5273	5280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187143	ATT	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187143	TA	3	6	5359	5364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187143	CTTA	2	8	5459	5466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NT_187143	TTA	2	6	5552	5557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187143	GTA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187143	CTT	2	6	5622	5627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187143	TAGT	2	8	5670	5677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187143	GT	3	6	5676	5681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187143	CTG	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187143	CAT	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187143	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187143	TAGCAA	2	12	5838	5849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NT_187143	TGC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187143	T	6	6	5956	5961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187143	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187143	CAG	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187143	AGT	2	6	5980	5985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187143	CAT	2	6	6009	6014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187143	CTC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NT_187143	TAT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187143	CTT	2	6	6069	6074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187143	CAG	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187143	TAT	2	6	6217	6222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187143	TAT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187143	TC	3	6	6290	6295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NT_187143	TTA	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187143	T	6	6	6383	6388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187143	ATG	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187143	A	6	6	6449	6454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187143	ATAA	2	8	6539	6546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187143	ATT	3	9	6551	6559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187143	TTA	2	6	6590	6595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187143	ATAAAT	2	12	6610	6621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187143	TTTTA	2	10	6655	6664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187143	ATTA	2	8	6692	6699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187143	TAA	2	6	6713	6718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187143	A	7	7	6723	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187143	TAA	2	6	6806	6811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187143	A	6	6	6831	6836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187143	ATTTT	2	10	6856	6865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187143	TAC	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NT_187143	TTAA	2	8	6969	6976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187143	ACAAAT	2	12	7036	7047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NT_187143	ATA	2	6	7051	7056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187143	ATA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NT_187143	CAT	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NT_187143	TGC	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NT_187143	CTA	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NT_187143	GTA	2	6	12293	12298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NT_187143	AGC	2	6	12321	12326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NT_187143	T	6	6	12343	12348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NT_187143	AT	3	6	12383	12388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NT_187143	GAT	2	6	12445	12450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NT_187143	GTT	2	6	12526	12531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NT_187143	AAG	2	6	12534	12539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NT_187143	TAC	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NT_187143	TTA	2	6	12582	12587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NT_187143	TAGTGC	2	12	12589	12600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
283	NT_187143	AGCT	2	8	12633	12640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NT_187143	GAA	2	6	12704	12709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NT_187143	AAT	2	6	12745	12750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NT_187143	CTA	2	6	12759	12764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NT_187143	CTG	2	6	12801	12806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NT_187143	TGCTAA	2	12	12808	12819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
289	NT_187143	AAT	2	6	12832	12837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NT_187143	GCT	2	6	12851	12856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NT_187143	TGA	2	6	12880	12885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NT_187143	ATAA	2	8	21439	21446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NT_187143	TAAGT	2	10	21481	21490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
437	NT_187143	CTA	2	6	21522	21527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NT_187143	GATAA	2	10	21628	21637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.