MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment a

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167350	CTTAA	2	10	1165	1174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NT_167350	CTA	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_167350	A	6	6	1979	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_167350	ACC	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_167350	AATA	2	8	2828	2835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167350	A	7	7	2857	2863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167350	ATT	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167350	TAA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167350	TAA	2	6	2885	2890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167350	TA	3	6	2912	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167350	A	6	6	2920	2925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167350	T	6	6	2961	2966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167350	TA	4	8	2980	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167350	AGA	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167350	ATT	2	6	3841	3846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167350	AATTAA	2	12	3852	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167350	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167350	A	7	7	3910	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167350	TAA	2	6	3954	3959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167350	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167350	ATT	3	9	3975	3983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167350	TAA	2	6	3984	3989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167350	TTAA	2	8	4005	4012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167350	TTAA	2	8	4034	4041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167350	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_167350	TA	3	6	4144	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167350	GTTTA	2	10	4747	4756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167350	T	7	7	5387	5393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_167350	T	6	6	5609	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167350	AT	3	6	5627	5632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167350	T	9	9	5678	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167350	TAA	2	6	5702	5707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167350	T	6	6	5744	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167350	TA	3	6	5761	5766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167350	TAT	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_167350	TTC	2	6	5806	5811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_167350	T	6	6	5828	5833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167350	AATT	2	8	7258	7265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167350	ATAA	2	8	7294	7301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167350	TCT	2	6	8531	8536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_167350	TCA	2	6	8552	8557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.